RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 PTPRMP28827 1452 aa29.89■■■□□ 2.38
CTIF-206ENST00000588345 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.88■■■□□ 2.37
CTIF-206ENST00000588345 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.87■■■□□ 2.37
CTIF-206ENST00000588345 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.86■■■□□ 2.37
CTIF-206ENST00000588345 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.86■■■□□ 2.37
CTIF-206ENST00000588345 MADDQ8WXG6 1647 aa29.85■■■□□ 2.37
CTIF-206ENST00000588345 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CTIF-206ENST00000588345 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.85■■■□□ 2.37
CTIF-206ENST00000588345 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.8■■■□□ 2.36
CTIF-206ENST00000588345 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.79■■■□□ 2.36
CTIF-206ENST00000588345 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.78■■■□□ 2.36
CTIF-206ENST00000588345 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.76■■■□□ 2.36
CTIF-206ENST00000588345 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.74■■■□□ 2.35
CTIF-206ENST00000588345 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CTIF-206ENST00000588345 PREX2Q70Z35 1606 aa29.73■■■□□ 2.35
CTIF-206ENST00000588345 KDM5CP41229 1560 aa29.73■■■□□ 2.35
CTIF-206ENST00000588345 ATP10AO60312 1499 aa29.71■■■□□ 2.35
CTIF-206ENST00000588345 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.68■■■□□ 2.34
CTIF-206ENST00000588345 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.65■■■□□ 2.34
CTIF-206ENST00000588345 AFAP1Q8N556 730 aa29.64■■■□□ 2.34
CTIF-206ENST00000588345 ABCC1P33527 1531 aa29.64■■■□□ 2.34
CTIF-206ENST00000588345 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.61■■■□□ 2.33
CTIF-206ENST00000588345 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.61■■■□□ 2.33
CTIF-206ENST00000588345 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.6■■■□□ 2.33
CTIF-206ENST00000588345 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.6■■■□□ 2.33
CTIF-206ENST00000588345 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.6■■■□□ 2.33
CTIF-206ENST00000588345 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.59■■■□□ 2.33
CTIF-206ENST00000588345 REREQ9P2R6 1566 aa29.58■■■□□ 2.33
CTIF-206ENST00000588345 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.57■■■□□ 2.32
CTIF-206ENST00000588345 MLECQ14165 292 aa29.57■■■□□ 2.32
CTIF-206ENST00000588345 ABCA6Q8N139 1617 aa29.54■■■□□ 2.32
CTIF-206ENST00000588345 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
CTIF-206ENST00000588345 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CTIF-206ENST00000588345 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.5■■■□□ 2.31
CTIF-206ENST00000588345 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.49■■■□□ 2.31
CTIF-206ENST00000588345 CEP162Q5TB80 1403 aa29.48■■■□□ 2.31
CTIF-206ENST00000588345 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.48■■■□□ 2.31
CTIF-206ENST00000588345 AGLP35573 1532 aa29.47■■■□□ 2.31
CTIF-206ENST00000588345 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.44■■■□□ 2.3
CTIF-206ENST00000588345 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.44■■■□□ 2.3
CTIF-206ENST00000588345 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.43■■■□□ 2.3
CTIF-206ENST00000588345 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
CTIF-206ENST00000588345 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.42■■■□□ 2.3
CTIF-206ENST00000588345 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.41■■■□□ 2.3
CTIF-206ENST00000588345 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.4■■■□□ 2.3
CTIF-206ENST00000588345 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.4■■■□□ 2.3
CTIF-206ENST00000588345 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
CTIF-206ENST00000588345 HSPA2P54652 639 aa29.36■■■□□ 2.29
