RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-231ENST00000600201 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.43■■□□□ 1.5
FCHO1-231ENST00000600201 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
FCHO1-231ENST00000600201 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.4■■□□□ 1.5
FCHO1-231ENST00000600201 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.4■■□□□ 1.5
FCHO1-231ENST00000600201 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
FCHO1-231ENST00000600201 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.37■■□□□ 1.49
FCHO1-231ENST00000600201 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.35■■□□□ 1.49
FCHO1-231ENST00000600201 PREX2Q70Z35 1606 aa24.35■■□□□ 1.49
FCHO1-231ENST00000600201 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.34■■□□□ 1.49
FCHO1-231ENST00000600201 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.31■■□□□ 1.48
FCHO1-231ENST00000600201 CLIP1P30622 1438 aa24.31■■□□□ 1.48
FCHO1-231ENST00000600201 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.3■■□□□ 1.48
FCHO1-231ENST00000600201 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.29■■□□□ 1.48
FCHO1-231ENST00000600201 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.29■■□□□ 1.48
FCHO1-231ENST00000600201 KDM5CP41229 1560 aa24.29■■□□□ 1.48
FCHO1-231ENST00000600201 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.28■■□□□ 1.48
FCHO1-231ENST00000600201 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
FCHO1-231ENST00000600201 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.28■■□□□ 1.48
FCHO1-231ENST00000600201 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.27■■□□□ 1.48
FCHO1-231ENST00000600201 ABCA6Q8N139 1617 aa24.26■■□□□ 1.47
FCHO1-231ENST00000600201 ABCC1P33527 1531 aa24.25■■□□□ 1.47
FCHO1-231ENST00000600201 MLECQ14165 292 aa24.25■■□□□ 1.47
FCHO1-231ENST00000600201 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.25■■□□□ 1.47
FCHO1-231ENST00000600201 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.25■■□□□ 1.47
FCHO1-231ENST00000600201 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.24■■□□□ 1.47
FCHO1-231ENST00000600201 AFAP1Q8N556 730 aa24.23■■□□□ 1.47
FCHO1-231ENST00000600201 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.22■■□□□ 1.47
FCHO1-231ENST00000600201 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
FCHO1-231ENST00000600201 ATP10AO60312 1499 aa24.21■■□□□ 1.47
FCHO1-231ENST00000600201 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.21■■□□□ 1.47
FCHO1-231ENST00000600201 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.21■■□□□ 1.47
FCHO1-231ENST00000600201 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.2■■□□□ 1.46
FCHO1-231ENST00000600201 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.17■■□□□ 1.46
FCHO1-231ENST00000600201 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.12■■□□□ 1.45
FCHO1-231ENST00000600201 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
FCHO1-231ENST00000600201 HSPA2P54652 639 aa24.1■■□□□ 1.45
FCHO1-231ENST00000600201 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.1■■□□□ 1.45
FCHO1-231ENST00000600201 REREQ9P2R6 1566 aa24.1■■□□□ 1.45
FCHO1-231ENST00000600201 CEP162Q5TB80 1403 aa24.1■■□□□ 1.45
FCHO1-231ENST00000600201 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.07■■□□□ 1.44
FCHO1-231ENST00000600201 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
FCHO1-231ENST00000600201 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
FCHO1-231ENST00000600201 TIAM1Q13009 1591 aa24.06■■□□□ 1.44
FCHO1-231ENST00000600201 C3P01024 1663 aa24.05■■□□□ 1.44
FCHO1-231ENST00000600201 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.04■■□□□ 1.44
FCHO1-231ENST00000600201 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
FCHO1-231ENST00000600201 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24■■□□□ 1.43
FCHO1-231ENST00000600201 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
FCHO1-231ENST00000600201 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
FCHO1-231ENST00000600201 MTUS2Q5JR59 1369 aa24■■□□□ 1.43
FCHO1-231ENST00000600201 AGLP35573 1532 aa24■■□□□ 1.43
FCHO1-231ENST00000600201 ATP7AQ04656 1500 aa23.97■■□□□ 1.43
FCHO1-231ENST00000600201 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.97■■□□□ 1.43
FCHO1-231ENST00000600201 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.96■■□□□ 1.43
FCHO1-231ENST00000600201 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
FCHO1-231ENST00000600201 STRCQ7RTU9 1775 aa23.93■■□□□ 1.42
FCHO1-231ENST00000600201 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
FCHO1-231ENST00000600201 PLXNC1O60486 1568 aa23.92■■□□□ 1.42
FCHO1-231ENST00000600201 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.9■■□□□ 1.42
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FCHO1-231ENST00000600201 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
FCHO1-231ENST00000600201 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.89■■□□□ 1.41
FCHO1-231ENST00000600201 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.87■■□□□ 1.41
FCHO1-231ENST00000600201 MBD5Q9P267 1494 aa23.87■■□□□ 1.41
FCHO1-231ENST00000600201 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
FCHO1-231ENST00000600201 NCOA2Q15596 1464 aa23.87■■□□□ 1.41
FCHO1-231ENST00000600201 MROH2AA6NES4 1674 aa23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-231ENST00000600201 A2MP01023 1474 aa23.84■■□□□ 1.41
FCHO1-231ENST00000600201 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.83■■□□□ 1.4
FCHO1-231ENST00000600201 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-231ENST00000600201 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.8■■□□□ 1.4
FCHO1-231ENST00000600201 FBXO41Q8TF61 875 aa23.78■■□□□ 1.4
FCHO1-231ENST00000600201 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-231ENST00000600201 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.75■■□□□ 1.39
FCHO1-231ENST00000600201 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.74■■□□□ 1.39
FCHO1-231ENST00000600201 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-231ENST00000600201 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-231ENST00000600201 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
FCHO1-231ENST00000600201 ZMYM3Q14202 1370 aa23.72■■□□□ 1.39
FCHO1-231ENST00000600201 GGT6Q6P531 493 aa23.7■■□□□ 1.38
FCHO1-231ENST00000600201 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
FCHO1-231ENST00000600201 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-231ENST00000600201 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.68■■□□□ 1.38
FCHO1-231ENST00000600201 PTPRKQ15262 1439 aa23.67■■□□□ 1.38
FCHO1-231ENST00000600201 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.67■■□□□ 1.38
FCHO1-231ENST00000600201 NPATQ14207 1427 aa23.67■■□□□ 1.38
FCHO1-231ENST00000600201 CERKQ8TCT0 537 aa23.65■■□□□ 1.38
FCHO1-231ENST00000600201 NCOA1Q15788 1441 aa23.65■■□□□ 1.38
FCHO1-231ENST00000600201 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
FCHO1-231ENST00000600201 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
FCHO1-231ENST00000600201 MAP3K1Q13233 1512 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-231ENST00000600201 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.59■■□□□ 1.37
FCHO1-231ENST00000600201 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.59■■□□□ 1.37
FCHO1-231ENST00000600201 PTPRTO14522 1441 aa23.59■■□□□ 1.37
FCHO1-231ENST00000600201 KIF3BO15066 747 aa23.57■■□□□ 1.36
FCHO1-231ENST00000600201 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.57■■□□□ 1.36
FCHO1-231ENST00000600201 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.57■■□□□ 1.36
FCHO1-231ENST00000600201 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.56■■□□□ 1.36
FCHO1-231ENST00000600201 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.55■■□□□ 1.36
FCHO1-231ENST00000600201 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
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