RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587275.1

U2AF2-204, Transcript of U2 small nuclear RNA auxiliary factor 2, human

TSL 4

Gene U2AF2, Length 554 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
U2AF2-204	ENST00000587275	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.3	■■■□□ 2.92
U2AF2-204	ENST00000587275	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
U2AF2-204	ENST00000587275	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
U2AF2-204	ENST00000587275	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		33.28	■■■□□ 2.92
U2AF2-204	ENST00000587275	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
U2AF2-204	ENST00000587275	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
U2AF2-204	ENST00000587275	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.25	■■■□□ 2.91
U2AF2-204	ENST00000587275	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.24	■■■□□ 2.91
U2AF2-204	ENST00000587275	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.2	■■■□□ 2.91
U2AF2-204	ENST00000587275	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.2	■■■□□ 2.9
U2AF2-204	ENST00000587275	KDM5C	P41229	1560 aa		33.18	■■■□□ 2.9
U2AF2-204	ENST00000587275	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.18	■■■□□ 2.9
U2AF2-204	ENST00000587275	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.17	■■■□□ 2.9
U2AF2-204	ENST00000587275	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.16	■■■□□ 2.9
U2AF2-204	ENST00000587275	CLIP1	P30622	1438 aa		33.11	■■■□□ 2.89
U2AF2-204	ENST00000587275	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.11	■■■□□ 2.89
U2AF2-204	ENST00000587275	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
U2AF2-204	ENST00000587275	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.11	■■■□□ 2.89
U2AF2-204	ENST00000587275	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		33.1	■■■□□ 2.89
U2AF2-204	ENST00000587275	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.09	■■■□□ 2.89
U2AF2-204	ENST00000587275	ATP10A	O60312	1499 aa		33.09	■■■□□ 2.89
U2AF2-204	ENST00000587275	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.09	■■■□□ 2.89
U2AF2-204	ENST00000587275	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.08	■■■□□ 2.89
U2AF2-204	ENST00000587275	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.08	■■■□□ 2.89
U2AF2-204	ENST00000587275	ABCC1	P33527	1531 aa		33.07	■■■□□ 2.89
U2AF2-204	ENST00000587275	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.07	■■■□□ 2.88
U2AF2-204	ENST00000587275	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.06	■■■□□ 2.88
U2AF2-204	ENST00000587275	MLEC	Q14165	292 aa		33.01	■■■□□ 2.87
U2AF2-204	ENST00000587275	AFAP1	Q8N556	730 aa		33	■■■□□ 2.87
U2AF2-204	ENST00000587275	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.98	■■■□□ 2.87
U2AF2-204	ENST00000587275	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.98	■■■□□ 2.87
U2AF2-204	ENST00000587275	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.96	■■■□□ 2.87
U2AF2-204	ENST00000587275	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.95	■■■□□ 2.87
U2AF2-204	ENST00000587275	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.95	■■■□□ 2.86
U2AF2-204	ENST00000587275	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.94	■■■□□ 2.86
U2AF2-204	ENST00000587275	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.93	■■■□□ 2.86
U2AF2-204	ENST00000587275	HSPA2	P54652	639 aa		32.9	■■■□□ 2.86
U2AF2-204	ENST00000587275	C3	P01024	1663 aa		32.87	■■■□□ 2.85
U2AF2-204	ENST00000587275	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.84	■■■□□ 2.85
U2AF2-204	ENST00000587275	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
U2AF2-204	ENST00000587275	AGL	P35573	1532 aa		32.82	■■■□□ 2.85
U2AF2-204	ENST00000587275	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
U2AF2-204	ENST00000587275	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.78	■■■□□ 2.84
U2AF2-204	ENST00000587275	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
U2AF2-204	ENST00000587275	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
U2AF2-204	ENST00000587275	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.73	■■■□□ 2.83
U2AF2-204	ENST00000587275	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.73	■■■□□ 2.83
U2AF2-204	ENST00000587275	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
U2AF2-204	ENST00000587275	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.7	■■■□□ 2.83
U2AF2-204	ENST00000587275	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.68	■■■□□ 2.82
