RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 SOGA3Q5TF21 947 aa22.58■■□□□ 1.21
VGF-201ENST00000249330 TTLL1O95922 423 aa22.57■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 BMP15O95972 392 aa22.57■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 TRIM14Q14142 442 aa22.57■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 KRT31Q15323 416 aa22.57■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.57■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 SHTN1A0MZ66 631 aa22.57■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 NFKBIEO00221 500 aa22.57■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 ARHGAP25P42331 645 aa22.57■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 DLGAP5Q15398 846 aa22.57■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.57■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.57■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 TNFRSF25Q93038 417 aa22.57■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 MYO6Q9UM54 1294 aa22.57■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 TRIM66O15016 1216 aa22.56■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 RPS6KA5O75582 802 aa22.56■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 SPAG1Q07617 926 aa22.56■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 ZBTB9Q96C00 473 aa22.56■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 SIPA1L1O43166 1804 aa22.55■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 GDF11O95390 407 aa22.55■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 ABL1P00519 1130 aa22.55■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.55■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.55■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.55■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 MED4Q9NPJ6 270 aa22.55■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 PTGER2P43116 358 aa22.55■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 CSRNP1Q96S65 589 aa22.55■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.55■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 VPS33BQ9H267 617 aa22.55■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.55■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.55■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.54■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 WDR93Q6P2C0 686 aa22.54■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.54■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 VPS16Q9H269 839 aa22.54■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 RAD21O60216 631 aa22.54■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 JAG1P78504 1218 aa22.54■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 AMPD2Q01433 879 aa22.54■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 JDP2Q8WYK2 163 aa22.54■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 PIGSQ96S52 555 aa22.54■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.54■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 ENTPD3O75355 529 aa22.53■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.53■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.53■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.53■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 CCDC17Q96LX7 622 aa22.53■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.53■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 VEZTQ9HBM0 779 aa22.53■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.53■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.53■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 PSME4Q14997 1843 aa22.53■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.53■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 COBLO75128 1261 aa22.53■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 CDC25AP30304 524 aa22.53■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 SEPT2Q15019 361 aa22.53■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.53■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.53■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 STXBP3O00186 592 aa22.52■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 KRT9P35527 623 aa22.52■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 RASSF7Q02833 373 aa22.52■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 ZNF174Q15697 407 aa22.52■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.52■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 BARHL2Q9NY43 387 aa22.52■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 PHACTR2O75167 634 aa22.52■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 PAK1Q13153 545 aa22.52■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 BLIDQ8IZY5 108 aa22.52■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.52■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 STAMQ92783 540 aa22.52■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.52■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.52■■□□□ 1.2
VGF-201ENST00000249330 KCNJ18B7U540 433 aa22.51■■□□□ 1.19
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VGF-201ENST00000249330 SNHG28P0DPA3 235 aa22.51■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 KCNJ12Q14500 433 aa22.51■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.51■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.51■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.51■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 SLC16A2P36021 539 aa22.51■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 PRELPP51888 382 aa22.51■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 KCTD1Q719H9 257 aa22.51■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.51■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.51■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.51■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.51■■□□□ 1.19
VGF-201ENST00000249330 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.51■■□□□ 1.19
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