RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615024.4

RDM1-217, Transcript of RAD52 motif containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RDM1, Length 617 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1-217ENST00000615024 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RDM1-217ENST00000615024 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RDM1-217ENST00000615024 MIER1Q8N108 512 aa6.91□□□□□ -1.3
RDM1-217ENST00000615024 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.91□□□□□ -1.3
RDM1-217ENST00000615024 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.91□□□□□ -1.3
RDM1-217ENST00000615024 SHROOM2Q13796 1616 aa6.9□□□□□ -1.3
RDM1-217ENST00000615024 PLCD3Q8N3E9 789 aa6.9□□□□□ -1.3
RDM1-217ENST00000615024 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.89□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 JPH4Q96JJ6 628 aa6.89□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 CFAP44Q96MT7 982 aa6.89□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 PHF12Q96QT6 1004 aa6.89□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 CUL7Q14999 1698 aa6.88□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 KLHL34Q8N239 644 aa6.88□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.87□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.87□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 KDM6BO15054 1643 aa6.87□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.86□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 KIF27Q86VH2 1401 aa6.86□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.86□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 MAPKBP1O60336 1514 aa6.86□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa6.86□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 PLEKHG5O94827 1062 aa6.85□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa6.85□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 TSPOAP1O95153 1857 aa6.85□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 ABCC10Q5T3U5 1492 aa6.85□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.84□□□□□ -1.31
RDM1-217ENST00000615024 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa6.83□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 RGL2O15211 777 aa6.83□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 RASEFQ8IZ41 740 aa6.83□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 DIP2BQ9P265 1576 aa6.82□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.82□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 PTPRGP23470 1445 aa6.82□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 SPOCK2Q92563 424 aa6.81□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 PLB1Q6P1J6 1458 aa6.8□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 TEX14Q8IWB6 1497 aa6.8□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 ADCY10Q96PN6 1610 aa6.8□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 NUBP1P53384 320 aa6.8□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 NBR1Q14596 966 aa6.8□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 DCBLD2Q96PD2 775 aa6.8□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 TNIKQ9UKE5 1360 aa6.8□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 IQGAP2Q13576 1575 aa6.79□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 LHX8Q68G74 356 aa6.79□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 HOMEZQ8IX15 550 aa6.79□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.79□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 KIF12Q96FN5 646 aa6.78□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.78□□□□□ -1.32
RDM1-217ENST00000615024 ABCC2Q92887 1545 aa6.77□□□□□ -1.33
RDM1-217ENST00000615024 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RDM1-217ENST00000615024 ASXL2Q76L83 1435 aa6.76□□□□□ -1.33
RDM1-217ENST00000615024 UACAQ9BZF9 1416 aa6.76□□□□□ -1.33
RDM1-217ENST00000615024 GOLGA3Q08378 1498 aa6.75□□□□□ -1.33
RDM1-217ENST00000615024 IGF1RP08069 1367 aa6.75□□□□□ -1.33
RDM1-217ENST00000615024 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RDM1-217ENST00000615024 GLI2P10070 1586 aa6.74□□□□□ -1.33
RDM1-217ENST00000615024 MAP3K13O43283 966 aa6.74□□□□□ -1.33
RDM1-217ENST00000615024 TRPC6Q9Y210 931 aa6.74□□□□□ -1.33
RDM1-217ENST00000615024 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa6.73□□□□□ -1.33
RDM1-217ENST00000615024 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RDM1-217ENST00000615024 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.73□□□□□ -1.33
RDM1-217ENST00000615024 ADGRL1O94910 1474 aa6.72□□□□□ -1.33
RDM1-217ENST00000615024 POTEB2H3BUK9 544 aa6.71□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa6.71□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 KIAA0556O60303 1618 aa6.7□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.69□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 WDR7Q9Y4E6 1490 aa6.69□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.69□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 CHGAP10645 457 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.69□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.69□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.69□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa6.68□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 KCNH8Q96L42 1107 aa6.68□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.68□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.67□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 C14orf37Q86TY3 774 aa6.67□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 FAM212AQ96EL1 285 aa6.67□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 CD109Q6YHK3 1445 aa6.67□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 DISP1Q96F81 1524 aa6.66□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 TIE1P35590 1138 aa6.66□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.66□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 POTEFA5A3E0 1075 aa6.65□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 POTEJP0CG39 1038 aa6.65□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 IFNL1Q8IU54 200 aa6.65□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 OTUD5Q96G74 571 aa6.65□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 METRNQ9UJH8 293 aa6.65□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.65□□□□□ -1.34
RDM1-217ENST00000615024 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
RDM1-217ENST00000615024 HECW2Q9P2P5 1572 aa6.65□□□□□ -1.35
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