RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603038.1

CHCHD2P3-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2 pseudogene 3, humanhuman

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Gene CHCHD2P3, Length 451 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2P3-201ENST00000603038 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.28■■□□□ 1.64
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.26■■□□□ 1.63
CHCHD2P3-201ENST00000603038 AFAP1Q8N556 730 aa25.25■■□□□ 1.63
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.25■■□□□ 1.63
CHCHD2P3-201ENST00000603038 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.24■■□□□ 1.63
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.23■■□□□ 1.63
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.22■■□□□ 1.63
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.21■■□□□ 1.63
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.2■■□□□ 1.62
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.19■■□□□ 1.62
CHCHD2P3-201ENST00000603038 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.18■■□□□ 1.62
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.17■■□□□ 1.62
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.17■■□□□ 1.62
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PREX2Q70Z35 1606 aa25.16■■□□□ 1.62
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.16■■□□□ 1.62
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CHCHD2P3-201ENST00000603038 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.13■■□□□ 1.61
CHCHD2P3-201ENST00000603038 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MLECQ14165 292 aa25.13■■□□□ 1.61
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PTPRMP28827 1452 aa25.13■■□□□ 1.61
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.11■■□□□ 1.61
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.11■■□□□ 1.61
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MADDQ8WXG6 1647 aa25.11■■□□□ 1.61
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ATP10AO60312 1499 aa25.1■■□□□ 1.61
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.1■■□□□ 1.61
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ABCC1P33527 1531 aa25.08■■□□□ 1.61
CHCHD2P3-201ENST00000603038 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
CHCHD2P3-201ENST00000603038 KDM5CP41229 1560 aa25.08■■□□□ 1.61
CHCHD2P3-201ENST00000603038 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.08■■□□□ 1.61
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.05■■□□□ 1.6
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.05■■□□□ 1.6
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.04■■□□□ 1.6
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.04■■□□□ 1.6
CHCHD2P3-201ENST00000603038 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.03■■□□□ 1.6
CHCHD2P3-201ENST00000603038 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.02■■□□□ 1.6
CHCHD2P3-201ENST00000603038 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25■■□□□ 1.59
CHCHD2P3-201ENST00000603038 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.98■■□□□ 1.59
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ABCA6Q8N139 1617 aa24.97■■□□□ 1.59
CHCHD2P3-201ENST00000603038 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.97■■□□□ 1.59
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.97■■□□□ 1.59
CHCHD2P3-201ENST00000603038 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.97■■□□□ 1.59
CHCHD2P3-201ENST00000603038 TIAM1Q13009 1591 aa24.96■■□□□ 1.59
CHCHD2P3-201ENST00000603038 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.94■■□□□ 1.58
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CHCHD2P3-201ENST00000603038 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CHCHD2P3-201ENST00000603038 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.91■■□□□ 1.58
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NCOA2Q15596 1464 aa24.9■■□□□ 1.58
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.89■■□□□ 1.57
CHCHD2P3-201ENST00000603038 REREQ9P2R6 1566 aa24.88■■□□□ 1.57
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MBD5Q9P267 1494 aa24.86■■□□□ 1.57
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CHCHD2P3-201ENST00000603038 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.85■■□□□ 1.57
CHCHD2P3-201ENST00000603038 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.84■■□□□ 1.57
CHCHD2P3-201ENST00000603038 AGLP35573 1532 aa24.84■■□□□ 1.57
CHCHD2P3-201ENST00000603038 HSPA2P54652 639 aa24.83■■□□□ 1.57
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ATP7AQ04656 1500 aa24.81■■□□□ 1.56
CHCHD2P3-201ENST00000603038 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MAP3K1Q13233 1512 aa24.77■■□□□ 1.56
CHCHD2P3-201ENST00000603038 A2MP01023 1474 aa24.76■■□□□ 1.55
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.76■■□□□ 1.55
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CHCHD2P3-201ENST00000603038 GGT6Q6P531 493 aa24.71■■□□□ 1.55
CHCHD2P3-201ENST00000603038 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.7■■□□□ 1.55
CHCHD2P3-201ENST00000603038 C3P01024 1663 aa24.7■■□□□ 1.54
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PLXNC1O60486 1568 aa24.7■■□□□ 1.54
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CHCHD2P3-201ENST00000603038 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.69■■□□□ 1.54
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.69■■□□□ 1.54
CHCHD2P3-201ENST00000603038 APLP2Q06481 763 aa24.68■■□□□ 1.54
CHCHD2P3-201ENST00000603038 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.66■■□□□ 1.54
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ZMYM3Q14202 1370 aa24.65■■□□□ 1.54
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.64■■□□□ 1.54
CHCHD2P3-201ENST00000603038 TSPY4P0CV99 314 aa24.64■■□□□ 1.54
CHCHD2P3-201ENST00000603038 TSPY10P0CW01 314 aa24.64■■□□□ 1.54
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.63■■□□□ 1.53
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.62■■□□□ 1.53
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.62■■□□□ 1.53
CHCHD2P3-201ENST00000603038 KIF3BO15066 747 aa24.61■■□□□ 1.53
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MIA2Q96PC5 1412 aa24.61■■□□□ 1.53
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CHCHD2P3-201ENST00000603038 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.58■■□□□ 1.53
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.55■■□□□ 1.52
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MROH2AA6NES4 1674 aa24.55■■□□□ 1.52
CHCHD2P3-201ENST00000603038 STRCQ7RTU9 1775 aa24.51■■□□□ 1.51
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PTPRKQ15262 1439 aa24.51■■□□□ 1.51
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NPATQ14207 1427 aa24.5■■□□□ 1.51
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.5■■□□□ 1.51
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ABCC5O15440 1437 aa24.49■■□□□ 1.51
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.49■■□□□ 1.51
CHCHD2P3-201ENST00000603038 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CHCHD2P3-201ENST00000603038 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.47■■□□□ 1.51
CHCHD2P3-201ENST00000603038 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.45■■□□□ 1.5
CHCHD2P3-201ENST00000603038 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.44■■□□□ 1.5
CHCHD2P3-201ENST00000603038 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
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