RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592956.1

SYT5-211, Transcript of synaptotagmin 5, humanhuman

TSL 2

Gene SYT5, Length 512 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5-211ENST00000592956 CLIP1P30622 1438 aa34.77■■■■□ 3.16
SYT5-211ENST00000592956 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.75■■■■□ 3.15
SYT5-211ENST00000592956 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.75■■■■□ 3.15
SYT5-211ENST00000592956 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.74■■■■□ 3.15
SYT5-211ENST00000592956 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.72■■■■□ 3.15
SYT5-211ENST00000592956 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
SYT5-211ENST00000592956 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.69■■■■□ 3.14
SYT5-211ENST00000592956 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.68■■■■□ 3.14
SYT5-211ENST00000592956 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
SYT5-211ENST00000592956 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.67■■■■□ 3.14
SYT5-211ENST00000592956 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.63■■■■□ 3.13
SYT5-211ENST00000592956 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.58■■■■□ 3.13
SYT5-211ENST00000592956 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.58■■■■□ 3.13
SYT5-211ENST00000592956 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.58■■■■□ 3.13
SYT5-211ENST00000592956 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
SYT5-211ENST00000592956 ATP10AO60312 1499 aa34.56■■■■□ 3.12
SYT5-211ENST00000592956 PREX2Q70Z35 1606 aa34.54■■■■□ 3.12
SYT5-211ENST00000592956 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.54■■■■□ 3.12
SYT5-211ENST00000592956 MLECQ14165 292 aa34.53■■■■□ 3.12
SYT5-211ENST00000592956 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.52■■■■□ 3.12
SYT5-211ENST00000592956 KDM5CP41229 1560 aa34.51■■■■□ 3.12
SYT5-211ENST00000592956 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.48■■■■□ 3.11
SYT5-211ENST00000592956 AFAP1Q8N556 730 aa34.48■■■■□ 3.11
SYT5-211ENST00000592956 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.48■■■■□ 3.11
SYT5-211ENST00000592956 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.47■■■■□ 3.11
SYT5-211ENST00000592956 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.44■■■■□ 3.1
SYT5-211ENST00000592956 ABCC1P33527 1531 aa34.43■■■■□ 3.1
SYT5-211ENST00000592956 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.41■■■■□ 3.1
SYT5-211ENST00000592956 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.41■■■■□ 3.1
SYT5-211ENST00000592956 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.39■■■■□ 3.1
SYT5-211ENST00000592956 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.37■■■■□ 3.09
SYT5-211ENST00000592956 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.36■■■■□ 3.09
SYT5-211ENST00000592956 ABCA6Q8N139 1617 aa34.34■■■■□ 3.09
SYT5-211ENST00000592956 REREQ9P2R6 1566 aa34.33■■■■□ 3.09
SYT5-211ENST00000592956 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
SYT5-211ENST00000592956 HSPA2P54652 639 aa34.28■■■■□ 3.08
SYT5-211ENST00000592956 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
SYT5-211ENST00000592956 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.26■■■■□ 3.07
SYT5-211ENST00000592956 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.26■■■■□ 3.07
SYT5-211ENST00000592956 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.24■■■■□ 3.07
SYT5-211ENST00000592956 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.23■■■■□ 3.07
SYT5-211ENST00000592956 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.22■■■■□ 3.07
SYT5-211ENST00000592956 AGLP35573 1532 aa34.21■■■■□ 3.07
SYT5-211ENST00000592956 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.21■■■■□ 3.07
SYT5-211ENST00000592956 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
SYT5-211ENST00000592956 CEP162Q5TB80 1403 aa34.2■■■■□ 3.06
SYT5-211ENST00000592956 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
SYT5-211ENST00000592956 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
SYT5-211ENST00000592956 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.16■■■■□ 3.06
SYT5-211ENST00000592956 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
SYT5-211ENST00000592956 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.14■■■■□ 3.06
SYT5-211ENST00000592956 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.14■■■■□ 3.06
SYT5-211ENST00000592956 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
SYT5-211ENST00000592956 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.13■■■■□ 3.05
SYT5-211ENST00000592956 FBXO41Q8TF61 875 aa34.12■■■■□ 3.05
SYT5-211ENST00000592956 C3P01024 1663 aa34.09■■■■□ 3.05
SYT5-211ENST00000592956 ATP7AQ04656 1500 aa34.08■■■■□ 3.05
SYT5-211ENST00000592956 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.07■■■■□ 3.04
SYT5-211ENST00000592956 TIAM1Q13009 1591 aa34.06■■■■□ 3.04
SYT5-211ENST00000592956 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
SYT5-211ENST00000592956 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
SYT5-211ENST00000592956 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.04■■■■□ 3.04
SYT5-211ENST00000592956 MROH2AA6NES4 1674 aa33.96■■■■□ 3.03
SYT5-211ENST00000592956 A2MP01023 1474 aa33.95■■■■□ 3.03
SYT5-211ENST00000592956 PLXNC1O60486 1568 aa33.95■■■■□ 3.03
SYT5-211ENST00000592956 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
SYT5-211ENST00000592956 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.93■■■■□ 3.02
SYT5-211ENST00000592956 STRCQ7RTU9 1775 aa33.92■■■■□ 3.02
SYT5-211ENST00000592956 NCOA2Q15596 1464 aa33.89■■■■□ 3.02
SYT5-211ENST00000592956 MBD5Q9P267 1494 aa33.89■■■■□ 3.02
SYT5-211ENST00000592956 DMRT2Q9Y5R5 561 aa33.89■■■■□ 3.02
SYT5-211ENST00000592956 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
SYT5-211ENST00000592956 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.85■■■■□ 3.01
SYT5-211ENST00000592956 ZMYM3Q14202 1370 aa33.85■■■■□ 3.01
SYT5-211ENST00000592956 NPATQ14207 1427 aa33.84■■■■□ 3.01
SYT5-211ENST00000592956 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.84■■■■□ 3.01
SYT5-211ENST00000592956 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.83■■■■□ 3.01
SYT5-211ENST00000592956 GGT6Q6P531 493 aa33.83■■■■□ 3.01
SYT5-211ENST00000592956 CERKQ8TCT0 537 aa33.83■■■■□ 3.01
SYT5-211ENST00000592956 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.82■■■■□ 3
SYT5-211ENST00000592956 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.79■■■■□ 3
SYT5-211ENST00000592956 PPP6R1Q9UPN7 881 aa33.76■■■□□ 2.99
SYT5-211ENST00000592956 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.75■■■□□ 2.99
SYT5-211ENST00000592956 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.74■■■□□ 2.99
SYT5-211ENST00000592956 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
SYT5-211ENST00000592956 PTPRTO14522 1441 aa33.73■■■□□ 2.99
SYT5-211ENST00000592956 NCOA1Q15788 1441 aa33.7■■■□□ 2.99
SYT5-211ENST00000592956 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.68■■■□□ 2.98
SYT5-211ENST00000592956 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa33.68■■■□□ 2.98
SYT5-211ENST00000592956 MYO3AQ8NEV4 1616 aa33.68■■■□□ 2.98
SYT5-211ENST00000592956 PTPRKQ15262 1439 aa33.68■■■□□ 2.98
SYT5-211ENST00000592956 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
SYT5-211ENST00000592956 MAP3K1Q13233 1512 aa33.65■■■□□ 2.98
SYT5-211ENST00000592956 KIF3BO15066 747 aa33.64■■■□□ 2.98
SYT5-211ENST00000592956 TSPY4P0CV99 314 aa33.63■■■□□ 2.97
SYT5-211ENST00000592956 TSPY10P0CW01 314 aa33.63■■■□□ 2.97
SYT5-211ENST00000592956 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
SYT5-211ENST00000592956 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
SYT5-211ENST00000592956 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.58■■■□□ 2.97
SYT5-211ENST00000592956 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.7 ms