RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638160.1

CHML-205, Transcript of CHM like, Rab escort protein 2, human

TSL 3 BASIC

Gene CHML, Length 705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHML-205	ENST00000638160	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.76	■■■■■ 4.44
CHML-205	ENST00000638160	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		42.71	■■■■■ 4.43
CHML-205	ENST00000638160	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.69	■■■■■ 4.42
CHML-205	ENST00000638160	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CHML-205	ENST00000638160	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CHML-205	ENST00000638160	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		42.66	■■■■■ 4.42
CHML-205	ENST00000638160	PREX2	Q70Z35	1606 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CHML-205	ENST00000638160	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
CHML-205	ENST00000638160	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CHML-205	ENST00000638160	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.58	■■■■■ 4.41
CHML-205	ENST00000638160	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		42.57	■■■■■ 4.41
CHML-205	ENST00000638160	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.57	■■■■■ 4.41
CHML-205	ENST00000638160	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CHML-205	ENST00000638160	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CHML-205	ENST00000638160	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CHML-205	ENST00000638160	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
CHML-205	ENST00000638160	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.54	■■■■■ 4.4
CHML-205	ENST00000638160	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.53	■■■■■ 4.4
CHML-205	ENST00000638160	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.52	■■■■■ 4.4
CHML-205	ENST00000638160	ABCC1	P33527	1531 aa		42.48	■■■■■ 4.39
CHML-205	ENST00000638160	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CHML-205	ENST00000638160	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CHML-205	ENST00000638160	KDM5C	P41229	1560 aa		42.44	■■■■■ 4.39
CHML-205	ENST00000638160	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.43	■■■■■ 4.38
CHML-205	ENST00000638160	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.42	■■■■■ 4.38
CHML-205	ENST00000638160	ATP10A	O60312	1499 aa		42.41	■■■■■ 4.38
CHML-205	ENST00000638160	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CHML-205	ENST00000638160	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.38	■■■■■ 4.38
CHML-205	ENST00000638160	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CHML-205	ENST00000638160	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CHML-205	ENST00000638160	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CHML-205	ENST00000638160	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.36	■■■■■ 4.37
CHML-205	ENST00000638160	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.35	■■■■■ 4.37
CHML-205	ENST00000638160	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.35	■■■■■ 4.37
CHML-205	ENST00000638160	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.34	■■■■■ 4.37
CHML-205	ENST00000638160	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		42.34	■■■■■ 4.37
CHML-205	ENST00000638160	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.33	■■■■■ 4.37
CHML-205	ENST00000638160	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.33	■■■■■ 4.37
CHML-205	ENST00000638160	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.32	■■■■■ 4.37
CHML-205	ENST00000638160	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.32	■■■■■ 4.37
CHML-205	ENST00000638160	APLP2	Q06481	763 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CHML-205	ENST00000638160	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CHML-205	ENST00000638160	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.27	■■■■■ 4.36
CHML-205	ENST00000638160	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.24	■■■■■ 4.35
CHML-205	ENST00000638160	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.23	■■■■■ 4.35
CHML-205	ENST00000638160	PTPRM	P28827	1452 aa		42.21	■■■■■ 4.35
CHML-205	ENST00000638160	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CHML-205	ENST00000638160	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.19	■■■■■ 4.34
CHML-205	ENST00000638160	MLEC	Q14165	292 aa		42.19	■■■■■ 4.34
