RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592373.1

MED16-208, Transcript of mediator complex subunit 16, humanhuman

TSL 3

Gene MED16, Length 927 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16-208ENST00000592373 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.54■■■□□ 2.16
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MED16-208ENST00000592373 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
MED16-208ENST00000592373 ADGRL1O94910 1474 aa28.47■■■□□ 2.15
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MED16-208ENST00000592373 NCOA2Q15596 1464 aa28.46■■■□□ 2.15
MED16-208ENST00000592373 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.45■■■□□ 2.15
MED16-208ENST00000592373 RAPGEF3O95398 923 aa28.44■■■□□ 2.14
MED16-208ENST00000592373 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.43■■■□□ 2.14
MED16-208ENST00000592373 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
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MED16-208ENST00000592373 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.33■■■□□ 2.13
MED16-208ENST00000592373 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
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MED16-208ENST00000592373 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.22■■■□□ 2.11
MED16-208ENST00000592373 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.22■■■□□ 2.11
MED16-208ENST00000592373 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.22■■■□□ 2.11
MED16-208ENST00000592373 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
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MED16-208ENST00000592373 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.16■■■□□ 2.1
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MED16-208ENST00000592373 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.09■■■□□ 2.09
MED16-208ENST00000592373 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.09■■■□□ 2.09
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MED16-208ENST00000592373 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.07■■■□□ 2.08
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MED16-208ENST00000592373 TSPY10P0CW01 314 aa28.04■■■□□ 2.08
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MED16-208ENST00000592373 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.95■■■□□ 2.07
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MED16-208ENST00000592373 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.71■■■□□ 2.03
MED16-208ENST00000592373 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
MED16-208ENST00000592373 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.7■■■□□ 2.02
MED16-208ENST00000592373 GGT6Q6P531 493 aa27.68■■■□□ 2.02
MED16-208ENST00000592373 ROCK1Q13464 1354 aa27.68■■■□□ 2.02
MED16-208ENST00000592373 ERBINQ96RT1 1412 aa27.67■■■□□ 2.02
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