RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592048.5

ERC1-224, Transcript of ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1, human

TSL 5

Gene ERC1, Length 1,275 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERC1-224	ENST00000592048	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.14	■■■■■ 4.5
ERC1-224	ENST00000592048	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		43.14	■■■■■ 4.5
ERC1-224	ENST00000592048	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.09	■■■■■ 4.49
ERC1-224	ENST00000592048	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		43.09	■■■■■ 4.49
ERC1-224	ENST00000592048	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		43.07	■■■■■ 4.49
ERC1-224	ENST00000592048	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.04	■■■■■ 4.48
ERC1-224	ENST00000592048	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		43.04	■■■■■ 4.48
ERC1-224	ENST00000592048	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		43.02	■■■■■ 4.48
ERC1-224	ENST00000592048	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		42.98	■■■■■ 4.47
ERC1-224	ENST00000592048	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.98	■■■■■ 4.47
ERC1-224	ENST00000592048	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.97	■■■■■ 4.47
ERC1-224	ENST00000592048	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	42.97	■■■■■ 4.47
ERC1-224	ENST00000592048	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.94	■■■■■ 4.47
ERC1-224	ENST00000592048	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.9	■■■■■ 4.46
ERC1-224	ENST00000592048	KDM5C	P41229	1560 aa		42.89	■■■■■ 4.46
ERC1-224	ENST00000592048	ABCC1	P33527	1531 aa		42.88	■■■■■ 4.46
ERC1-224	ENST00000592048	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.86	■■■■■ 4.45
ERC1-224	ENST00000592048	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.85	■■■■■ 4.45
ERC1-224	ENST00000592048	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.85	■■■■■ 4.45
ERC1-224	ENST00000592048	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.85	■■■■■ 4.45
ERC1-224	ENST00000592048	MADD	Q8WXG6	1647 aa		42.82	■■■■■ 4.44
ERC1-224	ENST00000592048	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.81	■■■■■ 4.44
ERC1-224	ENST00000592048	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.81	■■■■■ 4.44
ERC1-224	ENST00000592048	ATP10A	O60312	1499 aa		42.81	■■■■■ 4.44
ERC1-224	ENST00000592048	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.79	■■■■■ 4.44
ERC1-224	ENST00000592048	PTPRM	P28827	1452 aa		42.77	■■■■■ 4.44
ERC1-224	ENST00000592048	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.77	■■■■■ 4.44
ERC1-224	ENST00000592048	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.76	■■■■■ 4.44
ERC1-224	ENST00000592048	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.76	■■■■■ 4.44
ERC1-224	ENST00000592048	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.75	■■■■■ 4.43
ERC1-224	ENST00000592048	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.74	■■■■■ 4.43
ERC1-224	ENST00000592048	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
ERC1-224	ENST00000592048	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.71	■■■■■ 4.43
ERC1-224	ENST00000592048	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.71	■■■■■ 4.43
ERC1-224	ENST00000592048	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.7	■■■■■ 4.43
ERC1-224	ENST00000592048	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.69	■■■■■ 4.42
ERC1-224	ENST00000592048	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.68	■■■■■ 4.42
ERC1-224	ENST00000592048	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.68	■■■■■ 4.42
ERC1-224	ENST00000592048	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.66	■■■■■ 4.42
ERC1-224	ENST00000592048	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.64	■■■■■ 4.42
ERC1-224	ENST00000592048	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.63	■■■■■ 4.41
ERC1-224	ENST00000592048	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.62	■■■■■ 4.41
ERC1-224	ENST00000592048	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.62	■■■■■ 4.41
ERC1-224	ENST00000592048	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		42.6	■■■■■ 4.41
ERC1-224	ENST00000592048	MLEC	Q14165	292 aa		42.6	■■■■■ 4.41
ERC1-224	ENST00000592048	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.6	■■■■■ 4.41
ERC1-224	ENST00000592048	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.6	■■■■■ 4.41
ERC1-224	ENST00000592048	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.58	■■■■■ 4.41
ERC1-224	ENST00000592048	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.54	■■■■■ 4.4
ERC1-224	ENST00000592048	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.49	■■■■■ 4.39
ERC1-224	ENST00000592048	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.48	■■■■■ 4.39
ERC1-224	ENST00000592048	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.47	■■■■■ 4.39
ERC1-224	ENST00000592048	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
ERC1-224	ENST00000592048	AGL	P35573	1532 aa		42.45	■■■■■ 4.39
ERC1-224	ENST00000592048	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.42	■■■■■ 4.38
ERC1-224	ENST00000592048	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.42	■■■■■ 4.38
ERC1-224	ENST00000592048	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.37	■■■■■ 4.37
ERC1-224	ENST00000592048	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		42.36	■■■■■ 4.37
ERC1-224	ENST00000592048	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.34	■■■■■ 4.37
ERC1-224	ENST00000592048	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.31	■■■■■ 4.36
ERC1-224	ENST00000592048	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		42.28	■■■■■ 4.36
ERC1-224	ENST00000592048	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.25	■■■■■ 4.35
ERC1-224	ENST00000592048	A2M	P01023	1474 aa		42.23	■■■■■ 4.35
ERC1-224	ENST00000592048	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.23	■■■■■ 4.35
ERC1-224	ENST00000592048	APLP2	Q06481	763 aa		42.22	■■■■■ 4.35
ERC1-224	ENST00000592048	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.22	■■■■■ 4.35
ERC1-224	ENST00000592048	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.21	■■■■■ 4.35
ERC1-224	ENST00000592048	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	42.19	■■■■■ 4.34
ERC1-224	ENST00000592048	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.19	■■■■■ 4.34
ERC1-224	ENST00000592048	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.18	■■■■■ 4.34
ERC1-224	ENST00000592048	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.17	■■■■■ 4.34
ERC1-224	ENST00000592048	C3	P01024	1663 aa		42.16	■■■■■ 4.34
ERC1-224	ENST00000592048	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	42.16	■■■■■ 4.34
ERC1-224	ENST00000592048	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.14	■■■■■ 4.34
ERC1-224	ENST00000592048	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		42.12	■■■■■ 4.33
ERC1-224	ENST00000592048	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.12	■■■■■ 4.33
ERC1-224	ENST00000592048	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.11	■■■■■ 4.33
ERC1-224	ENST00000592048	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.06	■■■■■ 4.32
ERC1-224	ENST00000592048	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.03	■■■■■ 4.32
ERC1-224	ENST00000592048	HSPA2	P54652	639 aa		42.03	■■■■■ 4.32
ERC1-224	ENST00000592048	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.02	■■■■■ 4.32
ERC1-224	ENST00000592048	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.02	■■■■■ 4.32
ERC1-224	ENST00000592048	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42	■■■■■ 4.31
ERC1-224	ENST00000592048	GGT6	Q6P531	493 aa		41.98	■■■■■ 4.31
ERC1-224	ENST00000592048	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.96	■■■■■ 4.31
ERC1-224	ENST00000592048	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		41.94	■■■■■ 4.3
ERC1-224	ENST00000592048	ZMYM3	Q14202	1370 aa		41.92	■■■■■ 4.3
ERC1-224	ENST00000592048	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		41.92	■■■■■ 4.3
ERC1-224	ENST00000592048	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		41.91	■■■■■ 4.3
ERC1-224	ENST00000592048	KIF3B	O15066	747 aa		41.86	■■■■■ 4.29
ERC1-224	ENST00000592048	NPAT	Q14207	1427 aa		41.85	■■■■■ 4.29
ERC1-224	ENST00000592048	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		41.83	■■■■■ 4.29
ERC1-224	ENST00000592048	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		41.8	■■■■■ 4.28
ERC1-224	ENST00000592048	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	41.78	■■■■■ 4.28
ERC1-224	ENST00000592048	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		41.75	■■■■■ 4.27
ERC1-224	ENST00000592048	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	41.73	■■■■■ 4.27
ERC1-224	ENST00000592048	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		41.73	■■■■■ 4.27
ERC1-224	ENST00000592048	ABCC5	O15440	1437 aa		41.73	■■■■■ 4.27
ERC1-224	ENST00000592048	STRC	Q7RTU9	1775 aa		41.73	■■■■■ 4.27
ERC1-224	ENST00000592048	PTPRK	Q15262	1439 aa		41.72	■■■■■ 4.27

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