RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600277.5

SLC27A1-208, Transcript of solute carrier family 27 member 1, human

TSL 2

Gene SLC27A1, Length 1,423 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC27A1-208	ENST00000600277	FANCA	O15360	1455 aa		34.12	■■■■□ 3.05
SLC27A1-208	ENST00000600277	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		34.11	■■■■□ 3.05
SLC27A1-208	ENST00000600277	NEO1	Q92859	1461 aa		34.09	■■■■□ 3.05
SLC27A1-208	ENST00000600277	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		34.09	■■■■□ 3.05
SLC27A1-208	ENST00000600277	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		34.08	■■■■□ 3.05
SLC27A1-208	ENST00000600277	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		34.06	■■■■□ 3.04
SLC27A1-208	ENST00000600277	PREX2	Q70Z35	1606 aa		34.06	■■■■□ 3.04
SLC27A1-208	ENST00000600277	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	34.05	■■■■□ 3.04
SLC27A1-208	ENST00000600277	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		34.05	■■■■□ 3.04
SLC27A1-208	ENST00000600277	AKNA	Q7Z591	1439 aa		34.03	■■■■□ 3.04
SLC27A1-208	ENST00000600277	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		34.03	■■■■□ 3.04
SLC27A1-208	ENST00000600277	MIA2	Q96PC5	1412 aa		34.02	■■■■□ 3.04
SLC27A1-208	ENST00000600277	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	34.01	■■■■□ 3.03
SLC27A1-208	ENST00000600277	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.99	■■■■□ 3.03
SLC27A1-208	ENST00000600277	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.97	■■■■□ 3.03
SLC27A1-208	ENST00000600277	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		33.96	■■■■□ 3.03
SLC27A1-208	ENST00000600277	ADGRL1	O94910	1474 aa		33.95	■■■■□ 3.02
SLC27A1-208	ENST00000600277	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		33.91	■■■■□ 3.02
SLC27A1-208	ENST00000600277	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.9	■■■■□ 3.02
SLC27A1-208	ENST00000600277	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	33.88	■■■■□ 3.01
SLC27A1-208	ENST00000600277	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	33.87	■■■■□ 3.01
SLC27A1-208	ENST00000600277	RAPGEF3	O95398	923 aa		33.87	■■■■□ 3.01
SLC27A1-208	ENST00000600277	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.86	■■■■□ 3.01
SLC27A1-208	ENST00000600277	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.86	■■■■□ 3.01
SLC27A1-208	ENST00000600277	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.86	■■■■□ 3.01
SLC27A1-208	ENST00000600277	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.84	■■■■□ 3.01
SLC27A1-208	ENST00000600277	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.84	■■■■□ 3.01
SLC27A1-208	ENST00000600277	ABCC1	P33527	1531 aa		33.81	■■■■□ 3
SLC27A1-208	ENST00000600277	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.8	■■■■□ 3
SLC27A1-208	ENST00000600277	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.8	■■■■□ 3
SLC27A1-208	ENST00000600277	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.8	■■■■□ 3
SLC27A1-208	ENST00000600277	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.79	■■■■□ 3
SLC27A1-208	ENST00000600277	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.78	■■■■□ 3
SLC27A1-208	ENST00000600277	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.77	■■■■□ 3
SLC27A1-208	ENST00000600277	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.75	■■■□□ 2.99
SLC27A1-208	ENST00000600277	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.75	■■■□□ 2.99
SLC27A1-208	ENST00000600277	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.74	■■■□□ 2.99
SLC27A1-208	ENST00000600277	RICTOR	Q6R327	1708 aa		33.73	■■■□□ 2.99
SLC27A1-208	ENST00000600277	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	33.71	■■■□□ 2.99
SLC27A1-208	ENST00000600277	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.71	■■■□□ 2.99
SLC27A1-208	ENST00000600277	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.71	■■■□□ 2.99
SLC27A1-208	ENST00000600277	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		33.7	■■■□□ 2.99
SLC27A1-208	ENST00000600277	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.7	■■■□□ 2.98
SLC27A1-208	ENST00000600277	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.67	■■■□□ 2.98
SLC27A1-208	ENST00000600277	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.64	■■■□□ 2.98
SLC27A1-208	ENST00000600277	ABCC5	O15440	1437 aa		33.63	■■■□□ 2.97
SLC27A1-208	ENST00000600277	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.63	■■■□□ 2.97
SLC27A1-208	ENST00000600277	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.61	■■■□□ 2.97
