RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589363.5

SLC39A3-205, Transcript of solute carrier family 39 member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SLC39A3, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3-205ENST00000589363 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.13■■■□□ 2.57
SLC39A3-205ENST00000589363 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.13■■■□□ 2.57
SLC39A3-205ENST00000589363 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.13■■■□□ 2.57
SLC39A3-205ENST00000589363 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.13■■■□□ 2.57
SLC39A3-205ENST00000589363 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.1■■■□□ 2.57
SLC39A3-205ENST00000589363 PTPRMP28827 1452 aa31.09■■■□□ 2.57
SLC39A3-205ENST00000589363 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.08■■■□□ 2.57
SLC39A3-205ENST00000589363 MADDQ8WXG6 1647 aa31.08■■■□□ 2.57
SLC39A3-205ENST00000589363 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.07■■■□□ 2.56
SLC39A3-205ENST00000589363 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.06■■■□□ 2.56
SLC39A3-205ENST00000589363 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.06■■■□□ 2.56
SLC39A3-205ENST00000589363 MLECQ14165 292 aa31.01■■■□□ 2.55
SLC39A3-205ENST00000589363 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.01■■■□□ 2.55
SLC39A3-205ENST00000589363 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
SLC39A3-205ENST00000589363 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.98■■■□□ 2.55
SLC39A3-205ENST00000589363 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.95■■■□□ 2.55
SLC39A3-205ENST00000589363 PREX2Q70Z35 1606 aa30.95■■■□□ 2.55
SLC39A3-205ENST00000589363 AFAP1Q8N556 730 aa30.93■■■□□ 2.54
SLC39A3-205ENST00000589363 ATP10AO60312 1499 aa30.93■■■□□ 2.54
SLC39A3-205ENST00000589363 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.92■■■□□ 2.54
SLC39A3-205ENST00000589363 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.92■■■□□ 2.54
SLC39A3-205ENST00000589363 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
SLC39A3-205ENST00000589363 KDM5CP41229 1560 aa30.86■■■□□ 2.53
SLC39A3-205ENST00000589363 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.86■■■□□ 2.53
SLC39A3-205ENST00000589363 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.86■■■□□ 2.53
SLC39A3-205ENST00000589363 ABCC1P33527 1531 aa30.85■■■□□ 2.53
SLC39A3-205ENST00000589363 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.83■■■□□ 2.53
SLC39A3-205ENST00000589363 CEP162Q5TB80 1403 aa30.82■■■□□ 2.52
SLC39A3-205ENST00000589363 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.81■■■□□ 2.52
SLC39A3-205ENST00000589363 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.8■■■□□ 2.52
SLC39A3-205ENST00000589363 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.78■■■□□ 2.52
SLC39A3-205ENST00000589363 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.78■■■□□ 2.52
SLC39A3-205ENST00000589363 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.76■■■□□ 2.51
SLC39A3-205ENST00000589363 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.76■■■□□ 2.51
SLC39A3-205ENST00000589363 ABCA6Q8N139 1617 aa30.75■■■□□ 2.51
SLC39A3-205ENST00000589363 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.75■■■□□ 2.51
SLC39A3-205ENST00000589363 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
SLC39A3-205ENST00000589363 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
SLC39A3-205ENST00000589363 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
SLC39A3-205ENST00000589363 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.72■■■□□ 2.51
SLC39A3-205ENST00000589363 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.72■■■□□ 2.51
SLC39A3-205ENST00000589363 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
SLC39A3-205ENST00000589363 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.68■■■□□ 2.5
SLC39A3-205ENST00000589363 HSPA2P54652 639 aa30.68■■■□□ 2.5
SLC39A3-205ENST00000589363 REREQ9P2R6 1566 aa30.67■■■□□ 2.5
SLC39A3-205ENST00000589363 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.67■■■□□ 2.5
SLC39A3-205ENST00000589363 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.65■■■□□ 2.5
SLC39A3-205ENST00000589363 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
SLC39A3-205ENST00000589363 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
SLC39A3-205ENST00000589363 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.64■■■□□ 2.5
SLC39A3-205ENST00000589363 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.61■■■□□ 2.49
SLC39A3-205ENST00000589363 TIAM1Q13009 1591 aa30.58■■■□□ 2.49
SLC39A3-205ENST00000589363 AGLP35573 1532 aa30.58■■■□□ 2.49
SLC39A3-205ENST00000589363 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.57■■■□□ 2.48
SLC39A3-205ENST00000589363 ATP7AQ04656 1500 aa30.55■■■□□ 2.48
SLC39A3-205ENST00000589363 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.55■■■□□ 2.48
SLC39A3-205ENST00000589363 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.48
SLC39A3-205ENST00000589363 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
SLC39A3-205ENST00000589363 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
SLC39A3-205ENST00000589363 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.48■■■□□ 2.47
SLC39A3-205ENST00000589363 C3P01024 1663 aa30.48■■■□□ 2.47
SLC39A3-205ENST00000589363 NCOA2Q15596 1464 aa30.47■■■□□ 2.47
SLC39A3-205ENST00000589363 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.47■■■□□ 2.47
SLC39A3-205ENST00000589363 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.46■■■□□ 2.47
SLC39A3-205ENST00000589363 A2MP01023 1474 aa30.45■■■□□ 2.47
SLC39A3-205ENST00000589363 GGT6Q6P531 493 aa30.39■■■□□ 2.46
SLC39A3-205ENST00000589363 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
SLC39A3-205ENST00000589363 FBXO41Q8TF61 875 aa30.38■■■□□ 2.45
SLC39A3-205ENST00000589363 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.38■■■□□ 2.45
SLC39A3-205ENST00000589363 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.38■■■□□ 2.45
SLC39A3-205ENST00000589363 MBD5Q9P267 1494 aa30.38■■■□□ 2.45
SLC39A3-205ENST00000589363 PLXNC1O60486 1568 aa30.37■■■□□ 2.45
SLC39A3-205ENST00000589363 MROH2AA6NES4 1674 aa30.34■■■□□ 2.45
SLC39A3-205ENST00000589363 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.34■■■□□ 2.45
SLC39A3-205ENST00000589363 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.34■■■□□ 2.45
SLC39A3-205ENST00000589363 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
SLC39A3-205ENST00000589363 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.31■■■□□ 2.44
SLC39A3-205ENST00000589363 ZMYM3Q14202 1370 aa30.31■■■□□ 2.44
SLC39A3-205ENST00000589363 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.29■■■□□ 2.44
SLC39A3-205ENST00000589363 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.28■■■□□ 2.44
SLC39A3-205ENST00000589363 APLP2Q06481 763 aa30.27■■■□□ 2.44
SLC39A3-205ENST00000589363 NPATQ14207 1427 aa30.25■■■□□ 2.43
SLC39A3-205ENST00000589363 TSPY4P0CV99 314 aa30.25■■■□□ 2.43
SLC39A3-205ENST00000589363 TSPY10P0CW01 314 aa30.25■■■□□ 2.43
SLC39A3-205ENST00000589363 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
SLC39A3-205ENST00000589363 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
SLC39A3-205ENST00000589363 STRCQ7RTU9 1775 aa30.23■■■□□ 2.43
SLC39A3-205ENST00000589363 MAP3K1Q13233 1512 aa30.22■■■□□ 2.43
SLC39A3-205ENST00000589363 KIF3BO15066 747 aa30.22■■■□□ 2.43
SLC39A3-205ENST00000589363 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.21■■■□□ 2.43
SLC39A3-205ENST00000589363 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.2■■■□□ 2.43
SLC39A3-205ENST00000589363 CERKQ8TCT0 537 aa30.2■■■□□ 2.43
SLC39A3-205ENST00000589363 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.15■■■□□ 2.42
SLC39A3-205ENST00000589363 PTPRKQ15262 1439 aa30.13■■■□□ 2.41
SLC39A3-205ENST00000589363 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.13■■■□□ 2.41
SLC39A3-205ENST00000589363 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.13■■■□□ 2.41
SLC39A3-205ENST00000589363 NCOA1Q15788 1441 aa30.11■■■□□ 2.41
SLC39A3-205ENST00000589363 PTPRTO14522 1441 aa30.1■■■□□ 2.41
SLC39A3-205ENST00000589363 MIA2Q96PC5 1412 aa30.1■■■□□ 2.41
SLC39A3-205ENST00000589363 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms