RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635406.1

ATP7B-216, Transcript of ATPase copper transporting beta, human

TSL 4

Gene ATP7B, Length 506 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP7B-216	ENST00000635406	ADGRL1	O94910	1474 aa		33.41	■■■□□ 2.94
ATP7B-216	ENST00000635406	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.4	■■■□□ 2.94
ATP7B-216	ENST00000635406	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.39	■■■□□ 2.94
ATP7B-216	ENST00000635406	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		33.33	■■■□□ 2.93
ATP7B-216	ENST00000635406	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		33.33	■■■□□ 2.93
ATP7B-216	ENST00000635406	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.32	■■■□□ 2.92
ATP7B-216	ENST00000635406	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.32	■■■□□ 2.92
ATP7B-216	ENST00000635406	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		33.3	■■■□□ 2.92
ATP7B-216	ENST00000635406	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
ATP7B-216	ENST00000635406	ABCC1	P33527	1531 aa		33.28	■■■□□ 2.92
ATP7B-216	ENST00000635406	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.26	■■■□□ 2.91
ATP7B-216	ENST00000635406	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.25	■■■□□ 2.91
ATP7B-216	ENST00000635406	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
ATP7B-216	ENST00000635406	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		33.24	■■■□□ 2.91
ATP7B-216	ENST00000635406	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ATP7B-216	ENST00000635406	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.21	■■■□□ 2.91
ATP7B-216	ENST00000635406	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.21	■■■□□ 2.91
ATP7B-216	ENST00000635406	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.2	■■■□□ 2.91
ATP7B-216	ENST00000635406	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.2	■■■□□ 2.91
ATP7B-216	ENST00000635406	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.19	■■■□□ 2.9
ATP7B-216	ENST00000635406	KDM5C	P41229	1560 aa		33.19	■■■□□ 2.9
ATP7B-216	ENST00000635406	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.19	■■■□□ 2.9
ATP7B-216	ENST00000635406	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.18	■■■□□ 2.9
ATP7B-216	ENST00000635406	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.15	■■■□□ 2.9
ATP7B-216	ENST00000635406	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.14	■■■□□ 2.9
ATP7B-216	ENST00000635406	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
ATP7B-216	ENST00000635406	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.13	■■■□□ 2.89
ATP7B-216	ENST00000635406	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.13	■■■□□ 2.89
ATP7B-216	ENST00000635406	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
ATP7B-216	ENST00000635406	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
ATP7B-216	ENST00000635406	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.12	■■■□□ 2.89
ATP7B-216	ENST00000635406	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.09	■■■□□ 2.89
ATP7B-216	ENST00000635406	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
ATP7B-216	ENST00000635406	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ATP7B-216	ENST00000635406	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.03	■■■□□ 2.88
ATP7B-216	ENST00000635406	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.03	■■■□□ 2.88
ATP7B-216	ENST00000635406	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.02	■■■□□ 2.88
ATP7B-216	ENST00000635406	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.01	■■■□□ 2.88
ATP7B-216	ENST00000635406	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
ATP7B-216	ENST00000635406	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		33.01	■■■□□ 2.87
ATP7B-216	ENST00000635406	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33	■■■□□ 2.87
ATP7B-216	ENST00000635406	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.99	■■■□□ 2.87
ATP7B-216	ENST00000635406	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.98	■■■□□ 2.87	1e-6	■■■■□ 20.3
ATP7B-216	ENST00000635406	ATP10A	O60312	1499 aa		32.97	■■■□□ 2.87
ATP7B-216	ENST00000635406	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.97	■■■□□ 2.87
ATP7B-216	ENST00000635406	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.96	■■■□□ 2.87
ATP7B-216	ENST00000635406	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.86
ATP7B-216	ENST00000635406	APLP2	Q06481	763 aa		32.94	■■■□□ 2.86
ATP7B-216	ENST00000635406	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
ATP7B-216	ENST00000635406	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.93	■■■□□ 2.86
ATP7B-216	ENST00000635406	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.93	■■■□□ 2.86
ATP7B-216	ENST00000635406	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.91	■■■□□ 2.86
ATP7B-216	ENST00000635406	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.89	■■■□□ 2.86
ATP7B-216	ENST00000635406	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.89	■■■□□ 2.86
ATP7B-216	ENST00000635406	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.88	■■■□□ 2.85
ATP7B-216	ENST00000635406	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
ATP7B-216	ENST00000635406	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
ATP7B-216	ENST00000635406	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.82	■■■□□ 2.84
ATP7B-216	ENST00000635406	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.81	■■■□□ 2.84
ATP7B-216	ENST00000635406	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.8	■■■□□ 2.84
ATP7B-216	ENST00000635406	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.78	■■■□□ 2.84
ATP7B-216	ENST00000635406	MLEC	Q14165	292 aa		32.77	■■■□□ 2.84
ATP7B-216	ENST00000635406	PTPRM	P28827	1452 aa		32.77	■■■□□ 2.84
ATP7B-216	ENST00000635406	AGL	P35573	1532 aa		32.75	■■■□□ 2.83
ATP7B-216	ENST00000635406	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.75	■■■□□ 2.83
ATP7B-216	ENST00000635406	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.74	■■■□□ 2.83
ATP7B-216	ENST00000635406	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.74	■■■□□ 2.83
ATP7B-216	ENST00000635406	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.69	■■■□□ 2.82
ATP7B-216	ENST00000635406	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.68	■■■□□ 2.82
ATP7B-216	ENST00000635406	A2M	P01023	1474 aa		32.68	■■■□□ 2.82
ATP7B-216	ENST00000635406	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.65	■■■□□ 2.82
ATP7B-216	ENST00000635406	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.64	■■■□□ 2.82
ATP7B-216	ENST00000635406	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
ATP7B-216	ENST00000635406	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.6	■■■□□ 2.81
ATP7B-216	ENST00000635406	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
ATP7B-216	ENST00000635406	ABCC5	O15440	1437 aa		32.54	■■■□□ 2.8
ATP7B-216	ENST00000635406	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.54	■■■□□ 2.8
ATP7B-216	ENST00000635406	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
ATP7B-216	ENST00000635406	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.52	■■■□□ 2.8
ATP7B-216	ENST00000635406	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.52	■■■□□ 2.8
ATP7B-216	ENST00000635406	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.52	■■■□□ 2.8
ATP7B-216	ENST00000635406	DAPK1	P53355	1430 aa		32.51	■■■□□ 2.8
ATP7B-216	ENST00000635406	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
ATP7B-216	ENST00000635406	C3	P01024	1663 aa		32.5	■■■□□ 2.79
ATP7B-216	ENST00000635406	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
ATP7B-216	ENST00000635406	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ATP7B-216	ENST00000635406	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
ATP7B-216	ENST00000635406	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.41	■■■□□ 2.78
ATP7B-216	ENST00000635406	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
ATP7B-216	ENST00000635406	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.4	■■■□□ 2.78
ATP7B-216	ENST00000635406	GGT6	Q6P531	493 aa		32.39	■■■□□ 2.78
ATP7B-216	ENST00000635406	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
ATP7B-216	ENST00000635406	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
ATP7B-216	ENST00000635406	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
ATP7B-216	ENST00000635406	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ATP7B-216	ENST00000635406	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ATP7B-216	ENST00000635406	KIF3B	O15066	747 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ATP7B-216	ENST00000635406	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.35	■■■□□ 2.77
ATP7B-216	ENST00000635406	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.32	■■■□□ 2.76
ATP7B-216	ENST00000635406	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.31	■■■□□ 2.76

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