RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591357.5

JRK-208, Transcript of Jrk helix-turn-helix protein, human

TSL 4

Gene JRK, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JRK-208	ENST00000591357	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		34.01	■■■■□ 3.03
JRK-208	ENST00000591357	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		34	■■■■□ 3.03
JRK-208	ENST00000591357	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		34	■■■■□ 3.03
JRK-208	ENST00000591357	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		34	■■■■□ 3.03
JRK-208	ENST00000591357	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.98	■■■■□ 3.03
JRK-208	ENST00000591357	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.98	■■■■□ 3.03
JRK-208	ENST00000591357	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.97	■■■■□ 3.03
JRK-208	ENST00000591357	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		33.96	■■■■□ 3.03
JRK-208	ENST00000591357	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.92	■■■■□ 3.02
JRK-208	ENST00000591357	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		33.91	■■■■□ 3.02
JRK-208	ENST00000591357	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.91	■■■■□ 3.02
JRK-208	ENST00000591357	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.89	■■■■□ 3.02
JRK-208	ENST00000591357	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.89	■■■■□ 3.02
JRK-208	ENST00000591357	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.88	■■■■□ 3.01
JRK-208	ENST00000591357	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.88	■■■■□ 3.01
JRK-208	ENST00000591357	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.87	■■■■□ 3.01
JRK-208	ENST00000591357	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.86	■■■■□ 3.01
JRK-208	ENST00000591357	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.84	■■■■□ 3.01
JRK-208	ENST00000591357	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.84	■■■■□ 3.01
JRK-208	ENST00000591357	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.83	■■■■□ 3.01
JRK-208	ENST00000591357	ATP10A	O60312	1499 aa		33.82	■■■■□ 3.01
JRK-208	ENST00000591357	KDM5C	P41229	1560 aa		33.81	■■■■□ 3
JRK-208	ENST00000591357	PTPRM	P28827	1452 aa		33.8	■■■■□ 3
JRK-208	ENST00000591357	ABCC1	P33527	1531 aa		33.79	■■■■□ 3
JRK-208	ENST00000591357	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.78	■■■■□ 3
JRK-208	ENST00000591357	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.78	■■■■□ 3
JRK-208	ENST00000591357	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.76	■■■□□ 2.99
JRK-208	ENST00000591357	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.76	■■■□□ 2.99
JRK-208	ENST00000591357	MLEC	Q14165	292 aa		33.75	■■■□□ 2.99
JRK-208	ENST00000591357	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.75	■■■□□ 2.99
JRK-208	ENST00000591357	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.75	■■■□□ 2.99
JRK-208	ENST00000591357	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.74	■■■□□ 2.99
JRK-208	ENST00000591357	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.73	■■■□□ 2.99
JRK-208	ENST00000591357	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.73	■■■□□ 2.99
JRK-208	ENST00000591357	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.72	■■■□□ 2.99
JRK-208	ENST00000591357	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.71	■■■□□ 2.99
JRK-208	ENST00000591357	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.68	■■■□□ 2.98
JRK-208	ENST00000591357	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.67	■■■□□ 2.98
JRK-208	ENST00000591357	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.66	■■■□□ 2.98
JRK-208	ENST00000591357	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.65	■■■□□ 2.98
JRK-208	ENST00000591357	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.65	■■■□□ 2.98
JRK-208	ENST00000591357	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.63	■■■□□ 2.97
JRK-208	ENST00000591357	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.62	■■■□□ 2.97
JRK-208	ENST00000591357	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.61	■■■□□ 2.97
JRK-208	ENST00000591357	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.61	■■■□□ 2.97
JRK-208	ENST00000591357	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.6	■■■□□ 2.97
JRK-208	ENST00000591357	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
JRK-208	ENST00000591357	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.59	■■■□□ 2.97
JRK-208	ENST00000591357	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
JRK-208	ENST00000591357	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.57	■■■□□ 2.96
JRK-208	ENST00000591357	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.56	■■■□□ 2.96
JRK-208	ENST00000591357	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.56	■■■□□ 2.96
JRK-208	ENST00000591357	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
JRK-208	ENST00000591357	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.53	■■■□□ 2.96
JRK-208	ENST00000591357	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.52	■■■□□ 2.96
JRK-208	ENST00000591357	AGL	P35573	1532 aa		33.5	■■■□□ 2.95
JRK-208	ENST00000591357	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.49	■■■□□ 2.95
JRK-208	ENST00000591357	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
JRK-208	ENST00000591357	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.43	■■■□□ 2.94
JRK-208	ENST00000591357	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
JRK-208	ENST00000591357	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.4	■■■□□ 2.94
JRK-208	ENST00000591357	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.39	■■■□□ 2.94
JRK-208	ENST00000591357	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.37	■■■□□ 2.93
JRK-208	ENST00000591357	A2M	P01023	1474 aa		33.37	■■■□□ 2.93
JRK-208	ENST00000591357	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.36	■■■□□ 2.93
JRK-208	ENST00000591357	APLP2	Q06481	763 aa		33.34	■■■□□ 2.93
JRK-208	ENST00000591357	HSPA2	P54652	639 aa		33.32	■■■□□ 2.92
JRK-208	ENST00000591357	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
JRK-208	ENST00000591357	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.3	■■■□□ 2.92
JRK-208	ENST00000591357	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.3	■■■□□ 2.92
JRK-208	ENST00000591357	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
JRK-208	ENST00000591357	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.27	■■■□□ 2.92
JRK-208	ENST00000591357	GGT6	Q6P531	493 aa		33.26	■■■□□ 2.91
JRK-208	ENST00000591357	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.25	■■■□□ 2.91
JRK-208	ENST00000591357	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.25	■■■□□ 2.91
JRK-208	ENST00000591357	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.25	■■■□□ 2.91
JRK-208	ENST00000591357	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.24	■■■□□ 2.91
JRK-208	ENST00000591357	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.23	■■■□□ 2.91
JRK-208	ENST00000591357	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.22	■■■□□ 2.91
JRK-208	ENST00000591357	C3	P01024	1663 aa		33.21	■■■□□ 2.91
JRK-208	ENST00000591357	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
JRK-208	ENST00000591357	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.2	■■■□□ 2.9
JRK-208	ENST00000591357	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.17	■■■□□ 2.9
JRK-208	ENST00000591357	KIF3B	O15066	747 aa		33.15	■■■□□ 2.9
JRK-208	ENST00000591357	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.13	■■■□□ 2.89
JRK-208	ENST00000591357	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.1	■■■□□ 2.89
JRK-208	ENST00000591357	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.09	■■■□□ 2.89
JRK-208	ENST00000591357	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
JRK-208	ENST00000591357	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.07	■■■□□ 2.88
JRK-208	ENST00000591357	NPAT	Q14207	1427 aa		33.03	■■■□□ 2.88
JRK-208	ENST00000591357	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.03	■■■□□ 2.88
JRK-208	ENST00000591357	ABCC5	O15440	1437 aa		33.02	■■■□□ 2.88
JRK-208	ENST00000591357	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.02	■■■□□ 2.88
JRK-208	ENST00000591357	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
JRK-208	ENST00000591357	PTPRK	Q15262	1439 aa		33	■■■□□ 2.87
JRK-208	ENST00000591357	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
JRK-208	ENST00000591357	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.95	■■■□□ 2.86
JRK-208	ENST00000591357	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.93	■■■□□ 2.86
JRK-208	ENST00000591357	DAPK1	P53355	1430 aa		32.93	■■■□□ 2.86
JRK-208	ENST00000591357	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86

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