RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595594.1

FCHO1-210, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 898 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-210ENST00000595594 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.37■■■□□ 2.45
FCHO1-210ENST00000595594 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.34■■■□□ 2.45
FCHO1-210ENST00000595594 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.32■■■□□ 2.44
FCHO1-210ENST00000595594 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
FCHO1-210ENST00000595594 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.3■■■□□ 2.44
FCHO1-210ENST00000595594 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
FCHO1-210ENST00000595594 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
FCHO1-210ENST00000595594 MLECQ14165 292 aa30.26■■■□□ 2.43
FCHO1-210ENST00000595594 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.25■■■□□ 2.43
FCHO1-210ENST00000595594 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.25■■■□□ 2.43
FCHO1-210ENST00000595594 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.23■■■□□ 2.43
FCHO1-210ENST00000595594 CLIP1P30622 1438 aa30.22■■■□□ 2.43
FCHO1-210ENST00000595594 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.22■■■□□ 2.43
FCHO1-210ENST00000595594 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.2■■■□□ 2.43
FCHO1-210ENST00000595594 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.17■■■□□ 2.42
FCHO1-210ENST00000595594 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.17■■■□□ 2.42
FCHO1-210ENST00000595594 ATP10AO60312 1499 aa30.13■■■□□ 2.41
FCHO1-210ENST00000595594 AFAP1Q8N556 730 aa30.13■■■□□ 2.41
FCHO1-210ENST00000595594 PREX2Q70Z35 1606 aa30.13■■■□□ 2.41
FCHO1-210ENST00000595594 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.12■■■□□ 2.41
FCHO1-210ENST00000595594 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.12■■■□□ 2.41
FCHO1-210ENST00000595594 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.11■■■□□ 2.41
FCHO1-210ENST00000595594 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.11■■■□□ 2.41
FCHO1-210ENST00000595594 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.1■■■□□ 2.41
FCHO1-210ENST00000595594 KDM5CP41229 1560 aa30.09■■■□□ 2.41
FCHO1-210ENST00000595594 HSPA2P54652 639 aa30.08■■■□□ 2.41
FCHO1-210ENST00000595594 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.06■■■□□ 2.4
FCHO1-210ENST00000595594 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.06■■■□□ 2.4
FCHO1-210ENST00000595594 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.05■■■□□ 2.4
FCHO1-210ENST00000595594 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.05■■■□□ 2.4
FCHO1-210ENST00000595594 ABCA6Q8N139 1617 aa30.04■■■□□ 2.4
FCHO1-210ENST00000595594 ABCC1P33527 1531 aa30.03■■■□□ 2.4
FCHO1-210ENST00000595594 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.02■■■□□ 2.4
FCHO1-210ENST00000595594 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
FCHO1-210ENST00000595594 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
FCHO1-210ENST00000595594 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.93■■■□□ 2.38
FCHO1-210ENST00000595594 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.93■■■□□ 2.38
FCHO1-210ENST00000595594 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.93■■■□□ 2.38
FCHO1-210ENST00000595594 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.91■■■□□ 2.38
FCHO1-210ENST00000595594 REREQ9P2R6 1566 aa29.9■■■□□ 2.38
FCHO1-210ENST00000595594 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.88■■■□□ 2.37
FCHO1-210ENST00000595594 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
FCHO1-210ENST00000595594 FBXO41Q8TF61 875 aa29.85■■■□□ 2.37
FCHO1-210ENST00000595594 C3P01024 1663 aa29.85■■■□□ 2.37
FCHO1-210ENST00000595594 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.37
FCHO1-210ENST00000595594 AGLP35573 1532 aa29.8■■■□□ 2.36
FCHO1-210ENST00000595594 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
FCHO1-210ENST00000595594 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.79■■■□□ 2.36
FCHO1-210ENST00000595594 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.77■■■□□ 2.36
FCHO1-210ENST00000595594 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
FCHO1-210ENST00000595594 CEP162Q5TB80 1403 aa29.75■■■□□ 2.35
FCHO1-210ENST00000595594 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
FCHO1-210ENST00000595594 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
FCHO1-210ENST00000595594 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
FCHO1-210ENST00000595594 STRCQ7RTU9 1775 aa29.74■■■□□ 2.35
FCHO1-210ENST00000595594 TIAM1Q13009 1591 aa29.73■■■□□ 2.35
FCHO1-210ENST00000595594 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.72■■■□□ 2.35
FCHO1-210ENST00000595594 ATP7AQ04656 1500 aa29.72■■■□□ 2.35
FCHO1-210ENST00000595594 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
FCHO1-210ENST00000595594 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.69■■■□□ 2.34
FCHO1-210ENST00000595594 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
FCHO1-210ENST00000595594 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.67■■■□□ 2.34
FCHO1-210ENST00000595594 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.66■■■□□ 2.34
FCHO1-210ENST00000595594 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
FCHO1-210ENST00000595594 PLXNC1O60486 1568 aa29.61■■■□□ 2.33
FCHO1-210ENST00000595594 MROH2AA6NES4 1674 aa29.61■■■□□ 2.33
FCHO1-210ENST00000595594 CERKQ8TCT0 537 aa29.61■■■□□ 2.33
FCHO1-210ENST00000595594 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.61■■■□□ 2.33
FCHO1-210ENST00000595594 A2MP01023 1474 aa29.61■■■□□ 2.33
FCHO1-210ENST00000595594 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.58■■■□□ 2.33
FCHO1-210ENST00000595594 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.56■■■□□ 2.32
FCHO1-210ENST00000595594 MBD5Q9P267 1494 aa29.55■■■□□ 2.32
FCHO1-210ENST00000595594 ZMYM3Q14202 1370 aa29.54■■■□□ 2.32
FCHO1-210ENST00000595594 GGT6Q6P531 493 aa29.54■■■□□ 2.32
FCHO1-210ENST00000595594 NCOA2Q15596 1464 aa29.53■■■□□ 2.32
FCHO1-210ENST00000595594 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.49■■■□□ 2.31
FCHO1-210ENST00000595594 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.48■■■□□ 2.31
FCHO1-210ENST00000595594 NPATQ14207 1427 aa29.46■■■□□ 2.31
FCHO1-210ENST00000595594 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.46■■■□□ 2.31
FCHO1-210ENST00000595594 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.45■■■□□ 2.31
FCHO1-210ENST00000595594 NCOA1Q15788 1441 aa29.44■■■□□ 2.3
FCHO1-210ENST00000595594 PTPRTO14522 1441 aa29.43■■■□□ 2.3
FCHO1-210ENST00000595594 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.42■■■□□ 2.3
FCHO1-210ENST00000595594 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.41■■■□□ 2.3
FCHO1-210ENST00000595594 PTPRKQ15262 1439 aa29.41■■■□□ 2.3
FCHO1-210ENST00000595594 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.4■■■□□ 2.3
FCHO1-210ENST00000595594 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
FCHO1-210ENST00000595594 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.38■■■□□ 2.29
FCHO1-210ENST00000595594 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
FCHO1-210ENST00000595594 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.36■■■□□ 2.29
FCHO1-210ENST00000595594 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
FCHO1-210ENST00000595594 KIF3BO15066 747 aa29.35■■■□□ 2.29
FCHO1-210ENST00000595594 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.33■■■□□ 2.29
FCHO1-210ENST00000595594 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
FCHO1-210ENST00000595594 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.31■■■□□ 2.28
FCHO1-210ENST00000595594 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.28■■■□□ 2.28
FCHO1-210ENST00000595594 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
FCHO1-210ENST00000595594 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.25■■■□□ 2.27
FCHO1-210ENST00000595594 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.25■■■□□ 2.27
FCHO1-210ENST00000595594 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.2 ms