RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, human

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP5-208	ENST00000459627	MAP3K14	Q99558	947 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	HSPA4	P34932	840 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	PXMP2	Q9NR77	195 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	KCNB2	Q92953	911 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	NKX3-2	P78367	333 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	KRT32	Q14532	448 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	APOA5	Q6Q788	366 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	FANCB	Q8NB91	859 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	IL31RA	Q8NI17	732 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	NR3C2	P08235	984 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	POLR2M	P0CAP2	368 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	CALM1	P0DP23	149 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	CALM2	P0DP24	149 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	CALM3	P0DP25	149 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	PSMC6	P62333	389 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	PPP2R5B	Q15173	497 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627		B4DLN1	442 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	ITGB8	P26012	769 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	GNAQ	P50148	359 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	GHRHR	Q02643	423 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	STXBP2	Q15833	593 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	LY6K	Q17RY6	165 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	SCFD2	Q8WU76	684 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SH3BP5-208	ENST00000459627	LTBP2	Q14767	1821 aa		27.64	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	REC8	O95072	547 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	MYL3	P08590	195 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	CLTB	P09497	229 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	APOBR	Q0VD83	1088 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	FAAP100	Q0VG06	881 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627		Q6ZUG5	572 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	BAD	Q92934	168 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	IWS1	Q96ST2	819 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	MAF1	Q9H063	256 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627		Q9Y3F1	56 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	ELP1	O95163	1332 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	ARVCF	O00192	962 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	SORBS3	O60504	671 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	BMP8B	P34820	402 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	GRIN2D	O15399	1336 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZBTB43	O43298	467 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	SMARCA1	P28370	1054 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	CDK7	P50613	346 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	FGD1	P98174	961 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	TTLL4	Q14679	1199 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	PGM5	Q15124	567 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	27.61	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZEB2	O60315	1214 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	TRAF1	Q13077	416 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	RTN1	Q16799	776 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	BRF1	Q92994	677 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	RGS20	O76081	388 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	CDC27	P30260	824 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	ITGA7	Q13683	1181 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	USP26	Q9BXU7	913 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
SH3BP5-208	ENST00000459627	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01

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