CHML-205	ENST00000638160	MADD	Q8WXG6	1647 aa		42.16	■■■■■ 4.34
CHML-205	ENST00000638160	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.15	■■■■■ 4.34
CHML-205	ENST00000638160	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CHML-205	ENST00000638160	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.13	■■■■■ 4.34
CHML-205	ENST00000638160	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.12	■■■■■ 4.33
CHML-205	ENST00000638160	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CHML-205	ENST00000638160	AGL	P35573	1532 aa		42.05	■■■■■ 4.32
CHML-205	ENST00000638160	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.04	■■■■■ 4.32
CHML-205	ENST00000638160	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.04	■■■■■ 4.32
CHML-205	ENST00000638160	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.02	■■■■■ 4.32
CHML-205	ENST00000638160	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	41.99	■■■■■ 4.31
CHML-205	ENST00000638160	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		41.98	■■■■■ 4.31
CHML-205	ENST00000638160	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		41.98	■■■■■ 4.31
CHML-205	ENST00000638160	MIA2	Q96PC5	1412 aa		41.98	■■■■■ 4.31
CHML-205	ENST00000638160	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		41.96	■■■■■ 4.31
CHML-205	ENST00000638160	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		41.93	■■■■■ 4.3
CHML-205	ENST00000638160	A2M	P01023	1474 aa		41.91	■■■■■ 4.3
CHML-205	ENST00000638160	TSPY4	P0CV99	314 aa		41.9	■■■■■ 4.3
CHML-205	ENST00000638160	TSPY10	P0CW01	314 aa		41.9	■■■■■ 4.3
CHML-205	ENST00000638160	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		41.88	■■■■■ 4.29
CHML-205	ENST00000638160	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		41.87	■■■■■ 4.29
CHML-205	ENST00000638160	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	41.87	■■■■■ 4.29
CHML-205	ENST00000638160	PLXNC1	O60486	1568 aa		41.8	■■■■■ 4.28
CHML-205	ENST00000638160	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	41.79	■■■■■ 4.28
CHML-205	ENST00000638160	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		41.79	■■■■■ 4.28
CHML-205	ENST00000638160	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	41.76	■■■■■ 4.28
CHML-205	ENST00000638160	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		41.75	■■■■■ 4.27
CHML-205	ENST00000638160	GGT6	Q6P531	493 aa		41.71	■■■■■ 4.27
CHML-205	ENST00000638160	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		41.71	■■■■■ 4.27
CHML-205	ENST00000638160	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		41.69	■■■■■ 4.27
CHML-205	ENST00000638160	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		41.67	■■■■■ 4.26
CHML-205	ENST00000638160	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		41.66	■■■■■ 4.26
CHML-205	ENST00000638160	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.64	■■■■■ 4.26
CHML-205	ENST00000638160	KIF3B	O15066	747 aa		41.62	■■■■■ 4.25
CHML-205	ENST00000638160	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	41.61	■■■■■ 4.25
CHML-205	ENST00000638160	ZMYM3	Q14202	1370 aa		41.58	■■■■■ 4.25
CHML-205	ENST00000638160	ABCC5	O15440	1437 aa		41.57	■■■■■ 4.25
CHML-205	ENST00000638160	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	41.56	■■■■■ 4.24
CHML-205	ENST00000638160	C3	P01024	1663 aa		41.55	■■■■■ 4.24
CHML-205	ENST00000638160	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		41.52	■■■■■ 4.24
CHML-205	ENST00000638160	MROH2A	A6NES4	1674 aa		41.52	■■■■■ 4.24
CHML-205	ENST00000638160	DAPK1	P53355	1430 aa		41.51	■■■■■ 4.24
CHML-205	ENST00000638160	HSPA2	P54652	639 aa		41.5	■■■■■ 4.23
CHML-205	ENST00000638160	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		41.46	■■■■■ 4.23
CHML-205	ENST00000638160	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		41.45	■■■■■ 4.23
CHML-205	ENST00000638160	NPAT	Q14207	1427 aa		41.45	■■■■■ 4.23
CHML-205	ENST00000638160	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	41.45	■■■■■ 4.23
CHML-205	ENST00000638160	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	41.45	■■■■■ 4.23
CHML-205	ENST00000638160	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	41.45	■■■■■ 4.23
CHML-205	ENST00000638160	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		41.41	■■■■■ 4.22
CHML-205	ENST00000638160	KIF15	Q9NS87	1388 aa		41.4	■■■■■ 4.22

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