RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627746.2

PPP4C-214, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PPP4C, Length 1,301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-214ENST00000627746 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
PPP4C-214ENST00000627746 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.68■■■■□ 3.62
PPP4C-214ENST00000627746 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.68■■■■□ 3.62
PPP4C-214ENST00000627746 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.68■■■■□ 3.62
PPP4C-214ENST00000627746 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.67■■■■□ 3.62
PPP4C-214ENST00000627746 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.66■■■■□ 3.62
PPP4C-214ENST00000627746 AFAP1Q8N556 730 aa37.62■■■■□ 3.61
PPP4C-214ENST00000627746 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.62■■■■□ 3.61
PPP4C-214ENST00000627746 PREX2Q70Z35 1606 aa37.59■■■■□ 3.61
PPP4C-214ENST00000627746 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.58■■■■□ 3.61
PPP4C-214ENST00000627746 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.57■■■■□ 3.61
PPP4C-214ENST00000627746 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.57■■■■□ 3.6
PPP4C-214ENST00000627746 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.57■■■■□ 3.6
PPP4C-214ENST00000627746 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.55■■■■□ 3.6
PPP4C-214ENST00000627746 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
PPP4C-214ENST00000627746 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.52■■■■□ 3.6
PPP4C-214ENST00000627746 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.51■■■■□ 3.6
PPP4C-214ENST00000627746 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.51■■■■□ 3.59
PPP4C-214ENST00000627746 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.51■■■■□ 3.59
PPP4C-214ENST00000627746 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.49■■■■□ 3.59
PPP4C-214ENST00000627746 MLECQ14165 292 aa37.49■■■■□ 3.59
PPP4C-214ENST00000627746 PTPRMP28827 1452 aa37.48■■■■□ 3.59
PPP4C-214ENST00000627746 MADDQ8WXG6 1647 aa37.48■■■■□ 3.59
PPP4C-214ENST00000627746 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.47■■■■□ 3.59
PPP4C-214ENST00000627746 ABCC1P33527 1531 aa37.45■■■■□ 3.59
PPP4C-214ENST00000627746 ATP10AO60312 1499 aa37.45■■■■□ 3.59
PPP4C-214ENST00000627746 KDM5CP41229 1560 aa37.43■■■■□ 3.58
PPP4C-214ENST00000627746 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.41■■■■□ 3.58
PPP4C-214ENST00000627746 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.41■■■■□ 3.58
PPP4C-214ENST00000627746 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.41■■■■□ 3.58
PPP4C-214ENST00000627746 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
PPP4C-214ENST00000627746 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.38■■■■□ 3.57
PPP4C-214ENST00000627746 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.37■■■■□ 3.57
PPP4C-214ENST00000627746 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.37■■■■□ 3.57
PPP4C-214ENST00000627746 PLPPR3Q6T4P5 718 aa37.37■■■■□ 3.57
PPP4C-214ENST00000627746 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
PPP4C-214ENST00000627746 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.34■■■■□ 3.57
PPP4C-214ENST00000627746 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.32■■■■□ 3.57
PPP4C-214ENST00000627746 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.32■■■■□ 3.57
PPP4C-214ENST00000627746 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.31■■■■□ 3.56
PPP4C-214ENST00000627746 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.31■■■■□ 3.56
PPP4C-214ENST00000627746 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
PPP4C-214ENST00000627746 ABCA6Q8N139 1617 aa37.28■■■■□ 3.56
PPP4C-214ENST00000627746 TIAM1Q13009 1591 aa37.27■■■■□ 3.56
PPP4C-214ENST00000627746 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.24■■■■□ 3.55
PPP4C-214ENST00000627746 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa37.21■■■■□ 3.55
PPP4C-214ENST00000627746 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.54
PPP4C-214ENST00000627746 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.19■■■■□ 3.54
PPP4C-214ENST00000627746 NCOA2Q15596 1464 aa37.19■■■■□ 3.54
PPP4C-214ENST00000627746 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.17■■■■□ 3.54
PPP4C-214ENST00000627746 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
PPP4C-214ENST00000627746 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
PPP4C-214ENST00000627746 REREQ9P2R6 1566 aa37.14■■■■□ 3.54
PPP4C-214ENST00000627746 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
PPP4C-214ENST00000627746 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.11■■■■□ 3.53
PPP4C-214ENST00000627746 MBD5Q9P267 1494 aa37.06■■■■□ 3.52
PPP4C-214ENST00000627746 ATP7AQ04656 1500 aa37.06■■■■□ 3.52
PPP4C-214ENST00000627746 AGLP35573 1532 aa37.06■■■■□ 3.52
PPP4C-214ENST00000627746 LMTK3Q96Q04 1460 aa37.05■■■■□ 3.52
PPP4C-214ENST00000627746 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
PPP4C-214ENST00000627746 HSPA2P54652 639 aa37■■■■□ 3.51
PPP4C-214ENST00000627746 MAP3K1Q13233 1512 aa36.99■■■■□ 3.51
PPP4C-214ENST00000627746 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.99■■■■□ 3.51
PPP4C-214ENST00000627746 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
PPP4C-214ENST00000627746 A2MP01023 1474 aa36.94■■■■□ 3.5
PPP4C-214ENST00000627746 APLP2Q06481 763 aa36.92■■■■□ 3.5
PPP4C-214ENST00000627746 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.87■■■■□ 3.49
PPP4C-214ENST00000627746 PLXNC1O60486 1568 aa36.87■■■■□ 3.49
PPP4C-214ENST00000627746 GGT6Q6P531 493 aa36.86■■■■□ 3.49
PPP4C-214ENST00000627746 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.86■■■■□ 3.49
PPP4C-214ENST00000627746 C3P01024 1663 aa36.86■■■■□ 3.49
PPP4C-214ENST00000627746 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.85■■■■□ 3.49
PPP4C-214ENST00000627746 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.84■■■■□ 3.49
PPP4C-214ENST00000627746 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.81■■■■□ 3.48
PPP4C-214ENST00000627746 TSPY4P0CV99 314 aa36.78■■■■□ 3.48
PPP4C-214ENST00000627746 TSPY10P0CW01 314 aa36.78■■■■□ 3.48
PPP4C-214ENST00000627746 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.78■■■■□ 3.48
PPP4C-214ENST00000627746 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.78■■■■□ 3.48
PPP4C-214ENST00000627746 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.77■■■■□ 3.48
PPP4C-214ENST00000627746 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
PPP4C-214ENST00000627746 ZMYM3Q14202 1370 aa36.74■■■■□ 3.47
PPP4C-214ENST00000627746 MIA2Q96PC5 1412 aa36.73■■■■□ 3.47
PPP4C-214ENST00000627746 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
PPP4C-214ENST00000627746 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
PPP4C-214ENST00000627746 KIF3BO15066 747 aa36.71■■■■□ 3.47
PPP4C-214ENST00000627746 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.69■■■■□ 3.46
PPP4C-214ENST00000627746 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
PPP4C-214ENST00000627746 MROH2AA6NES4 1674 aa36.67■■■■□ 3.46
PPP4C-214ENST00000627746 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.61■■■■□ 3.45
PPP4C-214ENST00000627746 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.59■■■■□ 3.45
PPP4C-214ENST00000627746 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.57■■■■□ 3.45
PPP4C-214ENST00000627746 NPATQ14207 1427 aa36.55■■■■□ 3.44
PPP4C-214ENST00000627746 PTPRKQ15262 1439 aa36.54■■■■□ 3.44
PPP4C-214ENST00000627746 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.54■■■■□ 3.44
PPP4C-214ENST00000627746 STRCQ7RTU9 1775 aa36.52■■■■□ 3.44
PPP4C-214ENST00000627746 ABCC5O15440 1437 aa36.52■■■■□ 3.44
PPP4C-214ENST00000627746 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.51■■■■□ 3.44
PPP4C-214ENST00000627746 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
PPP4C-214ENST00000627746 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.46■■■■□ 3.43
PPP4C-214ENST00000627746 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
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