RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619939.4

LHX1-204, Transcript of LIM homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene LHX1, Length 1,840 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1-204ENST00000619939 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
LHX1-204ENST00000619939 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
LHX1-204ENST00000619939 AKNAQ7Z591 1439 aa23.02■■□□□ 1.28
LHX1-204ENST00000619939 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23■■□□□ 1.27
LHX1-204ENST00000619939 FANCAO15360 1455 aa23■■□□□ 1.27
LHX1-204ENST00000619939 HECW2Q9P2P5 1572 aa23■■□□□ 1.27
LHX1-204ENST00000619939 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
LHX1-204ENST00000619939 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.98■■□□□ 1.27
LHX1-204ENST00000619939 KIF14Q15058 1648 aa22.97■■□□□ 1.27
LHX1-204ENST00000619939 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.96■■□□□ 1.27
LHX1-204ENST00000619939 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.95■■□□□ 1.26
LHX1-204ENST00000619939 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
LHX1-204ENST00000619939 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.95■■□□□ 1.26
LHX1-204ENST00000619939 PLCH2O75038 1416 aa22.93■■□□□ 1.26
LHX1-204ENST00000619939 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.93■■□□□ 1.26
LHX1-204ENST00000619939 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LHX1-204ENST00000619939 RICTORQ6R327 1708 aa22.92■■□□□ 1.26
LHX1-204ENST00000619939 PTPRMP28827 1452 aa22.91■■□□□ 1.26
LHX1-204ENST00000619939 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.91■■□□□ 1.26
LHX1-204ENST00000619939 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.9■■□□□ 1.26
LHX1-204ENST00000619939 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.9■■□□□ 1.26
LHX1-204ENST00000619939 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.9■■□□□ 1.26
LHX1-204ENST00000619939 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.9■■□□□ 1.26
LHX1-204ENST00000619939 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.9■■□□□ 1.26
LHX1-204ENST00000619939 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.87■■□□□ 1.25
LHX1-204ENST00000619939 MIA2Q96PC5 1412 aa22.87■■□□□ 1.25
LHX1-204ENST00000619939 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.86■■□□□ 1.25
LHX1-204ENST00000619939 ITGAEP38570 1179 aa22.85■■□□□ 1.25
LHX1-204ENST00000619939 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
LHX1-204ENST00000619939 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.85■■□□□ 1.25
LHX1-204ENST00000619939 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
LHX1-204ENST00000619939 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.84■■□□□ 1.25
LHX1-204ENST00000619939 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
LHX1-204ENST00000619939 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
LHX1-204ENST00000619939 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.81■■□□□ 1.24
LHX1-204ENST00000619939 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.81■■□□□ 1.24
LHX1-204ENST00000619939 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
LHX1-204ENST00000619939 MADDQ8WXG6 1647 aa22.79■■□□□ 1.24
LHX1-204ENST00000619939 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
LHX1-204ENST00000619939 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.76■■□□□ 1.23
LHX1-204ENST00000619939 ATP10AO60312 1499 aa22.76■■□□□ 1.23
LHX1-204ENST00000619939 PREX2Q70Z35 1606 aa22.75■■□□□ 1.23
LHX1-204ENST00000619939 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.74■■□□□ 1.23
LHX1-204ENST00000619939 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
LHX1-204ENST00000619939 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.72■■□□□ 1.23
LHX1-204ENST00000619939 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.72■■□□□ 1.23
LHX1-204ENST00000619939 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.72■■□□□ 1.23
LHX1-204ENST00000619939 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
LHX1-204ENST00000619939 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.71■■□□□ 1.23
LHX1-204ENST00000619939 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.66■■□□□ 1.22
LHX1-204ENST00000619939 KDM5CP41229 1560 aa22.65■■□□□ 1.22
LHX1-204ENST00000619939 MLECQ14165 292 aa22.65■■□□□ 1.22
LHX1-204ENST00000619939 AFAP1Q8N556 730 aa22.64■■□□□ 1.22
LHX1-204ENST00000619939 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.64■■□□□ 1.22
LHX1-204ENST00000619939 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
LHX1-204ENST00000619939 PTPRKQ15262 1439 aa22.63■■□□□ 1.21
LHX1-204ENST00000619939 DAPK1P53355 1430 aa22.63■■□□□ 1.21
LHX1-204ENST00000619939 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.63■■□□□ 1.21
LHX1-204ENST00000619939 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.62■■□□□ 1.21
LHX1-204ENST00000619939 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.62■■□□□ 1.21
LHX1-204ENST00000619939 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.61■■□□□ 1.21
LHX1-204ENST00000619939 ABCC5O15440 1437 aa22.6■■□□□ 1.21
LHX1-204ENST00000619939 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.6■■□□□ 1.21
LHX1-204ENST00000619939 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.6■■□□□ 1.21
LHX1-204ENST00000619939 REREQ9P2R6 1566 aa22.6■■□□□ 1.21
LHX1-204ENST00000619939 FBXO41Q8TF61 875 aa22.59■■□□□ 1.21
LHX1-204ENST00000619939 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.59■■□□□ 1.21
LHX1-204ENST00000619939 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
LHX1-204ENST00000619939 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.56■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 ABCC1P33527 1531 aa22.56■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.55■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.55■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.55■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.54■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 MBD5Q9P267 1494 aa22.54■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.54■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 AGLP35573 1532 aa22.53■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.53■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.53■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 TSPY4P0CV99 314 aa22.53■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 TSPY10P0CW01 314 aa22.53■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 HFM1A2PYH4 1435 aa22.52■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.52■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.52■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.52■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.52■■□□□ 1.2
LHX1-204ENST00000619939 HSPA2P54652 639 aa22.5■■□□□ 1.19
LHX1-204ENST00000619939 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
LHX1-204ENST00000619939 ROCK1Q13464 1354 aa22.5■■□□□ 1.19
LHX1-204ENST00000619939 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
LHX1-204ENST00000619939 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.49■■□□□ 1.19
LHX1-204ENST00000619939 NAIPQ13075 1403 aa22.48■■□□□ 1.19
LHX1-204ENST00000619939 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.48■■□□□ 1.19
LHX1-204ENST00000619939 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
LHX1-204ENST00000619939 ABCA6Q8N139 1617 aa22.47■■□□□ 1.19
LHX1-204ENST00000619939 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.47■■□□□ 1.19
LHX1-204ENST00000619939 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.47■■□□□ 1.19
LHX1-204ENST00000619939 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.46■■□□□ 1.19
LHX1-204ENST00000619939 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.46■■□□□ 1.19
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