RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640500.1

GABRG2-223, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit, human

TSL 5

Gene GABRG2, Length 2,849 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GABRG2-223	ENST00000640500	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		7.25	□□□□□ -1.25
GABRG2-223	ENST00000640500	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		7.25	□□□□□ -1.25
GABRG2-223	ENST00000640500	TIAM1	Q13009	1591 aa		7.25	□□□□□ -1.25
GABRG2-223	ENST00000640500	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		7.24	□□□□□ -1.25
GABRG2-223	ENST00000640500	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
GABRG2-223	ENST00000640500	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		7.23	□□□□□ -1.25
GABRG2-223	ENST00000640500	KDM6B	O15054	1643 aa		7.23	□□□□□ -1.25
GABRG2-223	ENST00000640500	RAPGEF3	O95398	923 aa		7.23	□□□□□ -1.25
GABRG2-223	ENST00000640500	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		7.22	□□□□□ -1.25
GABRG2-223	ENST00000640500	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.25
GABRG2-223	ENST00000640500	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		7.21	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		7.2	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		7.2	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	FANCA	O15360	1455 aa		7.2	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		7.2	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	PREX2	Q70Z35	1606 aa		7.2	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		7.19	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		7.19	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	NCOA2	Q15596	1464 aa		7.19	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		7.18	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		7.18	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	PLCH2	O75038	1416 aa		7.18	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	POTEH	Q6S545	545 aa		7.18	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	AKNA	Q7Z591	1439 aa		7.18	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	RICTOR	Q6R327	1708 aa		7.18	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		7.17	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	AFAP1	Q8N556	730 aa		7.17	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		7.17	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	ADGRL1	O94910	1474 aa		7.16	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	7.16	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		7.16	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		7.16	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		7.16	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		7.15	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		7.15	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		7.15	□□□□□ -1.26
GABRG2-223	ENST00000640500	ABCC1	P33527	1531 aa		7.14	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	NEO1	Q92859	1461 aa		7.14	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		7.14	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	MAP3K1	Q13233	1512 aa		7.13	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	APLP2	Q06481	763 aa		7.13	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		7.13	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		7.12	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		7.12	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		7.12	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	ABCA6	Q8N139	1617 aa		7.11	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		7.11	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	MBD5	Q9P267	1494 aa		7.11	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	KDM5C	P41229	1560 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		7.09	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	MLEC	Q14165	292 aa		7.09	□□□□□ -1.27
GABRG2-223	ENST00000640500	ITGAE	P38570	1179 aa		7.09	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		7.08	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		7.08	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		7.08	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		7.08	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		7.08	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		7.08	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		7.08	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		7.08	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	PTPRK	Q15262	1439 aa		7.07	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		7.07	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	ATP7A	Q04656	1500 aa		7.06	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		7.06	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	ABCC5	O15440	1437 aa		7.05	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		7.05	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		7.05	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	FKBP8	Q14318	412 aa		7.05	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	MADD	Q8WXG6	1647 aa		7.04	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	DAPK1	P53355	1430 aa		7.04	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	MIA2	Q96PC5	1412 aa		7.04	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		7.04	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		7.04	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		7.03	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		7.03	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		7.03	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	ATP10A	O60312	1499 aa		7.03	□□□□□ -1.28
GABRG2-223	ENST00000640500	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GABRG2-223	ENST00000640500	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GABRG2-223	ENST00000640500	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29

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