RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 NAA35Q5VZE5 725 aa23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 CCT5P48643 541 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 NT5C2P49902 561 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 SCNN1DP51172 638 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 METTL13Q8N6R0 699 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 POMGNT1Q8WZA1 660 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 OSBP2Q969R2 916 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 PANX2Q96RD6 677 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 CCNE1P24864 410 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 MAP7D3Q8IWC1 876 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 FAM81BQ96LP2 452 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 THAP9Q9H5L6 903 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 NRBP2Q9NSY0 501 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 JRKLQ9Y4A0 524 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 PPP2R5CQ13362 524 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 MESDQ14696 234 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 RPS6KA2Q15349 733 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 HSPA6P17066 643 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 SEPT2Q15019 361 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 FAM186BQ8IYM0 893 aa23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 FAM170AA1A519 330 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 TTLL1O95922 423 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 PRKG1Q13976 671 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 VCX3AQ9NNX9 186 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 IL9RQ01113 521 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD16Q68DU8 428 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 NR5A1Q13285 461 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf76Q5T2E6 689 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC197Q8NCU1 140 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 GBP5Q96PP8 586 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 EPB41L5Q9HCM4 733 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 CSADQ9Y600 493 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 CAPN9O14815 690 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA8FQ08AF8 430 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 SPTLC3Q9NUV7 552 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 PSMD2Q13200 908 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 PPP2R5AQ15172 486 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 GSDMBQ8TAX9 411 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 TBCKQ8TEA7 893 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 EVI5O60447 810 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 CDKL2Q92772 493 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 MMS19Q96T76 1030 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 PTCH1Q13635 1447 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 MBD5Q9P267 1494 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-201ENST00000284617 LRRIQ4A6NIV6 560 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 LARGE1O95461 756 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 CAPN12Q6ZSI9 719 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 PBKQ96KB5 322 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 COBLO75128 1261 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 USP6P35125 1406 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 PIK3CAP42336 1068 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 USP21Q9UK80 565 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 CLTAP09496 248 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 CNGA1P29973 690 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 TMC4Q7Z404 712 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFA10O95299 355 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF408Q9H9D4 720 aa23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms