RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454225.1

CITED1-210, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene CITED1, Length 716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-210ENST00000454225 TCEANC2Q96MN5 208 aa29.94■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 SPZ1Q9BXG8 430 aa29.94■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 PLEKHA8P1O95397 391 aa29.93■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 CLTBP09497 229 aa29.93■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 PPP2R5BQ15173 497 aa29.93■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 TSGA10IPQ3SY00 556 aa29.93■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 SCFD2Q8WU76 684 aa29.93■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 LTBP2Q14767 1821 aa29.93■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 TRIM43BA6NCK2 446 aa29.92■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 ZEB2O60315 1214 aa29.92■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 CALM1P0DP23 149 aa29.92■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 CALM2P0DP24 149 aa29.92■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 CALM3P0DP25 149 aa29.92■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 GNAQP50148 359 aa29.92■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 GHRHRQ02643 423 aa29.92■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 KRT32Q14532 448 aa29.92■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 OR6J1Q8NGC5 347 aa29.92■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
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CITED1-210ENST00000454225 LZTS2Q9BRK4 669 aa29.92■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 PXMP2Q9NR77 195 aa29.92■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa29.91■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 SGMS1Q86VZ5 419 aa29.91■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 MICU3Q86XE3 530 aa29.91■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 LAMA3Q16787 3333 aa29.91■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 DCDC2CA8MYV0 355 aa29.9■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 SMARCA1P28370 1054 aa29.9■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 STXBP2Q15833 593 aa29.9■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 SEPT14Q6ZU15 432 aa29.9■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 TDHQ8IZJ6 230 aa29.9■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 COPS5Q92905 334 aa29.9■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 ARVCFO00192 962 aa29.89■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP29.89■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 ARIH2O95376 493 aa29.89■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 POLR2MP0CAP2 368 aa29.89■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 TXNP10599 105 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 TTLL4Q14679 1199 aa29.89■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.89■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 TOX2Q96NM4 488 aa29.89■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 TMEM39AQ9NV64 488 aa29.89■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CITED1-210ENST00000454225 CABYRO75952 493 aa29.88■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 NR3C2P08235 984 aa29.88■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 CDK7P50613 346 aa29.88■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 FAAP100Q0VG06 881 aa29.88■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa29.88■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 SAMD3Q8N6K7 520 aa29.88■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 FANCBQ8NB91 859 aa29.88■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 BADQ92934 168 aa29.88■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 MROH7Q68CQ1 1323 aa29.88■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 KIAA0355O15063 1070 aa29.87■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 REC8O95072 547 aa29.87■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 HSPA4P34932 840 aa29.87■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 CPT1AP50416 773 aa29.87■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 APOA5Q6Q788 366 aa29.87■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 FCHSD1Q86WN1 690 aa29.87■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa29.86■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 ITGB8P26012 769 aa29.86■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 CCDC62Q6P9F0 684 aa29.86■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 TMTC3Q6ZXV5 915 aa29.86■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 CCDC82Q8N4S0 544 aa29.86■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 KCNB2Q92953 911 aa29.86■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 PDCD2LQ9BRP1 358 aa29.86■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 MYL3P08590 195 aa29.85■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 RAG1P15918 1043 aa29.85■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 PSMC6P62333 389 aa29.85■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 ITGA7Q13683 1181 aa29.85■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 BRPF3Q9ULD4 1205 aa29.85■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 SNX14Q9Y5W7 946 aa29.85■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 CPA1P15085 419 aa29.84■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 LY6KQ17RY6 165 aa29.84■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 FAM126BQ8IXS8 530 aa29.84■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 IL31RAQ8NI17 732 aa29.84■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 POLR3EQ9NVU0 708 aa29.84■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 GRIN2DO15399 1336 aa29.84■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 SZT2Q5T011 3432 aa29.84■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa29.83■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 PGM5Q15124 567 aa29.83■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 SLC43A3Q8NBI5 491 aa29.83■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 TBX21Q9UL17 535 aa29.83■■■□□ 2.37
CITED1-210ENST00000454225 TLR3O15455 904 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
CITED1-210ENST00000454225 ZBTB43O43298 467 aa29.82■■■□□ 2.36
CITED1-210ENST00000454225 FGD1P98174 961 aa29.82■■■□□ 2.36
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