RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 FANCAO15360 1455 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-211ENST00000588374 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-211ENST00000588374 PHLDB1Q86UU1 1377 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-211ENST00000588374 NEO1Q92859 1461 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-211ENST00000588374 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-211ENST00000588374 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-211ENST00000588374 ARAP3Q8WWN8 1544 aa10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
EFTUD2-211ENST00000588374 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-211ENST00000588374 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-211ENST00000588374 CFAP74Q9C0B2 1584 aa10.69□□□□□ -0.7
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGAP5Q13017 1502 aa10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-211ENST00000588374 TIAM1Q13009 1591 aa10.68□□□□□ -0.7
EFTUD2-211ENST00000588374 SCAPERQ9BY12 1400 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-211ENST00000588374 CCNB3Q8WWL7 1395 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-211ENST00000588374 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-211ENST00000588374 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-211ENST00000588374 MYT1LQ9UL68 1186 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-211ENST00000588374 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-211ENST00000588374 ADGRL1O94910 1474 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-211ENST00000588374 PREX2Q70Z35 1606 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-211ENST00000588374 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa10.65□□□□□ -0.7
EFTUD2-211ENST00000588374 RICTORQ6R327 1708 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-211ENST00000588374 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-211ENST00000588374 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-211ENST00000588374 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-211ENST00000588374 AFAP1Q8N556 730 aa10.64□□□□□ -0.71
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP3K1Q13233 1512 aa10.63□□□□□ -0.71
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-211ENST00000588374 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa10.62□□□□□ -0.71
EFTUD2-211ENST00000588374 NCOA2Q15596 1464 aa10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-211ENST00000588374 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-211ENST00000588374 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-211ENST00000588374 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-211ENST00000588374 ITSN2Q9NZM3 1697 aa10.6□□□□□ -0.71
EFTUD2-211ENST00000588374 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
EFTUD2-211ENST00000588374 POGZQ7Z3K3 1410 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCC1P33527 1531 aa10.58□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 YEATS2Q9ULM3 1422 aa10.57□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 SYCP2Q9BX26 1530 aa10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 MAGI2Q86UL8 1455 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa10.55□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 MLECQ14165 292 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP10AO60312 1499 aa10.54□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 KDM5CP41229 1560 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 MYOM3Q5VTT5 1437 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa10.53□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 HECW2Q9P2P5 1572 aa10.52□□□□□ -0.72
EFTUD2-211ENST00000588374 TSPY4P0CV99 314 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 TSPY10P0CW01 314 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 RSPH4AQ5TD94 716 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 MLH3Q9UHC1 1453 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa10.52□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 MBD5Q9P267 1494 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa10.51□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCA6Q8N139 1617 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 BCORL1Q5H9F3 1711 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 MIA2Q96PC5 1412 aa10.5□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPN23Q9H3S7 1636 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 C9orf84Q5VXU9 1444 aa10.49□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP7AQ04656 1500 aa10.48□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAMTSL3P82987 1691 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 FGD6Q6ZV73 1430 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC141Q6ZP82 1450 aa10.47□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 CHIC2Q9UKJ5 165 aa10.46□□□□□ -0.73
EFTUD2-211ENST00000588374 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa10.46□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGEF5Q12774 1597 aa10.46□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 ADGBQ8N7X0 1667 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 MADDQ8WXG6 1647 aa10.45□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 A2MP01023 1474 aa10.44□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 GGT6Q6P531 493 aa10.44□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF3BO15066 747 aa10.43□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 ITGAEP38570 1179 aa10.43□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa10.43□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa10.43□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 REREQ9P2R6 1566 aa10.43□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCC5O15440 1437 aa10.42□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPRMP28827 1452 aa10.42□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 DAPK1P53355 1430 aa10.41□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 AGLP35573 1532 aa10.41□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 MAST1Q9Y2H9 1570 aa10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.5 ms