RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639221.1

SLC35A3-216, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC35A3, Length 1,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-216ENST00000639221 APLP2Q06481 763 aa35.35■■■■□ 3.25
SLC35A3-216ENST00000639221 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.35■■■■□ 3.25
SLC35A3-216ENST00000639221 PREX2Q70Z35 1606 aa35.32■■■■□ 3.25
SLC35A3-216ENST00000639221 TIAM1Q13009 1591 aa35.29■■■■□ 3.24
SLC35A3-216ENST00000639221 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.28■■■■□ 3.24
SLC35A3-216ENST00000639221 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.28■■■■□ 3.24
SLC35A3-216ENST00000639221 RICTORQ6R327 1708 aa35.27■■■■□ 3.24
SLC35A3-216ENST00000639221 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
SLC35A3-216ENST00000639221 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.26■■■■□ 3.24
SLC35A3-216ENST00000639221 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
SLC35A3-216ENST00000639221 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
SLC35A3-216ENST00000639221 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.25■■■■□ 3.23
SLC35A3-216ENST00000639221 MAP3K1Q13233 1512 aa35.24■■■■□ 3.23
SLC35A3-216ENST00000639221 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.23■■■■□ 3.23
SLC35A3-216ENST00000639221 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.22■■■■□ 3.23
SLC35A3-216ENST00000639221 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.22■■■■□ 3.23
SLC35A3-216ENST00000639221 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.2■■■■□ 3.23
SLC35A3-216ENST00000639221 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.19■■■■□ 3.22
SLC35A3-216ENST00000639221 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
SLC35A3-216ENST00000639221 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.17■■■■□ 3.22
SLC35A3-216ENST00000639221 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
SLC35A3-216ENST00000639221 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.16■■■■□ 3.22
SLC35A3-216ENST00000639221 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.16■■■■□ 3.22
SLC35A3-216ENST00000639221 ABCC1P33527 1531 aa35.15■■■■□ 3.22
SLC35A3-216ENST00000639221 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.15■■■■□ 3.22
SLC35A3-216ENST00000639221 AFAP1Q8N556 730 aa35.14■■■■□ 3.22
SLC35A3-216ENST00000639221 NCOA2Q15596 1464 aa35.13■■■■□ 3.21
SLC35A3-216ENST00000639221 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.13■■■■□ 3.21
SLC35A3-216ENST00000639221 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.07■■■■□ 3.21
SLC35A3-216ENST00000639221 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.06■■■■□ 3.2
SLC35A3-216ENST00000639221 KDM5CP41229 1560 aa35.05■■■■□ 3.2
SLC35A3-216ENST00000639221 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.05■■■■□ 3.2
SLC35A3-216ENST00000639221 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
SLC35A3-216ENST00000639221 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.05■■■■□ 3.2
SLC35A3-216ENST00000639221 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.04■■■■□ 3.2
SLC35A3-216ENST00000639221 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.03■■■■□ 3.21e-6■■■■□ 22.8
SLC35A3-216ENST00000639221 ATP10AO60312 1499 aa35.02■■■■□ 3.2
SLC35A3-216ENST00000639221 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.01■■■■□ 3.2
SLC35A3-216ENST00000639221 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.01■■■■□ 3.19
SLC35A3-216ENST00000639221 HECW2Q9P2P5 1572 aa35■■■■□ 3.19
SLC35A3-216ENST00000639221 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
SLC35A3-216ENST00000639221 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.98■■■■□ 3.19
SLC35A3-216ENST00000639221 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.94■■■■□ 3.18
SLC35A3-216ENST00000639221 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.93■■■■□ 3.18
SLC35A3-216ENST00000639221 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.87■■■■□ 3.17
SLC35A3-216ENST00000639221 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.87■■■■□ 3.17
SLC35A3-216ENST00000639221 MIA2Q96PC5 1412 aa34.86■■■■□ 3.17
SLC35A3-216ENST00000639221 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.86■■■■□ 3.17
