RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629113.1

LEMD1-210, Transcript of LEM domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene LEMD1, Length 314 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1-210ENST00000629113 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa45.85■■■■■ 4.93
LEMD1-210ENST00000629113 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa45.85■■■■■ 4.93
LEMD1-210ENST00000629113 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP45.84■■■■■ 4.93
LEMD1-210ENST00000629113 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa45.83■■■■■ 4.93
LEMD1-210ENST00000629113 POGZQ7Z3K3 1410 aa45.83■■■■■ 4.93
LEMD1-210ENST00000629113 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa45.8■■■■■ 4.92
LEMD1-210ENST00000629113 CLIP1P30622 1438 aa45.79■■■■■ 4.92
LEMD1-210ENST00000629113 MAGI2Q86UL8 1455 aa45.76■■■■■ 4.92
LEMD1-210ENST00000629113 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP45.74■■■■■ 4.91
LEMD1-210ENST00000629113 ARHGAP5Q13017 1502 aa45.73■■■■■ 4.91
LEMD1-210ENST00000629113 MLECQ14165 292 aa45.68■■■■■ 4.9
LEMD1-210ENST00000629113 CCDC18Q5T9S5 1454 aa45.68■■■■■ 4.9
LEMD1-210ENST00000629113 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP45.67■■■■■ 4.9
LEMD1-210ENST00000629113 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa45.66■■■■■ 4.9
LEMD1-210ENST00000629113 PLPPR3Q6T4P5 718 aa45.64■■■■■ 4.9
LEMD1-210ENST00000629113 AFAP1Q8N556 730 aa45.64■■■■■ 4.9
LEMD1-210ENST00000629113 ATP10AO60312 1499 aa45.6■■■■■ 4.89
LEMD1-210ENST00000629113 FYCO1Q9BQS8 1478 aa45.59■■■■■ 4.89
LEMD1-210ENST00000629113 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa45.55■■■■■ 4.88
LEMD1-210ENST00000629113 PREX2Q70Z35 1606 aa45.54■■■■■ 4.88
LEMD1-210ENST00000629113 C9orf84Q5VXU9 1444 aa45.52■■■■■ 4.88
LEMD1-210ENST00000629113 KDM5CP41229 1560 aa45.51■■■■■ 4.88
LEMD1-210ENST00000629113 MYT1LQ9UL68 1186 aa45.49■■■■■ 4.87
LEMD1-210ENST00000629113 LMTK3Q96Q04 1460 aa45.49■■■■■ 4.87
LEMD1-210ENST00000629113 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa45.48■■■■■ 4.87
LEMD1-210ENST00000629113 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa45.48■■■■■ 4.87
LEMD1-210ENST00000629113 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa45.46■■■■■ 4.87
LEMD1-210ENST00000629113 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa45.45■■■■■ 4.87
LEMD1-210ENST00000629113 ABCC1P33527 1531 aa45.42■■■■■ 4.86
LEMD1-210ENST00000629113 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa45.39■■■■■ 4.86
LEMD1-210ENST00000629113 ITSN2Q9NZM3 1697 aa45.37■■■■■ 4.85
LEMD1-210ENST00000629113 HSPA2P54652 639 aa45.36■■■■■ 4.85
LEMD1-210ENST00000629113 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
LEMD1-210ENST00000629113 ABCA6Q8N139 1617 aa45.34■■■■■ 4.85
LEMD1-210ENST00000629113 MLH3Q9UHC1 1453 aa45.34■■■■■ 4.85
LEMD1-210ENST00000629113 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP45.3■■■■■ 4.84
LEMD1-210ENST00000629113 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP45.29■■■■■ 4.84
LEMD1-210ENST00000629113 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa45.26■■■■■ 4.84
LEMD1-210ENST00000629113 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa45.23■■■■■ 4.83
LEMD1-210ENST00000629113 REREQ9P2R6 1566 aa45.21■■■■■ 4.83
LEMD1-210ENST00000629113 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP45.21■■■■■ 4.83
LEMD1-210ENST00000629113 CEP162Q5TB80 1403 aa45.19■■■■■ 4.83
LEMD1-210ENST00000629113 MTUS2Q5JR59 1369 aa45.19■■■■■ 4.82
LEMD1-210ENST00000629113 SYCP2Q9BX26 1530 aa45.18■■■■■ 4.82
LEMD1-210ENST00000629113 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP45.15■■■■■ 4.82
LEMD1-210ENST00000629113 CCNB3Q8WWL7 1395 aa45.15■■■■■ 4.82
LEMD1-210ENST00000629113 AGLP35573 1532 aa45.11■■■■■ 4.81
LEMD1-210ENST00000629113 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP45.06■■■■■ 4.8
