RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, human

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRS-209	ENST00000591760	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		41.35	■■■■■ 4.21
PTPRS-209	ENST00000591760	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		41.33	■■■■■ 4.21
PTPRS-209	ENST00000591760	PREX2	Q70Z35	1606 aa		41.33	■■■■■ 4.21
PTPRS-209	ENST00000591760	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		41.3	■■■■■ 4.2
PTPRS-209	ENST00000591760	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		41.27	■■■■■ 4.2
PTPRS-209	ENST00000591760	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		41.25	■■■■■ 4.19
PTPRS-209	ENST00000591760	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		41.24	■■■■■ 4.19
PTPRS-209	ENST00000591760	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		41.23	■■■■■ 4.19
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		41.19	■■■■■ 4.18
PTPRS-209	ENST00000591760	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		41.16	■■■■■ 4.18
PTPRS-209	ENST00000591760	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		41.15	■■■■■ 4.18
PTPRS-209	ENST00000591760	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		41.14	■■■■■ 4.18
PTPRS-209	ENST00000591760	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.14	■■■■■ 4.18
PTPRS-209	ENST00000591760	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		41.13	■■■■■ 4.18
PTPRS-209	ENST00000591760	ABCC1	P33527	1531 aa		41.13	■■■■■ 4.17
PTPRS-209	ENST00000591760	KDM5C	P41229	1560 aa		41.12	■■■■■ 4.17
PTPRS-209	ENST00000591760	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		41.11	■■■■■ 4.17
PTPRS-209	ENST00000591760	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		41.07	■■■■■ 4.17
PTPRS-209	ENST00000591760	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	41.07	■■■■■ 4.16
PTPRS-209	ENST00000591760	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		41.04	■■■■■ 4.16
PTPRS-209	ENST00000591760	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		41.04	■■■■■ 4.16
PTPRS-209	ENST00000591760	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		41.01	■■■■■ 4.16
PTPRS-209	ENST00000591760	AFAP1	Q8N556	730 aa		41.01	■■■■■ 4.16
PTPRS-209	ENST00000591760	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		41.01	■■■■■ 4.16
PTPRS-209	ENST00000591760	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		41	■■■■■ 4.15
PTPRS-209	ENST00000591760	ATP10A	O60312	1499 aa		41	■■■■■ 4.15
PTPRS-209	ENST00000591760	MADD	Q8WXG6	1647 aa		41	■■■■■ 4.15
PTPRS-209	ENST00000591760	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		40.99	■■■■■ 4.15
PTPRS-209	ENST00000591760	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		40.98	■■■■■ 4.15
PTPRS-209	ENST00000591760	TIAM1	Q13009	1591 aa		40.96	■■■■■ 4.15
PTPRS-209	ENST00000591760	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		40.95	■■■■■ 4.15
PTPRS-209	ENST00000591760	PTPRM	P28827	1452 aa		40.95	■■■■■ 4.15
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	40.94	■■■■■ 4.14
PTPRS-209	ENST00000591760	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		40.94	■■■■■ 4.14
PTPRS-209	ENST00000591760	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	40.92	■■■■■ 4.14
PTPRS-209	ENST00000591760	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		40.92	■■■■■ 4.14
PTPRS-209	ENST00000591760	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		40.91	■■■■■ 4.14
PTPRS-209	ENST00000591760	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		40.91	■■■■■ 4.14
PTPRS-209	ENST00000591760	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		40.9	■■■■■ 4.14
PTPRS-209	ENST00000591760	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	40.89	■■■■■ 4.14
PTPRS-209	ENST00000591760	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	40.88	■■■■■ 4.13
PTPRS-209	ENST00000591760	ABCA6	Q8N139	1617 aa		40.87	■■■■■ 4.13
PTPRS-209	ENST00000591760	RERE	Q9P2R6	1566 aa		40.85	■■■■■ 4.13
PTPRS-209	ENST00000591760	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		40.84	■■■■■ 4.13
PTPRS-209	ENST00000591760	NCOA2	Q15596	1464 aa		40.81	■■■■■ 4.12
PTPRS-209	ENST00000591760	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		40.81	■■■■■ 4.12
PTPRS-209	ENST00000591760	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		40.79	■■■■■ 4.12
PTPRS-209	ENST00000591760	MAP3K1	Q13233	1512 aa		40.78	■■■■■ 4.12
PTPRS-209	ENST00000591760	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		40.77	■■■■■ 4.12
PTPRS-209	ENST00000591760	MLEC	Q14165	292 aa		40.76	■■■■■ 4.12
PTPRS-209	ENST00000591760	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	40.75	■■■■■ 4.11
PTPRS-209	ENST00000591760	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	40.7	■■■■■ 4.11
PTPRS-209	ENST00000591760	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	40.69	■■■■■ 4.1
PTPRS-209	ENST00000591760	AGL	P35573	1532 aa		40.68	■■■■■ 4.1
PTPRS-209	ENST00000591760	ATP7A	Q04656	1500 aa		40.68	■■■■■ 4.1
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	40.65	■■■■■ 4.1
PTPRS-209	ENST00000591760	MBD5	Q9P267	1494 aa		40.61	■■■■■ 4.09
PTPRS-209	ENST00000591760	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		40.6	■■■■■ 4.09
PTPRS-209	ENST00000591760	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	40.55	■■■■■ 4.08
PTPRS-209	ENST00000591760	APLP2	Q06481	763 aa		40.53	■■■■■ 4.08
PTPRS-209	ENST00000591760	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		40.52	■■■■■ 4.08
PTPRS-209	ENST00000591760	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		40.51	■■■■■ 4.08
PTPRS-209	ENST00000591760	PLXNC1	O60486	1568 aa		40.51	■■■■■ 4.08
PTPRS-209	ENST00000591760	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		40.51	■■■■■ 4.07
PTPRS-209	ENST00000591760	A2M	P01023	1474 aa		40.49	■■■■■ 4.07
PTPRS-209	ENST00000591760	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		40.48	■■■■■ 4.07
PTPRS-209	ENST00000591760	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		40.48	■■■■■ 4.07
PTPRS-209	ENST00000591760	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		40.45	■■■■■ 4.07
PTPRS-209	ENST00000591760	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		40.45	■■■■■ 4.07
PTPRS-209	ENST00000591760	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		40.43	■■■■■ 4.06
PTPRS-209	ENST00000591760	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	40.42	■■■■■ 4.06
PTPRS-209	ENST00000591760	MIA2	Q96PC5	1412 aa		40.41	■■■■■ 4.06
PTPRS-209	ENST00000591760	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		40.39	■■■■■ 4.06
PTPRS-209	ENST00000591760	C3	P01024	1663 aa		40.36	■■■■■ 4.05
PTPRS-209	ENST00000591760	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		40.35	■■■■■ 4.05
PTPRS-209	ENST00000591760	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	40.34	■■■■■ 4.05
PTPRS-209	ENST00000591760	MROH2A	A6NES4	1674 aa		40.31	■■■■■ 4.04
PTPRS-209	ENST00000591760	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	40.27	■■■■■ 4.04
PTPRS-209	ENST00000591760	TSPY4	P0CV99	314 aa		40.27	■■■■■ 4.04
PTPRS-209	ENST00000591760	TSPY10	P0CW01	314 aa		40.27	■■■■■ 4.04
PTPRS-209	ENST00000591760	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		40.25	■■■■■ 4.03
PTPRS-209	ENST00000591760	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	40.22	■■■■■ 4.03
PTPRS-209	ENST00000591760	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
PTPRS-209	ENST00000591760	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		40.2	■■■■■ 4.03
PTPRS-209	ENST00000591760	GGT6	Q6P531	493 aa		40.19	■■■■■ 4.02
PTPRS-209	ENST00000591760	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		40.18	■■■■■ 4.02
PTPRS-209	ENST00000591760	HSPA2	P54652	639 aa		40.18	■■■■■ 4.02
PTPRS-209	ENST00000591760	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		40.16	■■■■■ 4.02
PTPRS-209	ENST00000591760	ZMYM3	Q14202	1370 aa		40.14	■■■■■ 4.02
PTPRS-209	ENST00000591760	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		40.14	■■■■■ 4.02
PTPRS-209	ENST00000591760	NPAT	Q14207	1427 aa		40.11	■■■■■ 4.01
PTPRS-209	ENST00000591760	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		40.11	■■■■■ 4.01
PTPRS-209	ENST00000591760	KIF3B	O15066	747 aa		40.09	■■■■■ 4.01
PTPRS-209	ENST00000591760	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	40.08	■■■■■ 4.01
PTPRS-209	ENST00000591760	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		40.08	■■■■■ 4.01
PTPRS-209	ENST00000591760	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		40.07	■■■■■ 4.01
PTPRS-209	ENST00000591760	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	40.04	■■■■■ 4
PTPRS-209	ENST00000591760	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	40.02	■■■■■ 4
PTPRS-209	ENST00000591760	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		40.02	■■■■■ 4
PTPRS-209	ENST00000591760	ABCC5	O15440	1437 aa		40.01	■■■■■ 4

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