SLC35A3-216ENST00000639221 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.84■■■■□ 3.17
SLC35A3-216ENST00000639221 MLECQ14165 292 aa34.83■■■■□ 3.17
SLC35A3-216ENST00000639221 MBD5Q9P267 1494 aa34.83■■■■□ 3.17
SLC35A3-216ENST00000639221 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.82■■■■□ 3.16
SLC35A3-216ENST00000639221 REREQ9P2R6 1566 aa34.81■■■■□ 3.16
SLC35A3-216ENST00000639221 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.8■■■■□ 3.16
SLC35A3-216ENST00000639221 TSPY4P0CV99 314 aa34.8■■■■□ 3.16
SLC35A3-216ENST00000639221 TSPY10P0CW01 314 aa34.8■■■■□ 3.16
SLC35A3-216ENST00000639221 ABCA6Q8N139 1617 aa34.8■■■■□ 3.16
SLC35A3-216ENST00000639221 ATP7AQ04656 1500 aa34.8■■■■□ 3.16
SLC35A3-216ENST00000639221 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.79■■■■□ 3.16
SLC35A3-216ENST00000639221 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.76■■■■□ 3.16
SLC35A3-216ENST00000639221 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
SLC35A3-216ENST00000639221 MADDQ8WXG6 1647 aa34.72■■■■□ 3.15
SLC35A3-216ENST00000639221 PTPRMP28827 1452 aa34.71■■■■□ 3.15
SLC35A3-216ENST00000639221 AGLP35573 1532 aa34.71■■■■□ 3.15
SLC35A3-216ENST00000639221 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.71■■■■□ 3.15
SLC35A3-216ENST00000639221 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
SLC35A3-216ENST00000639221 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.69■■■■□ 3.14
SLC35A3-216ENST00000639221 A2MP01023 1474 aa34.67■■■■□ 3.14
SLC35A3-216ENST00000639221 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.64■■■■□ 3.14
SLC35A3-216ENST00000639221 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
SLC35A3-216ENST00000639221 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.61■■■■□ 3.13
SLC35A3-216ENST00000639221 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.61■■■■□ 3.13
SLC35A3-216ENST00000639221 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.6■■■■□ 3.13
SLC35A3-216ENST00000639221 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
SLC35A3-216ENST00000639221 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.56■■■■□ 3.12
SLC35A3-216ENST00000639221 PLXNC1O60486 1568 aa34.54■■■■□ 3.12
SLC35A3-216ENST00000639221 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
SLC35A3-216ENST00000639221 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.52■■■■□ 3.12
SLC35A3-216ENST00000639221 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.51■■■■□ 3.12
SLC35A3-216ENST00000639221 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
SLC35A3-216ENST00000639221 GGT6Q6P531 493 aa34.5■■■■□ 3.11
SLC35A3-216ENST00000639221 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.5■■■■□ 3.11
SLC35A3-216ENST00000639221 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.46■■■■□ 3.11
SLC35A3-216ENST00000639221 KIF3BO15066 747 aa34.45■■■■□ 3.11
SLC35A3-216ENST00000639221 ABCC5O15440 1437 aa34.45■■■■□ 3.11
SLC35A3-216ENST00000639221 DAPK1P53355 1430 aa34.45■■■■□ 3.11
SLC35A3-216ENST00000639221 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
SLC35A3-216ENST00000639221 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
SLC35A3-216ENST00000639221 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
SLC35A3-216ENST00000639221 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.36■■■■□ 3.09
SLC35A3-216ENST00000639221 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.35■■■■□ 3.09
SLC35A3-216ENST00000639221 KIF15Q9NS87 1388 aa34.35■■■■□ 3.09
SLC35A3-216ENST00000639221 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.34■■■■□ 3.09
SLC35A3-216ENST00000639221 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.34■■■■□ 3.09
SLC35A3-216ENST00000639221 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.33■■■■□ 3.09
SLC35A3-216ENST00000639221 ZMYM3Q14202 1370 aa34.32■■■■□ 3.08
SLC35A3-216ENST00000639221 MROH2AA6NES4 1674 aa34.29■■■■□ 3.08
SLC35A3-216ENST00000639221 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.29■■■■□ 3.08
SLC35A3-216ENST00000639221 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.28■■■■□ 3.08
SLC35A3-216ENST00000639221 C3P01024 1663 aa34.26■■■■□ 3.08
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