RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612972.1

TTLL9-208, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 9, human

TSL 3

Gene TTLL9, Length 1,024 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL9-208	ENST00000612972	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL9-208	ENST00000612972	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		11.44	□□□□□ -0.58
TTLL9-208	ENST00000612972	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL9-208	ENST00000612972	AFAP1	Q8N556	730 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL9-208	ENST00000612972	PTPRM	P28827	1452 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL9-208	ENST00000612972	HECW1	Q76N89	1606 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TTLL9-208	ENST00000612972	CLIP1	P30622	1438 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TTLL9-208	ENST00000612972	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TTLL9-208	ENST00000612972	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TTLL9-208	ENST00000612972	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		11.4	□□□□□ -0.58
TTLL9-208	ENST00000612972	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TTLL9-208	ENST00000612972	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		11.39	□□□□□ -0.59
TTLL9-208	ENST00000612972	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
TTLL9-208	ENST00000612972	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL9-208	ENST00000612972	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL9-208	ENST00000612972	RICTOR	Q6R327	1708 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL9-208	ENST00000612972	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL9-208	ENST00000612972	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL9-208	ENST00000612972	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL9-208	ENST00000612972	HSPA2	P54652	639 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL9-208	ENST00000612972	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL9-208	ENST00000612972	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TTLL9-208	ENST00000612972	KIF14	Q15058	1648 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL9-208	ENST00000612972	MADD	Q8WXG6	1647 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL9-208	ENST00000612972	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL9-208	ENST00000612972	ATP10A	O60312	1499 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL9-208	ENST00000612972	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL9-208	ENST00000612972	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL9-208	ENST00000612972	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL9-208	ENST00000612972	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL9-208	ENST00000612972	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	11.32	□□□□□ -0.6
TTLL9-208	ENST00000612972	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL9-208	ENST00000612972	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TTLL9-208	ENST00000612972	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL9-208	ENST00000612972	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL9-208	ENST00000612972	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL9-208	ENST00000612972	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL9-208	ENST00000612972	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL9-208	ENST00000612972	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL9-208	ENST00000612972	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL9-208	ENST00000612972	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL9-208	ENST00000612972	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		11.27	□□□□□ -0.6
TTLL9-208	ENST00000612972	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL9-208	ENST00000612972	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL9-208	ENST00000612972	FBXO41	Q8TF61	875 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL9-208	ENST00000612972	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TTLL9-208	ENST00000612972	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL9-208	ENST00000612972	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TTLL9-208	ENST00000612972	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TTLL9-208	ENST00000612972	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TTLL9-208	ENST00000612972	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL9-208	ENST00000612972	GGT6	Q6P531	493 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL9-208	ENST00000612972	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TTLL9-208	ENST00000612972	KDM5C	P41229	1560 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TTLL9-208	ENST00000612972	PREX2	Q70Z35	1606 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TTLL9-208	ENST00000612972	ABCC1	P33527	1531 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL9-208	ENST00000612972	CEP162	Q5TB80	1403 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL9-208	ENST00000612972	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL9-208	ENST00000612972	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	CERK	Q8TCT0	537 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	ABCA6	Q8N139	1617 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	ZBTB22	O15209	634 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	ZMYM3	Q14202	1370 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	AGL	P35573	1532 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	TSPY4	P0CV99	314 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	TSPY10	P0CW01	314 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	RERE	Q9P2R6	1566 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL9-208	ENST00000612972	A2M	P01023	1474 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	KIF3B	O15066	747 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	APLP2	Q06481	763 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	ATP7A	Q04656	1500 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	C3	P01024	1663 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	TIAM1	Q13009	1591 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	NCOA2	Q15596	1464 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	MBD5	Q9P267	1494 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL9-208	ENST00000612972	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL9-208	ENST00000612972	NPAT	Q14207	1427 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL9-208	ENST00000612972	STRC	Q7RTU9	1775 aa		11.06	□□□□□ -0.64

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