RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601396.5

PCBP1-AS1-257, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 679 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ARID3CA6NKF2 412 aa11.32□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 APBB1O00213 710 aa11.32□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 FAM117AQ9C073 453 aa11.32□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.29□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 FLIIQ13045 1269 aa11.28□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 MAP3K13O43283 966 aa11.27□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 DDRGK1Q96HY6 314 aa11.26□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ZBTB7CA1YPR0 619 aa11.24□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PLEKHG3A1L390 1219 aa11.22□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 DPYSL4O14531 572 aa11.22□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.22□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 GOLGA2Q08379 1002 aa11.21□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 KIF12Q96FN5 646 aa11.21□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 GPR37O15354 613 aa11.18□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 POTEDQ86YR6 584 aa11.18□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PDIA6Q15084 440 aa11.17□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 CCDC102AQ96A19 550 aa11.17□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 MAP2K5Q13163 448 aa11.15□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 NUTM2FA1L443 756 aa11.14□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.14□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 CCDC82Q8N4S0 544 aa11.14□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 EMILIN3Q9NT22 766 aa11.14□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 A6NJR5 290 aa11.13□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 IRF6O14896 467 aa11.13□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 AMHR2Q16671 573 aa11.13□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TRAK2O60296 914 aa11.12□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 CLUAP1Q96AJ1 413 aa11.12□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 GOPCQ9HD26 462 aa11.11□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 GRXCR2A6NFK2 248 aa11.08□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 NECTIN2Q92692 538 aa11.08□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.07□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 GNPATO15228 680 aa11.06□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 DSG2Q14126 1118 aa11.06□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 FCHSD2O94868 740 aa11.02□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 HIC1Q14526 733 aa11.02□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TMC2Q8TDI7 906 aa11.01□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 FECHP22830 423 aa10.99□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 MCM6Q14566 821 aa10.99□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 MAP3K9P80192 1104 aa10.98□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.98□□□□□ -0.654e-7■■□□□ 11.4
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ZRANB1Q9UGI0 708 aa10.98□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 MS4A1P11836 297 aa10.97□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 OSBPP22059 807 aa10.97□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 FOXK1P85037 733 aa10.97□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.96□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PHF12Q96QT6 1004 aa10.96□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PLPP6Q8IY26 295 aa10.95□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TRAIPQ9BWF2 469 aa10.94□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SERPINA10Q9UK55 444 aa10.94□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 RAD21O60216 631 aa10.93□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.93□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP10.92□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 AEBP1Q8IUX7 1158 aa10.91□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TRPC6Q9Y210 931 aa10.91□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 MICALL2Q8IY33 904 aa10.9□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 DDX12PQ92771 950 aa10.9□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 POM121Q96HA1 1249 aa10.89□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 CD44P16070 742 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 DPY19L2Q6NUT2 758 aa10.87□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP10.87□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PTGER2P43116 358 aa10.86□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PTGDRQ13258 359 aa10.86□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 CLCN1P35523 988 aa10.85□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 OXER1Q8TDS5 423 aa10.85□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.85□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 C2orf72A6NCS6 295 aa10.84□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 GPCPD1Q9NPB8 672 aa10.82□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TTLL13PA6NNM8 815 aa10.81□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TIE1P35590 1138 aa10.81□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 RETREG2Q8NC44 543 aa10.8□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TMUB1Q9BVT8 246 aa10.8□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 POLR3EQ9NVU0 708 aa10.8□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 TBC1D12O60347 775 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 BEGAINQ9BUH8 593 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-257ENST00000601396 PLSCR2Q9NRY7 297 aa10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms