RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-241ENST00000635861 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
CLN3-241ENST00000635861 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.18■■■□□ 2.42
CLN3-241ENST00000635861 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.16■■■□□ 2.42
CLN3-241ENST00000635861 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.16■■■□□ 2.42
CLN3-241ENST00000635861 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.14■■■□□ 2.42
CLN3-241ENST00000635861 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.14■■■□□ 2.42
CLN3-241ENST00000635861 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
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CLN3-241ENST00000635861 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.09■■■□□ 2.41
CLN3-241ENST00000635861 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.09■■■□□ 2.41
CLN3-241ENST00000635861 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.09■■■□□ 2.41
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CLN3-241ENST00000635861 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.05■■■□□ 2.4
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CLN3-241ENST00000635861 ATP10AO60312 1499 aa30.02■■■□□ 2.4
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CLN3-241ENST00000635861 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.95■■■□□ 2.38
CLN3-241ENST00000635861 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.94■■■□□ 2.38
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CLN3-241ENST00000635861 ABCC1P33527 1531 aa29.93■■■□□ 2.38
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CLN3-241ENST00000635861 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.89■■■□□ 2.38
CLN3-241ENST00000635861 AFAP1Q8N556 730 aa29.87■■■□□ 2.37
CLN3-241ENST00000635861 ABCA6Q8N139 1617 aa29.86■■■□□ 2.37
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CLN3-241ENST00000635861 AGLP35573 1532 aa29.8■■■□□ 2.36
CLN3-241ENST00000635861 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.79■■■□□ 2.36
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CLN3-241ENST00000635861 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.71■■■□□ 2.35
CLN3-241ENST00000635861 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.71■■■□□ 2.35
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CLN3-241ENST00000635861 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.66■■■□□ 2.34
CLN3-241ENST00000635861 CEP162Q5TB80 1403 aa29.64■■■□□ 2.34
CLN3-241ENST00000635861 HSPA2P54652 639 aa29.64■■■□□ 2.34
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CLN3-241ENST00000635861 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CLN3-241ENST00000635861 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.21■■■□□ 2.27
CLN3-241ENST00000635861 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.2■■■□□ 2.26
CLN3-241ENST00000635861 PLA2R1Q13018 1463 aa29.2■■■□□ 2.26
CLN3-241ENST00000635861 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.18■■■□□ 2.26
CLN3-241ENST00000635861 TSPY4P0CV99 314 aa29.17■■■□□ 2.26
CLN3-241ENST00000635861 TSPY10P0CW01 314 aa29.17■■■□□ 2.26
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