RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330687.8

CMTM4-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-201ENST00000330687 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 FCER1AP12319 257 aa22.69■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 CASP7P55210 303 aa22.69■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 PPP2R2AP63151 447 aa22.69■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 C6orf89Q6UWU4 347 aa22.69■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.69■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 SHISA4Q96DD7 197 aa22.69■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 NUP58Q9BVL2 599 aa22.69■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 KRT23Q9C075 422 aa22.69■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.69■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.69■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 H7C1W4 665 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 ANKS4BQ8N8V4 417 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 CCDC197Q8NCU1 140 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 GPR108Q9NPR9 543 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 MST1RQ04912 1400 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 LPIN2Q92539 896 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 TMBIM4Q9HC24 238 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 TNKSO95271 1327 aa22.68■■□□□ 1.22
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CMTM4-201ENST00000330687 A0A1W2PQC6 194 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 IRF6O14896 467 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 TRAPPC3O43617 180 aa22.67■■□□□ 1.22
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CMTM4-201ENST00000330687 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.67■■□□□ 1.22
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CMTM4-201ENST00000330687 MEA1Q16626 185 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 PANK4Q9NVE7 773 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 PNMA2Q9UL42 364 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 STK36Q9NRP7 1315 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 RASSF10A6NK89 507 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 FLT3P36888 993 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 TNNC1P63316 161 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 ABCF2Q9UG63 623 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 TRPC6Q9Y210 931 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 PTPRUQ92729 1446 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 GCP02774 474 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 AGAP11Q8TF27 550 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 RTN2O75298 545 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 KCNA6P17658 529 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 SLCO1A2P46721 670 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.66■■□□□ 1.22
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CMTM4-201ENST00000330687 DRP2Q13474 957 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.66■■□□□ 1.22
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CMTM4-201ENST00000330687 DAPK3O43293 454 aa22.65■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.65■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 ZNF844Q08AG5 666 aa22.65■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 IL17AQ16552 155 aa22.65■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.65■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 WHAMMQ8TF30 809 aa22.65■■□□□ 1.22
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CMTM4-201ENST00000330687 MLXIPLQ9NP71 852 aa22.65■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.65■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 A8MUI8 341 aa22.64■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 ADAMTS3O15072 1205 aa22.64■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 ERVK-9P63128 1117 aa22.64■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 STK4Q13043 487 aa22.64■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 LGR5O75473 907 aa22.64■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa22.64■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.64■■□□□ 1.22
CMTM4-201ENST00000330687 EVI5O60447 810 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 KCNJ2P63252 427 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 DYMQ7RTS9 669 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 SH3GL3Q99963 347 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 AMACRQ9UHK6 382 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 LCORLQ8N3X6 602 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 GDF3Q9NR23 364 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 NBPF26B4DH59 902 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM4-201ENST00000330687 PDHA1P08559 390 aa22.63■■□□□ 1.21
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