LEMD1-210ENST00000629113 PREX1Q8TCU6 1659 aa45.03■■■■■ 4.8
LEMD1-210ENST00000629113 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
LEMD1-210ENST00000629113 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa45.01■■■■■ 4.8
LEMD1-210ENST00000629113 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.01■■■■■ 4.8
LEMD1-210ENST00000629113 TIAM1Q13009 1591 aa45■■■■■ 4.79
LEMD1-210ENST00000629113 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa44.99■■■■■ 4.79
LEMD1-210ENST00000629113 C3P01024 1663 aa44.99■■■■■ 4.79
LEMD1-210ENST00000629113 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa44.98■■■■■ 4.79
LEMD1-210ENST00000629113 FBXO41Q8TF61 875 aa44.97■■■■■ 4.79
LEMD1-210ENST00000629113 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP44.96■■■■■ 4.79
LEMD1-210ENST00000629113 ATP7AQ04656 1500 aa44.95■■■■■ 4.79
LEMD1-210ENST00000629113 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP44.94■■■■■ 4.78
LEMD1-210ENST00000629113 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
LEMD1-210ENST00000629113 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP44.9■■■■■ 4.78
LEMD1-210ENST00000629113 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa44.88■■■■■ 4.78
LEMD1-210ENST00000629113 A2MP01023 1474 aa44.82■■■■■ 4.77
LEMD1-210ENST00000629113 MBD5Q9P267 1494 aa44.82■■■■■ 4.77
LEMD1-210ENST00000629113 CNTLNQ9NXG0 1405 aa44.8■■■■■ 4.76
LEMD1-210ENST00000629113 STRCQ7RTU9 1775 aa44.79■■■■■ 4.76
LEMD1-210ENST00000629113 PLXNC1O60486 1568 aa44.78■■■■■ 4.76
LEMD1-210ENST00000629113 NCOA2Q15596 1464 aa44.78■■■■■ 4.76
LEMD1-210ENST00000629113 ZMYM3Q14202 1370 aa44.72■■■■■ 4.75
LEMD1-210ENST00000629113 GGT6Q6P531 493 aa44.71■■■■■ 4.75
LEMD1-210ENST00000629113 MROH2AA6NES4 1674 aa44.69■■■■■ 4.74
LEMD1-210ENST00000629113 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.68■■■■■ 4.74
LEMD1-210ENST00000629113 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
LEMD1-210ENST00000629113 ADGBQ8N7X0 1667 aa44.68■■■■■ 4.74
LEMD1-210ENST00000629113 CERKQ8TCT0 537 aa44.66■■■■■ 4.74
LEMD1-210ENST00000629113 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa44.65■■■■■ 4.74
LEMD1-210ENST00000629113 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa44.61■■■■■ 4.73
LEMD1-210ENST00000629113 DMRT2Q9Y5R5 561 aa44.59■■■■■ 4.73
LEMD1-210ENST00000629113 NPATQ14207 1427 aa44.58■■■■■ 4.73
LEMD1-210ENST00000629113 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa44.58■■■■■ 4.73
LEMD1-210ENST00000629113 CCDC141Q6ZP82 1450 aa44.57■■■■■ 4.73
LEMD1-210ENST00000629113 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.55■■■■■ 4.72
LEMD1-210ENST00000629113 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP44.55■■■■■ 4.72
LEMD1-210ENST00000629113 PTPRKQ15262 1439 aa44.5■■■■■ 4.71
LEMD1-210ENST00000629113 NCOA1Q15788 1441 aa44.47■■■■■ 4.71
LEMD1-210ENST00000629113 KIF3BO15066 747 aa44.46■■■■■ 4.71
LEMD1-210ENST00000629113 RSPH4AQ5TD94 716 aa44.46■■■■■ 4.71
LEMD1-210ENST00000629113 PPP6R1Q9UPN7 881 aa44.46■■■■■ 4.71
LEMD1-210ENST00000629113 PTPRTO14522 1441 aa44.46■■■■■ 4.71
LEMD1-210ENST00000629113 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa44.43■■■■■ 4.7
LEMD1-210ENST00000629113 ARHGEF5Q12774 1597 aa44.42■■■■■ 4.7
LEMD1-210ENST00000629113 MYO3AQ8NEV4 1616 aa44.4■■■■■ 4.7
LEMD1-210ENST00000629113 MAP3K1Q13233 1512 aa44.39■■■■■ 4.7
LEMD1-210ENST00000629113 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa44.36■■■■■ 4.69
LEMD1-210ENST00000629113 TSPY4P0CV99 314 aa44.36■■■■■ 4.69
LEMD1-210ENST00000629113 TSPY10P0CW01 314 aa44.36■■■■■ 4.69
LEMD1-210ENST00000629113 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP44.32■■■■■ 4.69
LEMD1-210ENST00000629113 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP44.31■■■■■ 4.68
LEMD1-210ENST00000629113 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP44.3■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms