RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.66□□□□□ -1.18
CAPNS1-210ENST00000590211 TIE1P35590 1138 aa7.66□□□□□ -1.18
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CAPNS1-210ENST00000590211 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.66□□□□□ -1.18
CAPNS1-210ENST00000590211 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.65□□□□□ -1.18
CAPNS1-210ENST00000590211 GOLGA2Q08379 1002 aa7.64□□□□□ -1.19
CAPNS1-210ENST00000590211 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
CAPNS1-210ENST00000590211 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.62□□□□□ -1.19
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR37O15354 613 aa7.61□□□□□ -1.19
CAPNS1-210ENST00000590211 DSG2Q14126 1118 aa7.61□□□□□ -1.19
CAPNS1-210ENST00000590211 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.61□□□□□ -1.19
CAPNS1-210ENST00000590211 DPYSL4O14531 572 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-210ENST00000590211 PDIA6Q15084 440 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-210ENST00000590211 AK7Q96M32 723 aa7.6□□□□□ -1.19
CAPNS1-210ENST00000590211 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-210ENST00000590211 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXK1P85037 733 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-210ENST00000590211 MICALL2Q8IY33 904 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-210ENST00000590211 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.58□□□□□ -1.2
CAPNS1-210ENST00000590211 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF3CO14782 793 aa7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-210ENST00000590211 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM66O15016 1216 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-210ENST00000590211 IL27Q8NEV9 243 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-210ENST00000590211 ZMYND15Q9H091 742 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-210ENST00000590211 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-210ENST00000590211 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-210ENST00000590211 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-210ENST00000590211 KDM4CQ9H3R0 1056 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-210ENST00000590211 C2orf72A6NCS6 295 aa7.52□□□□□ -1.21
CAPNS1-210ENST00000590211 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CAPNS1-210ENST00000590211 PDE4DQ08499 809 aa7.52□□□□□ -1.21
CAPNS1-210ENST00000590211 PLPP6Q8IY26 295 aa7.52□□□□□ -1.21
CAPNS1-210ENST00000590211 EVX2Q03828 476 aa7.51□□□□□ -1.21
CAPNS1-210ENST00000590211 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.51□□□□□ -1.21
CAPNS1-210ENST00000590211 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.5□□□□□ -1.21
CAPNS1-210ENST00000590211 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-210ENST00000590211 TMC2Q8TDI7 906 aa7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-210ENST00000590211 OSBPP22059 807 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-210ENST00000590211 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-210ENST00000590211 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-210ENST00000590211 OCEL1Q9H607 264 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-210ENST00000590211 PTGER2P43116 358 aa7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 OXER1Q8TDS5 423 aa7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 IER5LQ5T953 404 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM117AQ9C073 453 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 IRF6O14896 467 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 FECHP22830 423 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP2K5Q13163 448 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 AMHR2Q16671 573 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC102AQ96A19 550 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 CLCN6P51797 869 aa7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP3K9P80192 1104 aa7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 GNPATO15228 680 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.224e-10■■■■□ 22.9
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.41□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 NUTM2FA1L443 756 aa7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 HIC1Q14526 733 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 ARID3AQ99856 593 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 POTEFA5A3E0 1075 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 HRCP23327 699 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 PTGDRQ13258 359 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 DDX12PQ92771 950 aa7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 FCHSD2O94868 740 aa7.37□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 HAX1O00165 279 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 EVI5O60447 810 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 PLCG2P16885 1265 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 ARID3CA6NKF2 412 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CAPNS1-210ENST00000590211 APBB1O00213 710 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-210ENST00000590211 FLIIQ13045 1269 aa7.33□□□□□ -1.24
CAPNS1-210ENST00000590211 G3V3G9 751 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D12O60347 775 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-210ENST00000590211 MS4A1P11836 297 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-210ENST00000590211 GOPCQ9HD26 462 aa7.32□□□□□ -1.24
CAPNS1-210ENST00000590211 GABBR2O75899 941 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC34A2O95436 690 aa7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-210ENST00000590211 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CAPNS1-210ENST00000590211 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.31□□□□□ -1.24
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