RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

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Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.51■■■■□ 3.27
SYT6-210ENST00000641643 RICTORQ6R327 1708 aa35.48■■■■□ 3.27
SYT6-210ENST00000641643 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.44■■■■□ 3.26
SYT6-210ENST00000641643 PREX2Q70Z35 1606 aa35.43■■■■□ 3.26
SYT6-210ENST00000641643 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.43■■■■□ 3.26
SYT6-210ENST00000641643 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.39■■■■□ 3.26
SYT6-210ENST00000641643 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.39■■■■□ 3.26
SYT6-210ENST00000641643 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.38■■■■□ 3.25
SYT6-210ENST00000641643 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
SYT6-210ENST00000641643 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.37■■■■□ 3.25
SYT6-210ENST00000641643 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
SYT6-210ENST00000641643 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.37■■■■□ 3.25
SYT6-210ENST00000641643 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
SYT6-210ENST00000641643 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.35■■■■□ 3.25
SYT6-210ENST00000641643 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
SYT6-210ENST00000641643 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.34■■■■□ 3.25
SYT6-210ENST00000641643 AFAP1Q8N556 730 aa35.34■■■■□ 3.25
SYT6-210ENST00000641643 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.32■■■■□ 3.25
SYT6-210ENST00000641643 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.32■■■■□ 3.24
SYT6-210ENST00000641643 TIAM1Q13009 1591 aa35.3■■■■□ 3.24
SYT6-210ENST00000641643 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.3■■■■□ 3.24
SYT6-210ENST00000641643 ABCC1P33527 1531 aa35.28■■■■□ 3.24
SYT6-210ENST00000641643 APLP2Q06481 763 aa35.25■■■■□ 3.23
SYT6-210ENST00000641643 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.22■■■■□ 3.23
SYT6-210ENST00000641643 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.22■■■■□ 3.23
SYT6-210ENST00000641643 KDM5CP41229 1560 aa35.22■■■■□ 3.23
SYT6-210ENST00000641643 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.2■■■■□ 3.23
SYT6-210ENST00000641643 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
SYT6-210ENST00000641643 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.19■■■■□ 3.22
SYT6-210ENST00000641643 NCOA2Q15596 1464 aa35.19■■■■□ 3.22
SYT6-210ENST00000641643 MAP3K1Q13233 1512 aa35.19■■■■□ 3.22
SYT6-210ENST00000641643 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.19■■■■□ 3.22
SYT6-210ENST00000641643 ATP10AO60312 1499 aa35.18■■■■□ 3.22
SYT6-210ENST00000641643 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.18■■■■□ 3.22
SYT6-210ENST00000641643 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.17■■■■□ 3.22
SYT6-210ENST00000641643 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.15■■■■□ 3.22
SYT6-210ENST00000641643 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.15■■■■□ 3.22
SYT6-210ENST00000641643 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.15■■■■□ 3.22
SYT6-210ENST00000641643 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.14■■■■□ 3.22
SYT6-210ENST00000641643 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.14■■■■□ 3.22
SYT6-210ENST00000641643 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
SYT6-210ENST00000641643 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.11■■■■□ 3.21
SYT6-210ENST00000641643 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
SYT6-210ENST00000641643 MLECQ14165 292 aa35.08■■■■□ 3.21
SYT6-210ENST00000641643 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.08■■■■□ 3.21
SYT6-210ENST00000641643 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
SYT6-210ENST00000641643 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.03■■■■□ 3.2
SYT6-210ENST00000641643 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35■■■■□ 3.19
SYT6-210ENST00000641643 MADDQ8WXG6 1647 aa35■■■■□ 3.19
SYT6-210ENST00000641643 PTPRMP28827 1452 aa34.99■■■■□ 3.19
SYT6-210ENST00000641643 ABCA6Q8N139 1617 aa34.98■■■■□ 3.19
SYT6-210ENST00000641643 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.98■■■■□ 3.19
SYT6-210ENST00000641643 MBD5Q9P267 1494 aa34.95■■■■□ 3.19
SYT6-210ENST00000641643 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.95■■■■□ 3.18
SYT6-210ENST00000641643 REREQ9P2R6 1566 aa34.94■■■■□ 3.18
SYT6-210ENST00000641643 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.94■■■■□ 3.18
SYT6-210ENST00000641643 ATP7AQ04656 1500 aa34.92■■■■□ 3.18
SYT6-210ENST00000641643 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.9■■■■□ 3.18
SYT6-210ENST00000641643 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
SYT6-210ENST00000641643 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.87■■■■□ 3.17
SYT6-210ENST00000641643 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.86■■■■□ 3.17
SYT6-210ENST00000641643 MIA2Q96PC5 1412 aa34.86■■■■□ 3.17
SYT6-210ENST00000641643 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
SYT6-210ENST00000641643 AGLP35573 1532 aa34.86■■■■□ 3.17
SYT6-210ENST00000641643 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.83■■■■□ 3.17
SYT6-210ENST00000641643 TSPY4P0CV99 314 aa34.83■■■■□ 3.17
SYT6-210ENST00000641643 TSPY10P0CW01 314 aa34.83■■■■□ 3.17
SYT6-210ENST00000641643 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.83■■■■□ 3.17
SYT6-210ENST00000641643 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
SYT6-210ENST00000641643 A2MP01023 1474 aa34.79■■■■□ 3.16
SYT6-210ENST00000641643 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.77■■■■□ 3.16
SYT6-210ENST00000641643 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.7■■■■□ 3.15
SYT6-210ENST00000641643 PLXNC1O60486 1568 aa34.7■■■■□ 3.15
SYT6-210ENST00000641643 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
SYT6-210ENST00000641643 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
SYT6-210ENST00000641643 GGT6Q6P531 493 aa34.66■■■■□ 3.14
SYT6-210ENST00000641643 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.66■■■■□ 3.14
SYT6-210ENST00000641643 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.64■■■■□ 3.14
SYT6-210ENST00000641643 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.64■■■■□ 3.14
SYT6-210ENST00000641643 KIF3BO15066 747 aa34.58■■■■□ 3.13
SYT6-210ENST00000641643 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.57■■■■□ 3.13
SYT6-210ENST00000641643 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.56■■■■□ 3.12
SYT6-210ENST00000641643 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
SYT6-210ENST00000641643 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.53■■■■□ 3.12
SYT6-210ENST00000641643 ABCC5O15440 1437 aa34.53■■■■□ 3.12
SYT6-210ENST00000641643 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
SYT6-210ENST00000641643 ZMYM3Q14202 1370 aa34.5■■■■□ 3.11
SYT6-210ENST00000641643 DAPK1P53355 1430 aa34.5■■■■□ 3.11
SYT6-210ENST00000641643 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.48■■■■□ 3.11
SYT6-210ENST00000641643 C3P01024 1663 aa34.48■■■■□ 3.11
SYT6-210ENST00000641643 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
SYT6-210ENST00000641643 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
SYT6-210ENST00000641643 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
SYT6-210ENST00000641643 HSPA2P54652 639 aa34.45■■■■□ 3.1
SYT6-210ENST00000641643 MROH2AA6NES4 1674 aa34.44■■■■□ 3.1
SYT6-210ENST00000641643 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
SYT6-210ENST00000641643 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.42■■■■□ 3.1
SYT6-210ENST00000641643 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.42■■■■□ 3.1
SYT6-210ENST00000641643 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.42■■■■□ 3.1
SYT6-210ENST00000641643 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.42■■■■□ 3.1
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