U2AF2-204	ENST00000587275	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
U2AF2-204	ENST00000587275	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.66	■■■□□ 2.82
U2AF2-204	ENST00000587275	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.66	■■■□□ 2.82
U2AF2-204	ENST00000587275	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.65	■■■□□ 2.82
U2AF2-204	ENST00000587275	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.64	■■■□□ 2.82
U2AF2-204	ENST00000587275	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.63	■■■□□ 2.81	5e-9	■■□□□ 13.2
U2AF2-204	ENST00000587275	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.61	■■■□□ 2.81
U2AF2-204	ENST00000587275	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.6	■■■□□ 2.81
U2AF2-204	ENST00000587275	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.6	■■■□□ 2.81
U2AF2-204	ENST00000587275	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.59	■■■□□ 2.81
U2AF2-204	ENST00000587275	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
U2AF2-204	ENST00000587275	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.58	■■■□□ 2.81
U2AF2-204	ENST00000587275	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.57	■■■□□ 2.8
U2AF2-204	ENST00000587275	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
U2AF2-204	ENST00000587275	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
U2AF2-204	ENST00000587275	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
U2AF2-204	ENST00000587275	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.52	■■■□□ 2.8
U2AF2-204	ENST00000587275	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.51	■■■□□ 2.79
U2AF2-204	ENST00000587275	A2M	P01023	1474 aa		32.5	■■■□□ 2.79
U2AF2-204	ENST00000587275	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.44	■■■□□ 2.78
U2AF2-204	ENST00000587275	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
U2AF2-204	ENST00000587275	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.43	■■■□□ 2.78
U2AF2-204	ENST00000587275	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.42	■■■□□ 2.78
U2AF2-204	ENST00000587275	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
U2AF2-204	ENST00000587275	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.39	■■■□□ 2.78
U2AF2-204	ENST00000587275	NPAT	Q14207	1427 aa		32.39	■■■□□ 2.78
U2AF2-204	ENST00000587275	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.39	■■■□□ 2.78
U2AF2-204	ENST00000587275	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.36	■■■□□ 2.77
U2AF2-204	ENST00000587275	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.36	■■■□□ 2.77
U2AF2-204	ENST00000587275	PTPRT	O14522	1441 aa		32.34	■■■□□ 2.77
U2AF2-204	ENST00000587275	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.33	■■■□□ 2.77
U2AF2-204	ENST00000587275	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.33	■■■□□ 2.77
U2AF2-204	ENST00000587275	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.31	■■■□□ 2.76
U2AF2-204	ENST00000587275	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.31	■■■□□ 2.76
U2AF2-204	ENST00000587275	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
U2AF2-204	ENST00000587275	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.29	■■■□□ 2.76
U2AF2-204	ENST00000587275	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.29	■■■□□ 2.76
U2AF2-204	ENST00000587275	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.29	■■■□□ 2.76
U2AF2-204	ENST00000587275	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.27	■■■□□ 2.76
U2AF2-204	ENST00000587275	GGT6	Q6P531	493 aa		32.26	■■■□□ 2.75
U2AF2-204	ENST00000587275	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.26	■■■□□ 2.75
U2AF2-204	ENST00000587275	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
U2AF2-204	ENST00000587275	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
U2AF2-204	ENST00000587275	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		32.16	■■■□□ 2.74
U2AF2-204	ENST00000587275	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.16	■■■□□ 2.74
U2AF2-204	ENST00000587275	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
U2AF2-204	ENST00000587275	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.15	■■■□□ 2.74
U2AF2-204	ENST00000587275	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.15	■■■□□ 2.74
U2AF2-204	ENST00000587275	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
U2AF2-204	ENST00000587275	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73

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