RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613850.4

GGTLC2-204, Transcript of gamma-glutamyltransferase light chain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGTLC2, Length 973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC2-204ENST00000613850 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.53■■■□□ 2.64
GGTLC2-204ENST00000613850 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
GGTLC2-204ENST00000613850 ADGRL1O94910 1474 aa31.51■■■□□ 2.63
GGTLC2-204ENST00000613850 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.5■■■□□ 2.63
GGTLC2-204ENST00000613850 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.5■■■□□ 2.63
GGTLC2-204ENST00000613850 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
GGTLC2-204ENST00000613850 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
GGTLC2-204ENST00000613850 NCOA2Q15596 1464 aa31.46■■■□□ 2.63
GGTLC2-204ENST00000613850 RAPGEF3O95398 923 aa31.45■■■□□ 2.63
GGTLC2-204ENST00000613850 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
GGTLC2-204ENST00000613850 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.44■■■□□ 2.62
GGTLC2-204ENST00000613850 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
GGTLC2-204ENST00000613850 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.42■■■□□ 2.62
GGTLC2-204ENST00000613850 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.4■■■□□ 2.62
GGTLC2-204ENST00000613850 RICTORQ6R327 1708 aa31.39■■■□□ 2.62
GGTLC2-204ENST00000613850 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
GGTLC2-204ENST00000613850 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.38■■■□□ 2.61
GGTLC2-204ENST00000613850 ABCC1P33527 1531 aa31.35■■■□□ 2.61
GGTLC2-204ENST00000613850 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.33■■■□□ 2.61
GGTLC2-204ENST00000613850 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.33■■■□□ 2.61
GGTLC2-204ENST00000613850 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.32■■■□□ 2.6
GGTLC2-204ENST00000613850 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.31■■■□□ 2.6
GGTLC2-204ENST00000613850 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.27■■■□□ 2.6
GGTLC2-204ENST00000613850 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.27■■■□□ 2.6
GGTLC2-204ENST00000613850 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.26■■■□□ 2.59
GGTLC2-204ENST00000613850 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.25■■■□□ 2.59
GGTLC2-204ENST00000613850 AFAP1Q8N556 730 aa31.24■■■□□ 2.59
GGTLC2-204ENST00000613850 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.24■■■□□ 2.59
GGTLC2-204ENST00000613850 KDM5CP41229 1560 aa31.23■■■□□ 2.59
GGTLC2-204ENST00000613850 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.23■■■□□ 2.59
GGTLC2-204ENST00000613850 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.22■■■□□ 2.59
GGTLC2-204ENST00000613850 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.21■■■□□ 2.59
GGTLC2-204ENST00000613850 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.2■■■□□ 2.59
GGTLC2-204ENST00000613850 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
GGTLC2-204ENST00000613850 MIA2Q96PC5 1412 aa31.19■■■□□ 2.58
GGTLC2-204ENST00000613850 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.19■■■□□ 2.58
GGTLC2-204ENST00000613850 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.18■■■□□ 2.58
GGTLC2-204ENST00000613850 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.17■■■□□ 2.58
GGTLC2-204ENST00000613850 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.15■■■□□ 2.58
GGTLC2-204ENST00000613850 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.14■■■□□ 2.58
GGTLC2-204ENST00000613850 MBD5Q9P267 1494 aa31.11■■■□□ 2.57
GGTLC2-204ENST00000613850 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
GGTLC2-204ENST00000613850 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.1■■■□□ 2.57
GGTLC2-204ENST00000613850 ATP10AO60312 1499 aa31.08■■■□□ 2.57
GGTLC2-204ENST00000613850 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.07■■■□□ 2.56
GGTLC2-204ENST00000613850 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.07■■■□□ 2.56
GGTLC2-204ENST00000613850 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.05■■■□□ 2.56