CTIF-206ENST00000588345 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.36■■■□□ 2.29
CTIF-206ENST00000588345 TIAM1Q13009 1591 aa29.35■■■□□ 2.29
CTIF-206ENST00000588345 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.35■■■□□ 2.293e-6■■■■□ 19.4
CTIF-206ENST00000588345 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
CTIF-206ENST00000588345 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CTIF-206ENST00000588345 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
CTIF-206ENST00000588345 ATP7AQ04656 1500 aa29.31■■■□□ 2.28
CTIF-206ENST00000588345 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
CTIF-206ENST00000588345 C3P01024 1663 aa29.29■■■□□ 2.28
CTIF-206ENST00000588345 PLXNC1O60486 1568 aa29.26■■■□□ 2.27
CTIF-206ENST00000588345 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.25■■■□□ 2.27
CTIF-206ENST00000588345 MBD5Q9P267 1494 aa29.23■■■□□ 2.27
CTIF-206ENST00000588345 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CTIF-206ENST00000588345 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CTIF-206ENST00000588345 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CTIF-206ENST00000588345 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.21■■■□□ 2.27
CTIF-206ENST00000588345 A2MP01023 1474 aa29.21■■■□□ 2.27
CTIF-206ENST00000588345 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.2■■■□□ 2.26
CTIF-206ENST00000588345 FBXO41Q8TF61 875 aa29.2■■■□□ 2.26
CTIF-206ENST00000588345 NCOA2Q15596 1464 aa29.2■■■□□ 2.26
CTIF-206ENST00000588345 MROH2AA6NES4 1674 aa29.2■■■□□ 2.26
CTIF-206ENST00000588345 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.2■■■□□ 2.26
CTIF-206ENST00000588345 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.18■■■□□ 2.26
CTIF-206ENST00000588345 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.16■■■□□ 2.26
CTIF-206ENST00000588345 STRCQ7RTU9 1775 aa29.13■■■□□ 2.25
CTIF-206ENST00000588345 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.11■■■□□ 2.25
CTIF-206ENST00000588345 NPATQ14207 1427 aa29.1■■■□□ 2.25
CTIF-206ENST00000588345 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.1■■■□□ 2.25
CTIF-206ENST00000588345 ZMYM3Q14202 1370 aa29.09■■■□□ 2.25
CTIF-206ENST00000588345 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.09■■■□□ 2.25
CTIF-206ENST00000588345 MAP3K1Q13233 1512 aa29.09■■■□□ 2.25
CTIF-206ENST00000588345 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CTIF-206ENST00000588345 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.07■■■□□ 2.24
CTIF-206ENST00000588345 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.05■■■□□ 2.24
CTIF-206ENST00000588345 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CTIF-206ENST00000588345 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.04■■■□□ 2.24
CTIF-206ENST00000588345 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.04■■■□□ 2.24
CTIF-206ENST00000588345 GGT6Q6P531 493 aa29.02■■■□□ 2.24
CTIF-206ENST00000588345 PTPRTO14522 1441 aa28.98■■■□□ 2.23
CTIF-206ENST00000588345 PTPRKQ15262 1439 aa28.98■■■□□ 2.23
CTIF-206ENST00000588345 CERKQ8TCT0 537 aa28.98■■■□□ 2.23
CTIF-206ENST00000588345 NCOA1Q15788 1441 aa28.96■■■□□ 2.23
CTIF-206ENST00000588345 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
CTIF-206ENST00000588345 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CTIF-206ENST00000588345 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.94■■■□□ 2.22
CTIF-206ENST00000588345 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.93■■■□□ 2.22
CTIF-206ENST00000588345 MIA2Q96PC5 1412 aa28.91■■■□□ 2.22
CTIF-206ENST00000588345 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.91■■■□□ 2.22
CTIF-206ENST00000588345 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.91■■■□□ 2.22
CTIF-206ENST00000588345 TSPY4P0CV99 314 aa28.9■■■□□ 2.22
CTIF-206ENST00000588345 TSPY10P0CW01 314 aa28.9■■■□□ 2.22
CTIF-206ENST00000588345 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.9■■■□□ 2.22
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