RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PVT1-222	ENST00000613916	ILDR2	Q71H61	639 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PVT1-222	ENST00000613916	CERK	Q8TCT0	537 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PVT1-222	ENST00000613916	ATP10B	O94823	1461 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PVT1-222	ENST00000613916	RICTOR	Q6R327	1708 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PVT1-222	ENST00000613916	RAPGEF3	O95398	923 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PVT1-222	ENST00000613916	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PVT1-222	ENST00000613916	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PVT1-222	ENST00000613916	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PVT1-222	ENST00000613916	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		11.27	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	FANCA	O15360	1455 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	HSPA2	P54652	639 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	NCOA2	Q15596	1464 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	ARID3C	A6NKF2	412 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	KIF14	Q15058	1648 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	AKNA	Q7Z591	1439 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PVT1-222	ENST00000613916	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		11.21	□□□□□ -0.62
PVT1-222	ENST00000613916	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PVT1-222	ENST00000613916	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PVT1-222	ENST00000613916	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PVT1-222	ENST00000613916	STRC	Q7RTU9	1775 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PVT1-222	ENST00000613916	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PVT1-222	ENST00000613916	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PVT1-222	ENST00000613916	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PVT1-222	ENST00000613916	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PVT1-222	ENST00000613916	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PVT1-222	ENST00000613916	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PVT1-222	ENST00000613916	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PVT1-222	ENST00000613916	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
PVT1-222	ENST00000613916	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PVT1-222	ENST00000613916	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PVT1-222	ENST00000613916	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PVT1-222	ENST00000613916	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.63
PVT1-222	ENST00000613916	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PVT1-222	ENST00000613916	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PVT1-222	ENST00000613916	PTPRT	O14522	1441 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PVT1-222	ENST00000613916	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PVT1-222	ENST00000613916	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PVT1-222	ENST00000613916	MIA2	Q96PC5	1412 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PVT1-222	ENST00000613916	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PVT1-222	ENST00000613916	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PVT1-222	ENST00000613916	PREX2	Q70Z35	1606 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PVT1-222	ENST00000613916	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PVT1-222	ENST00000613916	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PVT1-222	ENST00000613916	ATP10A	O60312	1499 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PVT1-222	ENST00000613916	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PVT1-222	ENST00000613916	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
PVT1-222	ENST00000613916	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	RERE	Q9P2R6	1566 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	PTPRK	Q15262	1439 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	MLEC	Q14165	292 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	KDM5C	P41229	1560 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	PLCH2	O75038	1416 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	C3	P01024	1663 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	NCOA1	Q15788	1441 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	ITGAE	P38570	1179 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
PVT1-222	ENST00000613916	HRC	P23327	699 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	DAPK1	P53355	1430 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	AGL	P35573	1532 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	ABCC5	O15440	1437 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	ABCA6	Q8N139	1617 aa		11	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		11	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		11	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	HFM1	A2PYH4	1435 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	NAIP	Q13075	1403 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	MBD5	Q9P267	1494 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	MROH2A	A6NES4	1674 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	ABCC1	P33527	1531 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PVT1-222	ENST00000613916	ADGRL2	O95490	1459 aa		10.96	□□□□□ -0.65

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