RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589217.1

TNRC6C-AS1-201, TNRC6C antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNRC6C-AS1, Length 3,192 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13.76□□□□□ -0.21
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa13.76□□□□□ -0.21
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.75□□□□□ -0.21
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.74□□□□□ -0.21
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CROCC2H7BZ55 1655 aa13.74□□□□□ -0.21
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ARAP3Q8WWN8 1544 aa13.72□□□□□ -0.21
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.71□□□□□ -0.21
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 WDR7Q9Y4E6 1490 aa13.71□□□□□ -0.21
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ABCA9Q8IUA7 1624 aa13.71□□□□□ -0.22
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa13.71□□□□□ -0.22
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa13.7□□□□□ -0.22
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ADGBQ8N7X0 1667 aa13.7□□□□□ -0.22
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 AKNAQ7Z591 1439 aa13.7□□□□□ -0.22
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ARHGEF5Q12774 1597 aa13.68□□□□□ -0.22
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 PTPRKQ15262 1439 aa13.67□□□□□ -0.22
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa13.67□□□□□ -0.22
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 MAPKBP1O60336 1514 aa13.67□□□□□ -0.22
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 DAPK1P53355 1430 aa13.66□□□□□ -0.22
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 HFM1A2PYH4 1435 aa13.65□□□□□ -0.22
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ASXL2Q76L83 1435 aa13.65□□□□□ -0.22
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 SETD5Q9C0A6 1442 aa13.65□□□□□ -0.22
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.65□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 PLCH2O75038 1416 aa13.64□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ROCK1Q13464 1354 aa13.63□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ABCC5O15440 1437 aa13.63□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ADGRL2O95490 1459 aa13.62□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa13.62□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.62□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ARHGAP5Q13017 1502 aa13.62□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 MBD5Q9P267 1494 aa13.6□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 NAIPQ13075 1403 aa13.6□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa13.6□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa13.6□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.6□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ABCC1P33527 1531 aa13.59□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP13.59□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 GLI2P10070 1586 aa13.59□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ITGAEP38570 1179 aa13.59□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 PLPPR3Q6T4P5 718 aa13.59□□□□□ -0.23
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CCDC141Q6ZP82 1450 aa13.57□□□□□ -0.24
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa13.57□□□□□ -0.24
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.57□□□□□ -0.24
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CLSPNQ9HAW4 1339 aa13.56□□□□□ -0.24
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 RSPH4AQ5TD94 716 aa13.56□□□□□ -0.24
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 PLXNC1O60486 1568 aa13.55□□□□□ -0.24
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 KCNH8Q96L42 1107 aa13.54□□□□□ -0.24
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 NCOA1Q15788 1441 aa13.53□□□□□ -0.24
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 KDM6BO15054 1643 aa13.53□□□□□ -0.24
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 MIER1Q8N108 512 aa13.53□□□□□ -0.24
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa13.52□□□□□ -0.24
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.52□□□□□ -0.25
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 DIP2BQ9P265 1576 aa13.52□□□□□ -0.25
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 FANCAO15360 1455 aa13.51□□□□□ -0.25
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa13.51□□□□□ -0.25
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CCDC136Q96JN2 1154 aa13.51□□□□□ -0.25
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CYB5RLQ6IPT4 315 aa13.51□□□□□ -0.25
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa13.5□□□□□ -0.25
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CD109Q6YHK3 1445 aa13.47□□□□□ -0.25
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 NEO1Q92859 1461 aa13.47□□□□□ -0.25
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 KIF13AQ9H1H9 1805 aa13.47□□□□□ -0.25
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.47□□□□□ -0.25
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP13.46□□□□□ -0.25
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 CHIC2Q9UKJ5 165 aa13.46□□□□□ -0.25
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.46□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ADGRL1O94910 1474 aa13.45□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.45□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 TSPY4P0CV99 314 aa13.45□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 TSPY10P0CW01 314 aa13.45□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 BCANQ96GW7 911 aa13.45□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.45□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 KDM5CP41229 1560 aa13.45□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.44□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.44□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 UNC13BO14795 1591 aa13.44□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.42□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ATP7AQ04656 1500 aa13.42□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 RICTORQ6R327 1708 aa13.42□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 KIF15Q9NS87 1388 aa13.41□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13.41□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa13.41□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 ERBINQ96RT1 1412 aa13.41□□□□□ -0.26
TNRC6C-AS1-201ENST00000589217 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms