RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612323.4

TMEM230-210, Transcript of transmembrane protein 230, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM230, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM230-210ENST00000612323 PTPRMP28827 1452 aa34.46■■■■□ 3.11
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TMEM230-210ENST00000612323 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.43■■■■□ 3.1
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TMEM230-210ENST00000612323 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.34■■■■□ 3.09
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TMEM230-210ENST00000612323 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.25■■■■□ 3.07
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TMEM230-210ENST00000612323 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.16■■■■□ 3.06
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TMEM230-210ENST00000612323 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.14■■■■□ 3.06
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TMEM230-210ENST00000612323 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.97■■■■□ 3.03
TMEM230-210ENST00000612323 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.96■■■■□ 3.03
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TMEM230-210ENST00000612323 AGLP35573 1532 aa33.91■■■■□ 3.02
TMEM230-210ENST00000612323 TIAM1Q13009 1591 aa33.9■■■■□ 3.02
TMEM230-210ENST00000612323 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.89■■■■□ 3.02
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TMEM230-210ENST00000612323 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa33.35■■■□□ 2.93
TMEM230-210ENST00000612323 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
TMEM230-210ENST00000612323 PTPRTO14522 1441 aa33.34■■■□□ 2.93
TMEM230-210ENST00000612323 DMRT2Q9Y5R5 561 aa33.33■■■□□ 2.93
TMEM230-210ENST00000612323 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.33■■■□□ 2.93
TMEM230-210ENST00000612323 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.3■■■□□ 2.92
TMEM230-210ENST00000612323 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
TMEM230-210ENST00000612323 MIA2Q96PC5 1412 aa33.28■■■□□ 2.92
TMEM230-210ENST00000612323 TSPY4P0CV99 314 aa33.27■■■□□ 2.92
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