RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.26■■■□□ 2.43
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FANCAO15360 1455 aa30.26■■■□□ 2.43
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.26■■■□□ 2.43
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.23■■■□□ 2.43
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.23■■■□□ 2.43
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NEO1Q92859 1461 aa30.18■■■□□ 2.42
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AKNAQ7Z591 1439 aa30.17■■■□□ 2.42
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.17■■■□□ 2.42
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.15■■■□□ 2.42
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MIA2Q96PC5 1412 aa30.13■■■□□ 2.41
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.12■■■□□ 2.41
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ADGRL1O94910 1474 aa30.1■■■□□ 2.41
SMC5-AS1-201ENST00000594708 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.08■■■□□ 2.41
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ABCC1P33527 1531 aa30.08■■■□□ 2.41
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.07■■■□□ 2.4
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.07■■■□□ 2.4
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.07■■■□□ 2.4
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.05■■■□□ 2.4
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.05■■■□□ 2.4
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KDM6BO15054 1643 aa30.03■■■□□ 2.4
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RAPGEF3O95398 923 aa30.03■■■□□ 2.4
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.01■■■□□ 2.4
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.01■■■□□ 2.39
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.99■■■□□ 2.39
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MBD5Q9P267 1494 aa29.98■■■□□ 2.39
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AFAP1Q8N556 730 aa29.97■■■□□ 2.39
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RICTORQ6R327 1708 aa29.97■■■□□ 2.39
SMC5-AS1-201ENST00000594708 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.96■■■□□ 2.39
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.96■■■□□ 2.39
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.91■■■□□ 2.38
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.89■■■□□ 2.38
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.88■■■□□ 2.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KDM5CP41229 1560 aa29.86■■■□□ 2.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.86■■■□□ 2.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.85■■■□□ 2.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ABCC5O15440 1437 aa29.85■■■□□ 2.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DAPK1P53355 1430 aa29.84■■■□□ 2.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.81■■■□□ 2.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ITGAEP38570 1179 aa29.8■■■□□ 2.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TSPY4P0CV99 314 aa29.8■■■□□ 2.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TSPY10P0CW01 314 aa29.8■■■□□ 2.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.8■■■□□ 2.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.79■■■□□ 2.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.78■■■□□ 2.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.77■■■□□ 2.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.77■■■□□ 2.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PTPRKQ15262 1439 aa29.76■■■□□ 2.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.75■■■□□ 2.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.75■■■□□ 2.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.75■■■□□ 2.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.74■■■□□ 2.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ATP7AQ04656 1500 aa29.74■■■□□ 2.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.73■■■□□ 2.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.72■■■□□ 2.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.72■■■□□ 2.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.71■■■□□ 2.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ABCA6Q8N139 1617 aa29.69■■■□□ 2.34
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.67■■■□□ 2.34
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.66■■■□□ 2.34
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.63■■■□□ 2.33
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.62■■■□□ 2.33
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ATP10AO60312 1499 aa29.61■■■□□ 2.33
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ADGRL2O95490 1459 aa29.61■■■□□ 2.33
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NCOA1Q15788 1441 aa29.6■■■□□ 2.33
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PLXNC1O60486 1568 aa29.6■■■□□ 2.33
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.6■■■□□ 2.33
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KIF15Q9NS87 1388 aa29.57■■■□□ 2.32
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ROCK1Q13464 1354 aa29.56■■■□□ 2.32
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.56■■■□□ 2.32
SMC5-AS1-201ENST00000594708 A2MP01023 1474 aa29.55■■■□□ 2.32
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
SMC5-AS1-201ENST00000594708 REREQ9P2R6 1566 aa29.5■■■□□ 2.31
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.5■■■□□ 2.31
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NAIPQ13075 1403 aa29.44■■■□□ 2.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.43■■■□□ 2.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HFM1A2PYH4 1435 aa29.42■■■□□ 2.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AGLP35573 1532 aa29.42■■■□□ 2.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KIF3BO15066 747 aa29.41■■■□□ 2.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ERBINQ96RT1 1412 aa29.41■■■□□ 2.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.4■■■□□ 2.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MLECQ14165 292 aa29.38■■■□□ 2.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.35■■■□□ 2.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GGT6Q6P531 493 aa29.34■■■□□ 2.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.31■■■□□ 2.28
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.3■■■□□ 2.28
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms