RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468534.1

CCDC88A-210, Transcript of coiled-coil domain containing 88A, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC88A, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88A-210ENST00000468534 CAP1Q01518 475 aa6.72□□□□□ -1.33
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CCDC88A-210ENST00000468534 K7ESM1 405 aa6.65□□□□□ -1.34
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CCDC88A-210ENST00000468534 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.65□□□□□ -1.34
CCDC88A-210ENST00000468534 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.65□□□□□ -1.34
CCDC88A-210ENST00000468534 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.65□□□□□ -1.34
CCDC88A-210ENST00000468534 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCDC88A-210ENST00000468534 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.65□□□□□ -1.34
CCDC88A-210ENST00000468534 COPS5Q92905 334 aa6.65□□□□□ -1.34
CCDC88A-210ENST00000468534 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCDC88A-210ENST00000468534 NOBOXO60393 691 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC88A-210ENST00000468534 C8BP07358 591 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC88A-210ENST00000468534 EFEMP1Q12805 493 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC88A-210ENST00000468534 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC88A-210ENST00000468534 STK32CQ86UX6 486 aa6.64□□□□□ -1.35
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