RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585956.5

PTBP1-208, Transcript of polypyrimidine tract binding protein 1, human

TSL 3

Gene PTBP1, Length 767 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTBP1-208	ENST00000585956	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PTBP1-208	ENST00000585956	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PTBP1-208	ENST00000585956	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
PTBP1-208	ENST00000585956	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.51	■■■□□ 2.8
PTBP1-208	ENST00000585956	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PTBP1-208	ENST00000585956	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PTBP1-208	ENST00000585956	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PTBP1-208	ENST00000585956	MLEC	Q14165	292 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PTBP1-208	ENST00000585956	HSPA2	P54652	639 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PTBP1-208	ENST00000585956	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PTBP1-208	ENST00000585956	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
PTBP1-208	ENST00000585956	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PTBP1-208	ENST00000585956	ATP10A	O60312	1499 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PTBP1-208	ENST00000585956	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PTBP1-208	ENST00000585956	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PTBP1-208	ENST00000585956	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PTBP1-208	ENST00000585956	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PTBP1-208	ENST00000585956	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PTBP1-208	ENST00000585956	KDM5C	P41229	1560 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PTBP1-208	ENST00000585956	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PTBP1-208	ENST00000585956	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
PTBP1-208	ENST00000585956	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PTBP1-208	ENST00000585956	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PTBP1-208	ENST00000585956	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
PTBP1-208	ENST00000585956	CLIP1	P30622	1438 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PTBP1-208	ENST00000585956	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PTBP1-208	ENST00000585956	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PTBP1-208	ENST00000585956	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PTBP1-208	ENST00000585956	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PTBP1-208	ENST00000585956	ABCC1	P33527	1531 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PTBP1-208	ENST00000585956	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PTBP1-208	ENST00000585956	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PTBP1-208	ENST00000585956	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PTBP1-208	ENST00000585956	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PTBP1-208	ENST00000585956	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PTBP1-208	ENST00000585956	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PTBP1-208	ENST00000585956	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PTBP1-208	ENST00000585956	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PTBP1-208	ENST00000585956	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PTBP1-208	ENST00000585956	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PTBP1-208	ENST00000585956	C3	P01024	1663 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PTBP1-208	ENST00000585956	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PTBP1-208	ENST00000585956	AGL	P35573	1532 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PTBP1-208	ENST00000585956	CERK	Q8TCT0	537 aa		32	■■■□□ 2.71
PTBP1-208	ENST00000585956	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
PTBP1-208	ENST00000585956	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PTBP1-208	ENST00000585956	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
PTBP1-208	ENST00000585956	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PTBP1-208	ENST00000585956	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
PTBP1-208	ENST00000585956	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.91	■■■□□ 2.7	4e-7	■■■□□ 15
PTBP1-208	ENST00000585956	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
PTBP1-208	ENST00000585956	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
PTBP1-208	ENST00000585956	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PTBP1-208	ENST00000585956	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PTBP1-208	ENST00000585956	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
PTBP1-208	ENST00000585956	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
PTBP1-208	ENST00000585956	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PTBP1-208	ENST00000585956	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PTBP1-208	ENST00000585956	MROH2A	A6NES4	1674 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PTBP1-208	ENST00000585956	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PTBP1-208	ENST00000585956	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PTBP1-208	ENST00000585956	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.76	■■■□□ 2.68
PTBP1-208	ENST00000585956	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
PTBP1-208	ENST00000585956	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
PTBP1-208	ENST00000585956	PTPRT	O14522	1441 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PTBP1-208	ENST00000585956	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PTBP1-208	ENST00000585956	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PTBP1-208	ENST00000585956	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PTBP1-208	ENST00000585956	A2M	P01023	1474 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PTBP1-208	ENST00000585956	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PTBP1-208	ENST00000585956	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PTBP1-208	ENST00000585956	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.7	■■■□□ 2.66
PTBP1-208	ENST00000585956	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PTBP1-208	ENST00000585956	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PTBP1-208	ENST00000585956	NPAT	Q14207	1427 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PTBP1-208	ENST00000585956	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PTBP1-208	ENST00000585956	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.64	■■■□□ 2.65
PTBP1-208	ENST00000585956	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PTBP1-208	ENST00000585956	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PTBP1-208	ENST00000585956	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PTBP1-208	ENST00000585956	GGT6	Q6P531	493 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PTBP1-208	ENST00000585956	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PTBP1-208	ENST00000585956	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
PTBP1-208	ENST00000585956	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
PTBP1-208	ENST00000585956	NCOA2	Q15596	1464 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PTBP1-208	ENST00000585956	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
PTBP1-208	ENST00000585956	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PTBP1-208	ENST00000585956	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PTBP1-208	ENST00000585956	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
PTBP1-208	ENST00000585956	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
PTBP1-208	ENST00000585956	PLA2R1	Q13018	1463 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PTBP1-208	ENST00000585956	ILDR2	Q71H61	639 aa		31.45	■■■□□ 2.63
PTBP1-208	ENST00000585956	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.45	■■■□□ 2.62
PTBP1-208	ENST00000585956	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
PTBP1-208	ENST00000585956	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
PTBP1-208	ENST00000585956	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PTBP1-208	ENST00000585956	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PTBP1-208	ENST00000585956	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PTBP1-208	ENST00000585956	KIF3B	O15066	747 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PTBP1-208	ENST00000585956	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.38	■■■□□ 2.61

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