RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439929.1

RPS29P3-201, Transcript of ribosomal protein S29 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene RPS29P3, Length 171 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P3-201ENST00000439929 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.35□□□□□ -0.75
RPS29P3-201ENST00000439929 PXMP2Q9NR77 195 aa10.35□□□□□ -0.75
RPS29P3-201ENST00000439929 TMEM260Q9NX78 707 aa10.35□□□□□ -0.75
RPS29P3-201ENST00000439929 VPS54Q9P1Q0 977 aa10.35□□□□□ -0.75
RPS29P3-201ENST00000439929 FRMPD4Q14CM0 1322 aa10.34□□□□□ -0.75
RPS29P3-201ENST00000439929 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
RPS29P3-201ENST00000439929 RGS20O76081 388 aa10.34□□□□□ -0.75
RPS29P3-201ENST00000439929 ARIH2O95376 493 aa10.34□□□□□ -0.75
RPS29P3-201ENST00000439929 FDPSP14324 419 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
RPS29P3-201ENST00000439929 NAPAP54920 295 aa10.34□□□□□ -0.75
RPS29P3-201ENST00000439929 ACVR2BQ13705 512 aa10.34□□□□□ -0.75
RPS29P3-201ENST00000439929 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa10.34□□□□□ -0.75
RPS29P3-201ENST00000439929 RASGRP4Q8TDF6 673 aa10.34□□□□□ -0.75
RPS29P3-201ENST00000439929 RMDN3Q96TC7 470 aa10.34□□□□□ -0.75
RPS29P3-201ENST00000439929 BARHL2Q9NY43 387 aa10.34□□□□□ -0.75
RPS29P3-201ENST00000439929 SLC5A4Q9NY91 659 aa10.34□□□□□ -0.75
RPS29P3-201ENST00000439929 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
RPS29P3-201ENST00000439929 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 CTAGE5O15320 804 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 SEPT4O43236 478 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 PGK1P00558 417 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 POLR2MP0CAP2 368 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 FOSBP53539 338 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 PGM5Q15124 567 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 NPY5RQ15761 445 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 MCF2L2Q86YR7 1114 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 CCDC83Q8IWF9 413 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 COPS5Q92905 334 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 PDCD2LQ9BRP1 358 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 TMEM106CQ9BVX2 250 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 BCAS3Q9H6U6 928 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 PNMA2Q9UL42 364 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 OGDHLQ9ULD0 1010 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 CNPY2Q9Y2B0 182 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 TELO2Q9Y4R8 837 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 LTBP2Q14767 1821 aa10.33□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 SMCO2A6NFE2 343 aa10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 ASB14A6NK59 587 aa10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 PIK3CDO00329 1044 aa10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 SORBS3O60504 671 aa10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 ADAMTS4O75173 837 aa10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 TFRCP02786 760 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 SMPD1P17405 629 aa10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 CLK2P49760 499 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 PDE4DQ08499 809 aa10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 PPP2R5BQ15173 497 aa10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 RABEP1Q15276 862 aa10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 ANKRD1Q15327 319 aa10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 DNERQ8NFT8 737 aa10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 PSTPIP2Q9H939 334 aa10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 RIC8AQ9NPQ8 531 aa10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 KCNJ14Q9UNX9 436 aa10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa10.32□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 CPLX1O14810 134 aa10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 EDIL3O43854 480 aa10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 NR3C2P08235 984 aa10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 AKR1A1P14550 325 aa10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 ADCY7P51828 1080 aa10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 BEX3Q00994 111 aa10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 SEMA3FQ13275 785 aa10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 LRRC41Q15345 812 aa10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 ARHGEF16Q5VV41 709 aa10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 PPP1R18Q6NYC8 613 aa10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 VTA1Q9NP79 307 aa10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 STK36Q9NRP7 1315 aa10.31□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 FAM205CA6NFA0 338 aa10.3□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 DEXIO95424 95 aa10.3□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 RGS19P49795 217 aa10.3□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 SP2Q02086 613 aa10.3□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 TNFAIP2Q03169 654 aa10.3□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 LY6KQ17RY6 165 aa10.3□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 CCDC62Q6P9F0 684 aa10.3□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 SEPT14Q6ZU15 432 aa10.3□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 VSIG10LQ86VR7 867 aa10.3□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 CYP2W1Q8TAV3 490 aa10.3□□□□□ -0.76
RPS29P3-201ENST00000439929 OXER1Q8TDS5 423 aa10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms