RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448393.6

IFI16-208, Transcript of interferon gamma inducible protein 16, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene IFI16, Length 2,245 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFI16-208	ENST00000448393	TTLL8	A6PVC2	850 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	MYO1F	O00160	1098 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	HMMR	O75330	724 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	AMPD3	Q01432	767 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	LMNB2	Q03252	620 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	WDR44	Q5JSH3	913 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	KCNN1	Q92952	543 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	SLC35B4	Q969S0	331 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	CBX8	Q9HC52	389 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	PPT2	Q9UMR5	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393		A0A1W2PNR3	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393		M0R2C6	588 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	SLC27A2	O14975	620 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	MYO1B	O43795	1136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	MSX1	P28360	303 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	IRAK1	P51617	712 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	RASSF7	Q02833	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	BLMH	Q13867	455 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	P3H4	Q92791	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	NKD1	Q969G9	470 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	PTPRK	Q15262	1439 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	MSH6	P52701	1360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	ENC1	O14682	589 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	NPTXR	O95502	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	KCNA2	P16389	499 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	COPB2	P35606	906 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	PSMC4	P43686	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	NEK2	P51955	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	PHEX	P78562	749 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	CASP8	Q14790	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	USH1G	Q495M9	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IFI16-208	ENST00000448393	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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