RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589132.1

ERC1-223, Transcript of ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1, human

TSL 3

Gene ERC1, Length 868 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERC1-223	ENST00000589132	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.81	■■■□□ 2.68
ERC1-223	ENST00000589132	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.8	■■■□□ 2.68
ERC1-223	ENST00000589132	PTPRM	P28827	1452 aa		31.77	■■■□□ 2.68
ERC1-223	ENST00000589132	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		31.76	■■■□□ 2.68
ERC1-223	ENST00000589132	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		31.75	■■■□□ 2.67
ERC1-223	ENST00000589132	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
ERC1-223	ENST00000589132	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.72	■■■□□ 2.67
ERC1-223	ENST00000589132	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.71	■■■□□ 2.67
ERC1-223	ENST00000589132	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		31.7	■■■□□ 2.67
ERC1-223	ENST00000589132	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.69	■■■□□ 2.66
ERC1-223	ENST00000589132	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		31.65	■■■□□ 2.66
ERC1-223	ENST00000589132	ATP10A	O60312	1499 aa		31.62	■■■□□ 2.65
ERC1-223	ENST00000589132	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.62	■■■□□ 2.65
ERC1-223	ENST00000589132	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
ERC1-223	ENST00000589132	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		31.59	■■■□□ 2.65
ERC1-223	ENST00000589132	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.58	■■■□□ 2.65
ERC1-223	ENST00000589132	AFAP1	Q8N556	730 aa		31.58	■■■□□ 2.65
ERC1-223	ENST00000589132	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		31.58	■■■□□ 2.65
ERC1-223	ENST00000589132	MLEC	Q14165	292 aa		31.56	■■■□□ 2.64
ERC1-223	ENST00000589132	KDM5C	P41229	1560 aa		31.55	■■■□□ 2.64
ERC1-223	ENST00000589132	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		31.54	■■■□□ 2.64
ERC1-223	ENST00000589132	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.5	■■■□□ 2.63
ERC1-223	ENST00000589132	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.48	■■■□□ 2.63
ERC1-223	ENST00000589132	ABCC1	P33527	1531 aa		31.48	■■■□□ 2.63
ERC1-223	ENST00000589132	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.47	■■■□□ 2.63
ERC1-223	ENST00000589132	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.45	■■■□□ 2.63
ERC1-223	ENST00000589132	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.44	■■■□□ 2.62
ERC1-223	ENST00000589132	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
ERC1-223	ENST00000589132	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		31.43	■■■□□ 2.62
ERC1-223	ENST00000589132	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.43	■■■□□ 2.62
ERC1-223	ENST00000589132	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.42	■■■□□ 2.62
ERC1-223	ENST00000589132	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		31.41	■■■□□ 2.62
ERC1-223	ENST00000589132	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.41	■■■□□ 2.62
ERC1-223	ENST00000589132	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
ERC1-223	ENST00000589132	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.4	■■■□□ 2.62
ERC1-223	ENST00000589132	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
ERC1-223	ENST00000589132	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.4	■■■□□ 2.62
ERC1-223	ENST00000589132	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.39	■■■□□ 2.62
ERC1-223	ENST00000589132	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
ERC1-223	ENST00000589132	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.35	■■■□□ 2.61
ERC1-223	ENST00000589132	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.33	■■■□□ 2.61
ERC1-223	ENST00000589132	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		31.33	■■■□□ 2.61
ERC1-223	ENST00000589132	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.31	■■■□□ 2.6
ERC1-223	ENST00000589132	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
ERC1-223	ENST00000589132	AGL	P35573	1532 aa		31.3	■■■□□ 2.6
ERC1-223	ENST00000589132	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.3	■■■□□ 2.6
ERC1-223	ENST00000589132	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.3	■■■□□ 2.6
ERC1-223	ENST00000589132	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
ERC1-223	ENST00000589132	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.29	■■■□□ 2.6
ERC1-223	ENST00000589132	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.28	■■■□□ 2.6
ERC1-223	ENST00000589132	HSPA2	P54652	639 aa		31.25	■■■□□ 2.59
ERC1-223	ENST00000589132	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
ERC1-223	ENST00000589132	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.21	■■■□□ 2.59
ERC1-223	ENST00000589132	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.21	■■■□□ 2.59
ERC1-223	ENST00000589132	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.18	■■■□□ 2.58
ERC1-223	ENST00000589132	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ERC1-223	ENST00000589132	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		31.16	■■■□□ 2.58
ERC1-223	ENST00000589132	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.15	■■■□□ 2.58
ERC1-223	ENST00000589132	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.13	■■■□□ 2.57
ERC1-223	ENST00000589132	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
ERC1-223	ENST00000589132	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.12	■■■□□ 2.57
ERC1-223	ENST00000589132	C3	P01024	1663 aa		31.12	■■■□□ 2.57
ERC1-223	ENST00000589132	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
ERC1-223	ENST00000589132	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.1	■■■□□ 2.57
ERC1-223	ENST00000589132	A2M	P01023	1474 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ERC1-223	ENST00000589132	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ERC1-223	ENST00000589132	NCOA2	Q15596	1464 aa		31.07	■■■□□ 2.56
ERC1-223	ENST00000589132	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.06	■■■□□ 2.56
ERC1-223	ENST00000589132	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.05	■■■□□ 2.56
ERC1-223	ENST00000589132	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.04	■■■□□ 2.56
ERC1-223	ENST00000589132	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.04	■■■□□ 2.56
ERC1-223	ENST00000589132	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.04	■■■□□ 2.56
ERC1-223	ENST00000589132	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.03	■■■□□ 2.56
ERC1-223	ENST00000589132	MROH2A	A6NES4	1674 aa		31.03	■■■□□ 2.56
ERC1-223	ENST00000589132	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.01	■■■□□ 2.55
ERC1-223	ENST00000589132	GGT6	Q6P531	493 aa		30.99	■■■□□ 2.55
ERC1-223	ENST00000589132	ZMYM3	Q14202	1370 aa		30.99	■■■□□ 2.55
ERC1-223	ENST00000589132	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		30.97	■■■□□ 2.55
ERC1-223	ENST00000589132	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		30.96	■■■□□ 2.55
ERC1-223	ENST00000589132	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		30.96	■■■□□ 2.55
ERC1-223	ENST00000589132	NPAT	Q14207	1427 aa		30.96	■■■□□ 2.55
ERC1-223	ENST00000589132	MAP3K1	Q13233	1512 aa		30.94	■■■□□ 2.54
ERC1-223	ENST00000589132	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	30.93	■■■□□ 2.54
ERC1-223	ENST00000589132	TSPY4	P0CV99	314 aa		30.92	■■■□□ 2.54
ERC1-223	ENST00000589132	TSPY10	P0CW01	314 aa		30.92	■■■□□ 2.54
ERC1-223	ENST00000589132	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	30.92	■■■□□ 2.54
ERC1-223	ENST00000589132	STRC	Q7RTU9	1775 aa		30.92	■■■□□ 2.54
ERC1-223	ENST00000589132	CERK	Q8TCT0	537 aa		30.88	■■■□□ 2.53
ERC1-223	ENST00000589132	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		30.87	■■■□□ 2.53
ERC1-223	ENST00000589132	APLP2	Q06481	763 aa		30.85	■■■□□ 2.53
ERC1-223	ENST00000589132	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	30.84	■■■□□ 2.53
ERC1-223	ENST00000589132	KIF3B	O15066	747 aa		30.83	■■■□□ 2.53
ERC1-223	ENST00000589132	PTPRT	O14522	1441 aa		30.82	■■■□□ 2.52
ERC1-223	ENST00000589132	PTPRK	Q15262	1439 aa		30.8	■■■□□ 2.52
ERC1-223	ENST00000589132	MIA2	Q96PC5	1412 aa		30.8	■■■□□ 2.52
ERC1-223	ENST00000589132	NCOA1	Q15788	1441 aa		30.77	■■■□□ 2.52
ERC1-223	ENST00000589132	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		30.77	■■■□□ 2.52
ERC1-223	ENST00000589132	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		30.76	■■■□□ 2.51
ERC1-223	ENST00000589132	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		30.74	■■■□□ 2.51
ERC1-223	ENST00000589132	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		30.73	■■■□□ 2.51

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