RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 EXOC3L4Q17RC7 722 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 USP44Q9H0E7 712 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 GLT8D2Q9H1C3 349 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ZDHHC9Q9Y397 364 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 CHMP2AO43633 222 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 MESDQ14696 234 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 EYA1Q99502 592 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 KDM5DQ9BY66 1539 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 CA4P22748 312 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 INPP1P49441 399 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 KLC1Q07866 573 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 HOMEZQ8IX15 550 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ADGRG1Q9Y653 693 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 MAN1A2O60476 641 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 PLCG2P16885 1265 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ADAM9Q13443 819 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ARMCX5Q6P1M9 558 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 BLIDQ8IZY5 108 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 IWS1Q96ST2 819 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 SERPINI1Q99574 410 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 KCNJ6P48051 423 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 WDR24Q96S15 920 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 LZTS2Q9BRK4 669 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 SEMA3EO15041 775 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 SGO2Q562F6 1265 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 C10orf76Q5T2E6 689 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 TRAIPQ9BWF2 469 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ZFP69BQ9UJL9 534 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 OCA2Q04671 838 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 SPARCL1Q14515 664 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 KRT31Q15323 416 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 GPBP1Q86WP2 473 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 THAP9Q9H5L6 903 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 MDH1P40925 334 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 BSPRYQ5W0U4 402 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 JADE1Q6IE81 842 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 FANCBQ8NB91 859 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 CCT8L2Q96SF2 557 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ABHD10Q9NUJ1 306 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 CUL7Q14999 1698 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 NPATQ14207 1427 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 MT-ND3P03897 115 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 PPP2R5CQ13362 524 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 PGBD1Q96JS3 809 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 LRRC37BQ96QE4 947 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 PALMDQ9NP74 551 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 GPCPD1Q9NPB8 672 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 PANK4Q9NVE7 773 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ATICP31939 592 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 SLC8A3P57103 927 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 WDR91A4D1P6 747 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ZAP70P43403 619 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 FAM47EQ6ZV65 393 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 PARP3Q9Y6F1 533 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 ZNF532Q9HCE3 1301 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 DAPK3O43293 454 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 TECP42680 631 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 PSMD7P51665 324 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 CCZ1BP86790 482 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 MB21D1Q8N884 522 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 RDH13Q8NBN7 331 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 MYO1FO00160 1098 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 GPC4O75487 556 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 SERPING1P05155 500 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 CDR2Q01850 454 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 FAM26FQ5R3K3 315 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 TRIM55Q9BYV6 548 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 DNAJC6O75061 913 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 OR52Z1P0C646 297 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 AP2B1P63010 937 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 CUEDC2Q9H467 287 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 KRT10P13645 584 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 KRT28Q7Z3Y7 464 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 MAML1Q92585 1016 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 NDE1Q9NXR1 346 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 HARSP12081 509 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 PLCB4Q15147 1175 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-201ENST00000256413 SLC40A1Q9NP59 571 aa17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms