RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598960.5

FCHO1-227, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-227ENST00000598960 ASXL2Q76L83 1435 aa21.28■■□□□ 1
FCHO1-227ENST00000598960 ITGAEP38570 1179 aa21.27■■□□□ 1
FCHO1-227ENST00000598960 PTPRKQ15262 1439 aa21.27■■□□□ 1
FCHO1-227ENST00000598960 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.25■□□□□ 0.99
FCHO1-227ENST00000598960 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
FCHO1-227ENST00000598960 DAPK1P53355 1430 aa21.24■□□□□ 0.99
FCHO1-227ENST00000598960 MAPKBP1O60336 1514 aa21.24■□□□□ 0.99
FCHO1-227ENST00000598960 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.24■□□□□ 0.99
FCHO1-227ENST00000598960 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.23■□□□□ 0.99
FCHO1-227ENST00000598960 AKNAQ7Z591 1439 aa21.22■□□□□ 0.99
FCHO1-227ENST00000598960 HRCP23327 699 aa21.2■□□□□ 0.98
FCHO1-227ENST00000598960 HFM1A2PYH4 1435 aa21.2■□□□□ 0.98
FCHO1-227ENST00000598960 ABCC5O15440 1437 aa21.2■□□□□ 0.98
FCHO1-227ENST00000598960 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.2■□□□□ 0.98
FCHO1-227ENST00000598960 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.98
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
FCHO1-227ENST00000598960 KCNH8Q96L42 1107 aa21.18■□□□□ 0.98
FCHO1-227ENST00000598960 PLCH2O75038 1416 aa21.18■□□□□ 0.98
FCHO1-227ENST00000598960 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.18■□□□□ 0.98
FCHO1-227ENST00000598960 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.16■□□□□ 0.98
FCHO1-227ENST00000598960 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.16■□□□□ 0.98
FCHO1-227ENST00000598960 ABCC1P33527 1531 aa21.15■□□□□ 0.98
FCHO1-227ENST00000598960 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.15■□□□□ 0.98
FCHO1-227ENST00000598960 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.14■□□□□ 0.97
FCHO1-227ENST00000598960 ADGRL2O95490 1459 aa21.13■□□□□ 0.97
FCHO1-227ENST00000598960 NAIPQ13075 1403 aa21.13■□□□□ 0.97
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
FCHO1-227ENST00000598960 MBD5Q9P267 1494 aa21.13■□□□□ 0.97
FCHO1-227ENST00000598960 ROCK1Q13464 1354 aa21.12■□□□□ 0.97
FCHO1-227ENST00000598960 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.12■□□□□ 0.97
FCHO1-227ENST00000598960 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.12■□□□□ 0.97
FCHO1-227ENST00000598960 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.12■□□□□ 0.97
FCHO1-227ENST00000598960 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
FCHO1-227ENST00000598960 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.1■□□□□ 0.97
FCHO1-227ENST00000598960 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.09■□□□□ 0.97
FCHO1-227ENST00000598960 GLI2P10070 1586 aa21.09■□□□□ 0.97
FCHO1-227ENST00000598960 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
FCHO1-227ENST00000598960 KDM6BO15054 1643 aa21.07■□□□□ 0.96
FCHO1-227ENST00000598960 DIP2BQ9P265 1576 aa21.06■□□□□ 0.96
FCHO1-227ENST00000598960 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.06■□□□□ 0.96
FCHO1-227ENST00000598960 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.05■□□□□ 0.96
FCHO1-227ENST00000598960 FANCAO15360 1455 aa21.05■□□□□ 0.96
FCHO1-227ENST00000598960 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.04■□□□□ 0.96
FCHO1-227ENST00000598960 PLXNC1O60486 1568 aa21.04■□□□□ 0.96
FCHO1-227ENST00000598960 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
FCHO1-227ENST00000598960 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.03■□□□□ 0.96
FCHO1-227ENST00000598960 NCOA1Q15788 1441 aa21.02■□□□□ 0.96
FCHO1-227ENST00000598960 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.01■□□□□ 0.95
FCHO1-227ENST00000598960 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.99■□□□□ 0.95
FCHO1-227ENST00000598960 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.99■□□□□ 0.95
FCHO1-227ENST00000598960 CD109Q6YHK3 1445 aa20.99■□□□□ 0.95
FCHO1-227ENST00000598960 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.99■□□□□ 0.95
FCHO1-227ENST00000598960 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.99■□□□□ 0.95
FCHO1-227ENST00000598960 ADGRL1O94910 1474 aa20.97■□□□□ 0.95
FCHO1-227ENST00000598960 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
FCHO1-227ENST00000598960 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.95■□□□□ 0.94
FCHO1-227ENST00000598960 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
FCHO1-227ENST00000598960 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.95■□□□□ 0.94
FCHO1-227ENST00000598960 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.94■□□□□ 0.94
FCHO1-227ENST00000598960 NEO1Q92859 1461 aa20.94■□□□□ 0.94
FCHO1-227ENST00000598960 TSPOAP1O95153 1857 aa20.92■□□□□ 0.94
FCHO1-227ENST00000598960 TSPY4P0CV99 314 aa20.92■□□□□ 0.94
FCHO1-227ENST00000598960 TSPY10P0CW01 314 aa20.92■□□□□ 0.94
FCHO1-227ENST00000598960 KIF15Q9NS87 1388 aa20.91■□□□□ 0.94
FCHO1-227ENST00000598960 KDM5CP41229 1560 aa20.89■□□□□ 0.94
FCHO1-227ENST00000598960 ATP7AQ04656 1500 aa20.89■□□□□ 0.94
FCHO1-227ENST00000598960 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.89■□□□□ 0.94
FCHO1-227ENST00000598960 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.89■□□□□ 0.94
FCHO1-227ENST00000598960 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.88■□□□□ 0.93
FCHO1-227ENST00000598960 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
FCHO1-227ENST00000598960 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.88■□□□□ 0.93
FCHO1-227ENST00000598960 RICTORQ6R327 1708 aa20.87■□□□□ 0.93
FCHO1-227ENST00000598960 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.87■□□□□ 0.93
FCHO1-227ENST00000598960 UNC13BO14795 1591 aa20.86■□□□□ 0.93
FCHO1-227ENST00000598960 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.86■□□□□ 0.93
FCHO1-227ENST00000598960 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.86■□□□□ 0.93
FCHO1-227ENST00000598960 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.85■□□□□ 0.93
FCHO1-227ENST00000598960 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.85■□□□□ 0.93
FCHO1-227ENST00000598960 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
FCHO1-227ENST00000598960 ERBINQ96RT1 1412 aa20.81■□□□□ 0.92
FCHO1-227ENST00000598960 PZPP20742 1482 aa20.81■□□□□ 0.92
FCHO1-227ENST00000598960 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.81■□□□□ 0.92
FCHO1-227ENST00000598960 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
FCHO1-227ENST00000598960 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
FCHO1-227ENST00000598960 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.8■□□□□ 0.92
FCHO1-227ENST00000598960 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.8■□□□□ 0.92
FCHO1-227ENST00000598960 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.77■□□□□ 0.92
FCHO1-227ENST00000598960 AFAP1Q8N556 730 aa20.77■□□□□ 0.92
FCHO1-227ENST00000598960 TRIM52Q96A61 297 aa20.77■□□□□ 0.92
FCHO1-227ENST00000598960 DEPDC5O75140 1603 aa20.77■□□□□ 0.92
FCHO1-227ENST00000598960 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.77■□□□□ 0.92
FCHO1-227ENST00000598960 ABCA6Q8N139 1617 aa20.76■□□□□ 0.91
FCHO1-227ENST00000598960 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.75■□□□□ 0.91
FCHO1-227ENST00000598960 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.74■□□□□ 0.91
FCHO1-227ENST00000598960 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.73■□□□□ 0.91
FCHO1-227ENST00000598960 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.71■□□□□ 0.91
FCHO1-227ENST00000598960 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-227ENST00000598960 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-227ENST00000598960 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-227ENST00000598960 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms