RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409289.6

RBMS1-204, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RBMS1, Length 1,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-204ENST00000409289 BCRP11274 1271 aa10.01□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 SPP2Q13103 211 aa10.01□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 VGLL4Q14135 290 aa10.01□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 MAP3K11Q16584 847 aa10.01□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 Q6ZVU0 165 aa10.01□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 KCTD1Q719H9 257 aa10.01□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 RASGRP2Q7LDG7 609 aa10.01□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 C2orf69Q8N8R5 385 aa10.01□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa10.01□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa10.01□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 SLC26A6Q9BXS9 759 aa10.01□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 ELP3Q9H9T3 547 aa10.01□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 USP17L10C9JJH3 530 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 SNHG28P0DPA3 235 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 IFNAR1P17181 557 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 SLC1A4P43007 532 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 ASPRV1Q53RT3 343 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 C4orf48Q5BLP8 95 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 TMTC3Q6ZXV5 915 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 TRIM22Q8IYM9 498 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 SPICE1Q8N0Z3 855 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 ZNF280CQ8ND82 737 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 DCAF4Q8WV16 495 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 LZTS2Q9BRK4 669 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 WDR18Q9BV38 432 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 UBA5Q9GZZ9 404 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 VCPKMTQ9H867 229 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 VAT1LQ9HCJ6 419 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 KIF3AQ9Y496 699 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa10□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 TRIM75PA6NK02 468 aa9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 NDUFB10O96000 172 aa9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 BMP3P12645 472 aa9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 FDPSP14324 419 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 USP14P54578 494 aa9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 ZNF543Q08ER8 600 aa9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 NBPF11Q86T75 865 aa9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 ERO1BQ86YB8 467 aa9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 GMCL1Q96IK5 515 aa9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 CPVLQ9H3G5 476 aa9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 PTPRFP10586 1907 aa9.99□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 C19orf81C9J6K1 198 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 DEXIO95424 95 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 FURINP09958 794 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 SLC16A2P36021 539 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 BACE1P56817 501 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 FKBP1BP68106 108 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 LDLRAD1Q5T700 205 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 CHMP5Q9NZZ3 219 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 TMEM232C9JQI7 657 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 CYTH3O43739 400 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 PDCP20941 246 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 SYT1P21579 422 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 SMARCA1P28370 1054 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 DDIT3P35638 169 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 PPATQ06203 517 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 DGKZQ13574 1117 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 GAS6Q14393 721 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 CST9Q5W186 159 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 WASF1Q92558 559 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 LPAR1Q92633 364 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 OPTNQ96CV9 577 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 ALG1Q9BT22 464 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.98□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 STK36Q9NRP7 1315 aa9.97□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 UNCXA6NJT0 531 aa9.97□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 H3BQV1 296 aa9.97□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 WDR46O15213 610 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 STX6O43752 255 aa9.97□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 HMGCS2P54868 508 aa9.97□□□□□ -0.81
RBMS1-204ENST00000409289 NUCB2P80303 420 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms