RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621456.2

SLC38A3-208, Transcript of solute carrier family 38 member 3, human

TSL 5

Gene SLC38A3, Length 635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A3-208	ENST00000621456	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		28.26	■■■□□ 2.11
SLC38A3-208	ENST00000621456	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		28.24	■■■□□ 2.11
SLC38A3-208	ENST00000621456	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		28.23	■■■□□ 2.11
SLC38A3-208	ENST00000621456	PREX2	Q70Z35	1606 aa		28.2	■■■□□ 2.1
SLC38A3-208	ENST00000621456	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		28.19	■■■□□ 2.1
SLC38A3-208	ENST00000621456	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		28.19	■■■□□ 2.1
SLC38A3-208	ENST00000621456	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
SLC38A3-208	ENST00000621456	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		28.15	■■■□□ 2.1
SLC38A3-208	ENST00000621456	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		28.13	■■■□□ 2.09
SLC38A3-208	ENST00000621456	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		28.13	■■■□□ 2.09
SLC38A3-208	ENST00000621456	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		28.12	■■■□□ 2.09
SLC38A3-208	ENST00000621456	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.11	■■■□□ 2.09
SLC38A3-208	ENST00000621456	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		28.11	■■■□□ 2.09
SLC38A3-208	ENST00000621456	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.09	■■■□□ 2.09
SLC38A3-208	ENST00000621456	KDM5C	P41229	1560 aa		28.08	■■■□□ 2.09
SLC38A3-208	ENST00000621456	ABCC1	P33527	1531 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SLC38A3-208	ENST00000621456	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SLC38A3-208	ENST00000621456	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
SLC38A3-208	ENST00000621456	ATP10A	O60312	1499 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SLC38A3-208	ENST00000621456	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SLC38A3-208	ENST00000621456	AFAP1	Q8N556	730 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SLC38A3-208	ENST00000621456	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SLC38A3-208	ENST00000621456	MADD	Q8WXG6	1647 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SLC38A3-208	ENST00000621456	PTPRM	P28827	1452 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SLC38A3-208	ENST00000621456	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		28.01	■■■□□ 2.08
SLC38A3-208	ENST00000621456	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SLC38A3-208	ENST00000621456	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SLC38A3-208	ENST00000621456	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SLC38A3-208	ENST00000621456	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SLC38A3-208	ENST00000621456	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SLC38A3-208	ENST00000621456	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
SLC38A3-208	ENST00000621456	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
SLC38A3-208	ENST00000621456	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SLC38A3-208	ENST00000621456	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SLC38A3-208	ENST00000621456	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SLC38A3-208	ENST00000621456	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SLC38A3-208	ENST00000621456	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
SLC38A3-208	ENST00000621456	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SLC38A3-208	ENST00000621456	TIAM1	Q13009	1591 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SLC38A3-208	ENST00000621456	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SLC38A3-208	ENST00000621456	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SLC38A3-208	ENST00000621456	RERE	Q9P2R6	1566 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SLC38A3-208	ENST00000621456	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
SLC38A3-208	ENST00000621456	ABCA6	Q8N139	1617 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SLC38A3-208	ENST00000621456	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SLC38A3-208	ENST00000621456	MLEC	Q14165	292 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SLC38A3-208	ENST00000621456	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SLC38A3-208	ENST00000621456	NCOA2	Q15596	1464 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SLC38A3-208	ENST00000621456	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	27.84	■■■□□ 2.05
SLC38A3-208	ENST00000621456	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SLC38A3-208	ENST00000621456	MAP3K1	Q13233	1512 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SLC38A3-208	ENST00000621456	AGL	P35573	1532 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SLC38A3-208	ENST00000621456	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SLC38A3-208	ENST00000621456	ATP7A	Q04656	1500 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SLC38A3-208	ENST00000621456	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
SLC38A3-208	ENST00000621456	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SLC38A3-208	ENST00000621456	MBD5	Q9P267	1494 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SLC38A3-208	ENST00000621456	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SLC38A3-208	ENST00000621456	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SLC38A3-208	ENST00000621456	APLP2	Q06481	763 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SLC38A3-208	ENST00000621456	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
SLC38A3-208	ENST00000621456	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SLC38A3-208	ENST00000621456	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SLC38A3-208	ENST00000621456	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SLC38A3-208	ENST00000621456	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SLC38A3-208	ENST00000621456	A2M	P01023	1474 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SLC38A3-208	ENST00000621456	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SLC38A3-208	ENST00000621456	PLXNC1	O60486	1568 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SLC38A3-208	ENST00000621456	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
SLC38A3-208	ENST00000621456	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
SLC38A3-208	ENST00000621456	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SLC38A3-208	ENST00000621456	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SLC38A3-208	ENST00000621456	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SLC38A3-208	ENST00000621456	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SLC38A3-208	ENST00000621456	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SLC38A3-208	ENST00000621456	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
SLC38A3-208	ENST00000621456	C3	P01024	1663 aa		27.57	■■■□□ 2
SLC38A3-208	ENST00000621456	TSPY4	P0CV99	314 aa		27.55	■■■□□ 2
SLC38A3-208	ENST00000621456	TSPY10	P0CW01	314 aa		27.55	■■■□□ 2
SLC38A3-208	ENST00000621456	MROH2A	A6NES4	1674 aa		27.55	■■■□□ 2
SLC38A3-208	ENST00000621456	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
SLC38A3-208	ENST00000621456	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		27.51	■■□□□ 1.99
SLC38A3-208	ENST00000621456	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		27.5	■■□□□ 1.99
SLC38A3-208	ENST00000621456	HSPA2	P54652	639 aa		27.5	■■□□□ 1.99
SLC38A3-208	ENST00000621456	GGT6	Q6P531	493 aa		27.48	■■□□□ 1.99
SLC38A3-208	ENST00000621456	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		27.47	■■□□□ 1.99
SLC38A3-208	ENST00000621456	ZMYM3	Q14202	1370 aa		27.46	■■□□□ 1.99
SLC38A3-208	ENST00000621456	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
SLC38A3-208	ENST00000621456	NPAT	Q14207	1427 aa		27.44	■■□□□ 1.98
SLC38A3-208	ENST00000621456	KIF3B	O15066	747 aa		27.41	■■□□□ 1.98
SLC38A3-208	ENST00000621456	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.41	■■□□□ 1.98
SLC38A3-208	ENST00000621456	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		27.41	■■□□□ 1.98
SLC38A3-208	ENST00000621456	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		27.38	■■□□□ 1.97
SLC38A3-208	ENST00000621456	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		27.35	■■□□□ 1.97
SLC38A3-208	ENST00000621456	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	27.34	■■□□□ 1.97
SLC38A3-208	ENST00000621456	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		27.33	■■□□□ 1.97
SLC38A3-208	ENST00000621456	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		27.33	■■□□□ 1.97
SLC38A3-208	ENST00000621456	PTPRK	Q15262	1439 aa		27.33	■■□□□ 1.96
SLC38A3-208	ENST00000621456	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	27.31	■■□□□ 1.96
SLC38A3-208	ENST00000621456	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		27.3	■■□□□ 1.96

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