RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 CERS4Q9HA82 394 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF287Q9HBT7 754 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 SCUBE2Q9NQ36 999 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 RCAN3Q9UKA8 241 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 Q9Y3F1 56 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 EPOPA6NHQ4 379 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 ZBBXA8MT70 800 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 ZEB2O60315 1214 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 NOVP48745 357 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 DUSP28Q4G0W2 176 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 KRT40Q6A162 431 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 DEFB128Q7Z7B8 93 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 MICALL1Q8N3F8 863 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 PI4K2BQ8TCG2 481 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 NAPBQ9H115 298 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 STX8Q9UNK0 236 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 MUC3AQ02505 3323 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 CHD9Q3L8U1 2897 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 PLIN4Q96Q06 1357 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 TSPY2A6NKD2 308 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 NFIBO00712 420 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 MYL3P08590 195 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 PURAQ00577 322 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 VPS53Q5VIR6 699 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 CLEC4DQ8WXI8 215 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 COPS5Q92905 334 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 WDR11Q9BZH6 1224 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 NACAP1Q9BZK3 213 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 VTA1Q9NP79 307 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 CCPG1Q9ULG6 757 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 MYH8P13535 1937 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 ICAM1P05362 532 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 CA3P07451 260 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 FECHP22830 423 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 KCNQ1P51787 676 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 FOSBP53539 338 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 ARSIQ5FYB1 569 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 BTNL9Q6UXG8 535 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 SPRED2Q7Z698 418 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 GPATCH3Q96I76 525 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 FSD1Q9BTV5 496 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 TNKSO95271 1327 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 FGRP09769 529 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 PTGDRQ13258 359 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 GPNMBQ14956 572 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC96Q2M329 555 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 SYDE2Q5VT97 1194 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 SLC30A10Q6XR72 485 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 OR6J1Q8NGC5 347 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 TBC1D5Q92609 795 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 EPAS1Q99814 870 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM47Q9BQJ4 181 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 ANAPC4Q9UJX5 808 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 MCM3APO60318 1980 aa9.96□□□□□ -0.81
CTPS1-208ENST00000479480 PTPDC1A2A3K4 754 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 ARIH2O95376 493 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 NUDT7P0C024 238 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 IQCF3P0C7M6 154 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 CALML3P27482 149 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TAP1Q03518 808 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 FAM47CQ5HY64 1035 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 DCAF4Q8WV16 495 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TTC41PQ6P2S7 1318 aa9.96□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 REV3LO60673 3130 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 A6NJR5 290 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 ERC2O15083 957 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TLL1O43897 1013 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 ORC4O43929 436 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 FGAP02671 866 aa9.95□□□□□ -0.82
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