SLC27A1-208	ENST00000600277	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
SLC27A1-208	ENST00000600277	KDM5C	P41229	1560 aa		33.61	■■■□□ 2.97
SLC27A1-208	ENST00000600277	DAPK1	P53355	1430 aa		33.61	■■■□□ 2.97
SLC27A1-208	ENST00000600277	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.6	■■■□□ 2.97
SLC27A1-208	ENST00000600277	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.6	■■■□□ 2.97
SLC27A1-208	ENST00000600277	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.96
SLC27A1-208	ENST00000600277	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.56	■■■□□ 2.96
SLC27A1-208	ENST00000600277	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.54	■■■□□ 2.96
SLC27A1-208	ENST00000600277	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.54	■■■□□ 2.96
SLC27A1-208	ENST00000600277	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.54	■■■□□ 2.96
SLC27A1-208	ENST00000600277	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.53	■■■□□ 2.96
SLC27A1-208	ENST00000600277	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.51	■■■□□ 2.96
SLC27A1-208	ENST00000600277	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.51	■■■□□ 2.96
SLC27A1-208	ENST00000600277	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.5	■■■□□ 2.95
SLC27A1-208	ENST00000600277	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		33.48	■■■□□ 2.95
SLC27A1-208	ENST00000600277	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SLC27A1-208	ENST00000600277	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.46	■■■□□ 2.95
SLC27A1-208	ENST00000600277	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.46	■■■□□ 2.95
SLC27A1-208	ENST00000600277	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.45	■■■□□ 2.94
SLC27A1-208	ENST00000600277	ITGAE	P38570	1179 aa		33.45	■■■□□ 2.94
SLC27A1-208	ENST00000600277	ATP10A	O60312	1499 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SLC27A1-208	ENST00000600277	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
SLC27A1-208	ENST00000600277	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SLC27A1-208	ENST00000600277	ADGRL2	O95490	1459 aa		33.41	■■■□□ 2.94
SLC27A1-208	ENST00000600277	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		33.41	■■■□□ 2.94
SLC27A1-208	ENST00000600277	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SLC27A1-208	ENST00000600277	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SLC27A1-208	ENST00000600277	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SLC27A1-208	ENST00000600277	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SLC27A1-208	ENST00000600277	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
SLC27A1-208	ENST00000600277	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SLC27A1-208	ENST00000600277	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SLC27A1-208	ENST00000600277	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SLC27A1-208	ENST00000600277	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SLC27A1-208	ENST00000600277	A2M	P01023	1474 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SLC27A1-208	ENST00000600277	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SLC27A1-208	ENST00000600277	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SLC27A1-208	ENST00000600277	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
SLC27A1-208	ENST00000600277	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SLC27A1-208	ENST00000600277	NAIP	Q13075	1403 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SLC27A1-208	ENST00000600277	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SLC27A1-208	ENST00000600277	AGL	P35573	1532 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SLC27A1-208	ENST00000600277	MLEC	Q14165	292 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SLC27A1-208	ENST00000600277	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SLC27A1-208	ENST00000600277	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SLC27A1-208	ENST00000600277	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SLC27A1-208	ENST00000600277	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.15	■■■□□ 2.9
SLC27A1-208	ENST00000600277	KIF3B	O15066	747 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SLC27A1-208	ENST00000600277	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SLC27A1-208	ENST00000600277	PTPRM	P28827	1452 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SLC27A1-208	ENST00000600277	GGT6	Q6P531	493 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SLC27A1-208	ENST00000600277	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.09	■■■□□ 2.89

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 210.1 ms