GGTLC2-204ENST00000613850 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.05■■■□□ 2.56
GGTLC2-204ENST00000613850 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
GGTLC2-204ENST00000613850 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.03■■■□□ 2.56
GGTLC2-204ENST00000613850 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.03■■■□□ 2.56
GGTLC2-204ENST00000613850 ATP7AQ04656 1500 aa31.03■■■□□ 2.56
GGTLC2-204ENST00000613850 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.02■■■□□ 2.56
GGTLC2-204ENST00000613850 ABCA6Q8N139 1617 aa31.01■■■□□ 2.55
GGTLC2-204ENST00000613850 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
GGTLC2-204ENST00000613850 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
GGTLC2-204ENST00000613850 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
GGTLC2-204ENST00000613850 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.98■■■□□ 2.55
GGTLC2-204ENST00000613850 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.98■■■□□ 2.55
GGTLC2-204ENST00000613850 TSPY4P0CV99 314 aa30.97■■■□□ 2.55
GGTLC2-204ENST00000613850 TSPY10P0CW01 314 aa30.97■■■□□ 2.55
GGTLC2-204ENST00000613850 REREQ9P2R6 1566 aa30.96■■■□□ 2.55
GGTLC2-204ENST00000613850 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.9■■■□□ 2.54
GGTLC2-204ENST00000613850 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
GGTLC2-204ENST00000613850 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.9■■■□□ 2.54
GGTLC2-204ENST00000613850 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
GGTLC2-204ENST00000613850 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.87■■■□□ 2.53
GGTLC2-204ENST00000613850 A2MP01023 1474 aa30.86■■■□□ 2.53
GGTLC2-204ENST00000613850 AGLP35573 1532 aa30.86■■■□□ 2.53
GGTLC2-204ENST00000613850 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.86■■■□□ 2.53
GGTLC2-204ENST00000613850 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
GGTLC2-204ENST00000613850 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.84■■■□□ 2.53
GGTLC2-204ENST00000613850 ABCC5O15440 1437 aa30.84■■■□□ 2.53
GGTLC2-204ENST00000613850 DAPK1P53355 1430 aa30.84■■■□□ 2.53
GGTLC2-204ENST00000613850 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.84■■■□□ 2.53
GGTLC2-204ENST00000613850 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.82■■■□□ 2.52
GGTLC2-204ENST00000613850 MLECQ14165 292 aa30.82■■■□□ 2.52
GGTLC2-204ENST00000613850 PLXNC1O60486 1568 aa30.81■■■□□ 2.52
GGTLC2-204ENST00000613850 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
GGTLC2-204ENST00000613850 MADDQ8WXG6 1647 aa30.76■■■□□ 2.52
GGTLC2-204ENST00000613850 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.73■■■□□ 2.51
GGTLC2-204ENST00000613850 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.7■■■□□ 2.51
GGTLC2-204ENST00000613850 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
GGTLC2-204ENST00000613850 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.69■■■□□ 2.5
GGTLC2-204ENST00000613850 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
GGTLC2-204ENST00000613850 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
GGTLC2-204ENST00000613850 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.68■■■□□ 2.5
GGTLC2-204ENST00000613850 PTPRMP28827 1452 aa30.68■■■□□ 2.5
GGTLC2-204ENST00000613850 KIF15Q9NS87 1388 aa30.67■■■□□ 2.5
GGTLC2-204ENST00000613850 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.67■■■□□ 2.5
GGTLC2-204ENST00000613850 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.64■■■□□ 2.5
GGTLC2-204ENST00000613850 ADGRL2O95490 1459 aa30.63■■■□□ 2.49
GGTLC2-204ENST00000613850 KIF3BO15066 747 aa30.63■■■□□ 2.49
GGTLC2-204ENST00000613850 GGT6Q6P531 493 aa30.63■■■□□ 2.49
GGTLC2-204ENST00000613850 NCOA1Q15788 1441 aa30.62■■■□□ 2.49
GGTLC2-204ENST00000613850 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.6■■■□□ 2.49
GGTLC2-204ENST00000613850 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
GGTLC2-204ENST00000613850 ERBINQ96RT1 1412 aa30.59■■■□□ 2.49
GGTLC2-204ENST00000613850 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.59■■■□□ 2.49
GGTLC2-204ENST00000613850 ITGAEP38570 1179 aa30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms