RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592484.5

LRP3-204, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene LRP3, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-204ENST00000592484 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.98■■□□□ 1.75
LRP3-204ENST00000592484 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.98■■□□□ 1.75
LRP3-204ENST00000592484 MADDQ8WXG6 1647 aa25.98■■□□□ 1.75
LRP3-204ENST00000592484 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.96■■□□□ 1.75
LRP3-204ENST00000592484 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.95■■□□□ 1.74
LRP3-204ENST00000592484 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.94■■□□□ 1.74
LRP3-204ENST00000592484 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.94■■□□□ 1.74
LRP3-204ENST00000592484 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
LRP3-204ENST00000592484 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.89■■□□□ 1.74
LRP3-204ENST00000592484 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
LRP3-204ENST00000592484 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.87■■□□□ 1.73
LRP3-204ENST00000592484 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.87■■□□□ 1.73
LRP3-204ENST00000592484 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.86■■□□□ 1.73
LRP3-204ENST00000592484 ATP10AO60312 1499 aa25.85■■□□□ 1.73
LRP3-204ENST00000592484 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.83■■□□□ 1.73
LRP3-204ENST00000592484 KDM5CP41229 1560 aa25.83■■□□□ 1.73
LRP3-204ENST00000592484 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.82■■□□□ 1.72
LRP3-204ENST00000592484 PREX2Q70Z35 1606 aa25.82■■□□□ 1.72
LRP3-204ENST00000592484 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
LRP3-204ENST00000592484 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.78■■□□□ 1.72
LRP3-204ENST00000592484 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.77■■□□□ 1.72
LRP3-204ENST00000592484 ABCC1P33527 1531 aa25.75■■□□□ 1.71
LRP3-204ENST00000592484 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.75■■□□□ 1.71
LRP3-204ENST00000592484 AFAP1Q8N556 730 aa25.75■■□□□ 1.71
LRP3-204ENST00000592484 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.74■■□□□ 1.71
LRP3-204ENST00000592484 MLECQ14165 292 aa25.73■■□□□ 1.71
LRP3-204ENST00000592484 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.72■■□□□ 1.71
LRP3-204ENST00000592484 REREQ9P2R6 1566 aa25.72■■□□□ 1.71
LRP3-204ENST00000592484 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.71■■□□□ 1.71
LRP3-204ENST00000592484 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.71■■□□□ 1.71
LRP3-204ENST00000592484 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.67■■□□□ 1.7
LRP3-204ENST00000592484 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.67■■□□□ 1.7
LRP3-204ENST00000592484 ABCA6Q8N139 1617 aa25.66■■□□□ 1.7
LRP3-204ENST00000592484 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.63■■□□□ 1.69
LRP3-204ENST00000592484 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
LRP3-204ENST00000592484 AGLP35573 1532 aa25.62■■□□□ 1.69
LRP3-204ENST00000592484 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.61■■□□□ 1.69
LRP3-204ENST00000592484 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.61■■□□□ 1.69
LRP3-204ENST00000592484 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.58■■□□□ 1.68
LRP3-204ENST00000592484 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.57■■□□□ 1.68
LRP3-204ENST00000592484 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.57■■□□□ 1.68
LRP3-204ENST00000592484 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.56■■□□□ 1.68
LRP3-204ENST00000592484 HSPA2P54652 639 aa25.56■■□□□ 1.68
LRP3-204ENST00000592484 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.55■■□□□ 1.68
LRP3-204ENST00000592484 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
LRP3-204ENST00000592484 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.55■■□□□ 1.68
LRP3-204ENST00000592484 CEP162Q5TB80 1403 aa25.54■■□□□ 1.68
LRP3-204ENST00000592484 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
LRP3-204ENST00000592484 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.53■■□□□ 1.68
LRP3-204ENST00000592484 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
LRP3-204ENST00000592484 FBXO41Q8TF61 875 aa25.5■■□□□ 1.67
LRP3-204ENST00000592484 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
LRP3-204ENST00000592484 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
LRP3-204ENST00000592484 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
LRP3-204ENST00000592484 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
LRP3-204ENST00000592484 C3P01024 1663 aa25.48■■□□□ 1.67
LRP3-204ENST00000592484 ATP7AQ04656 1500 aa25.47■■□□□ 1.67
LRP3-204ENST00000592484 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.47■■□□□ 1.67
LRP3-204ENST00000592484 TIAM1Q13009 1591 aa25.47■■□□□ 1.67
LRP3-204ENST00000592484 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
LRP3-204ENST00000592484 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.46■■□□□ 1.67
LRP3-204ENST00000592484 PLXNC1O60486 1568 aa25.41■■□□□ 1.66
LRP3-204ENST00000592484 MROH2AA6NES4 1674 aa25.4■■□□□ 1.66
LRP3-204ENST00000592484 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
LRP3-204ENST00000592484 A2MP01023 1474 aa25.39■■□□□ 1.65
LRP3-204ENST00000592484 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.36■■□□□ 1.65
LRP3-204ENST00000592484 MBD5Q9P267 1494 aa25.36■■□□□ 1.65
LRP3-204ENST00000592484 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.35■■□□□ 1.65
LRP3-204ENST00000592484 STRCQ7RTU9 1775 aa25.35■■□□□ 1.65
LRP3-204ENST00000592484 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
LRP3-204ENST00000592484 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.33■■□□□ 1.65
LRP3-204ENST00000592484 NPATQ14207 1427 aa25.33■■□□□ 1.65
LRP3-204ENST00000592484 NCOA2Q15596 1464 aa25.33■■□□□ 1.65
LRP3-204ENST00000592484 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.3■■□□□ 1.64
LRP3-204ENST00000592484 ZMYM3Q14202 1370 aa25.3■■□□□ 1.64
LRP3-204ENST00000592484 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
LRP3-204ENST00000592484 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.28■■□□□ 1.64
LRP3-204ENST00000592484 CERKQ8TCT0 537 aa25.27■■□□□ 1.64
LRP3-204ENST00000592484 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.27■■□□□ 1.64
LRP3-204ENST00000592484 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.27■■□□□ 1.64
LRP3-204ENST00000592484 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.26■■□□□ 1.63
LRP3-204ENST00000592484 PTPRTO14522 1441 aa25.24■■□□□ 1.63
LRP3-204ENST00000592484 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.23■■□□□ 1.63
LRP3-204ENST00000592484 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
LRP3-204ENST00000592484 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.23■■□□□ 1.63
LRP3-204ENST00000592484 GGT6Q6P531 493 aa25.23■■□□□ 1.63
LRP3-204ENST00000592484 MAP3K1Q13233 1512 aa25.22■■□□□ 1.63
LRP3-204ENST00000592484 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.21■■□□□ 1.63
LRP3-204ENST00000592484 NCOA1Q15788 1441 aa25.2■■□□□ 1.63
LRP3-204ENST00000592484 PTPRKQ15262 1439 aa25.19■■□□□ 1.62
LRP3-204ENST00000592484 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
LRP3-204ENST00000592484 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.17■■□□□ 1.62
LRP3-204ENST00000592484 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.17■■□□□ 1.62
LRP3-204ENST00000592484 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.16■■□□□ 1.62
LRP3-204ENST00000592484 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
LRP3-204ENST00000592484 TSPY4P0CV99 314 aa25.12■■□□□ 1.61
LRP3-204ENST00000592484 TSPY10P0CW01 314 aa25.12■■□□□ 1.61
LRP3-204ENST00000592484 PLA2R1Q13018 1463 aa25.11■■□□□ 1.61
LRP3-204ENST00000592484 KIF3BO15066 747 aa25.11■■□□□ 1.61
LRP3-204ENST00000592484 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms