RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585084.5

GPS1-225, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-225	ENST00000585084	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		46.23	■■■■■ 4.99
GPS1-225	ENST00000585084	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		46.2	■■■■■ 4.99
GPS1-225	ENST00000585084	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		46.19	■■■■■ 4.98
GPS1-225	ENST00000585084	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		46.19	■■■■■ 4.98
GPS1-225	ENST00000585084	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		46.18	■■■■■ 4.98
GPS1-225	ENST00000585084	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		46.14	■■■■■ 4.98
GPS1-225	ENST00000585084	PTPRM	P28827	1452 aa		46.14	■■■■■ 4.98
GPS1-225	ENST00000585084	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		46.13	■■■■■ 4.98
GPS1-225	ENST00000585084	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		46.13	■■■■■ 4.98
GPS1-225	ENST00000585084	MADD	Q8WXG6	1647 aa		46.06	■■■■■ 4.96
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		46	■■■■■ 4.95
GPS1-225	ENST00000585084	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		45.97	■■■■■ 4.95
GPS1-225	ENST00000585084	ATP10A	O60312	1499 aa		45.94	■■■■■ 4.95
GPS1-225	ENST00000585084	AFAP1	Q8N556	730 aa		45.94	■■■■■ 4.94
GPS1-225	ENST00000585084	PREX2	Q70Z35	1606 aa		45.94	■■■■■ 4.94
GPS1-225	ENST00000585084	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	45.92	■■■■■ 4.94
GPS1-225	ENST00000585084	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		45.91	■■■■■ 4.94
GPS1-225	ENST00000585084	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		45.91	■■■■■ 4.94
GPS1-225	ENST00000585084	MLEC	Q14165	292 aa		45.9	■■■■■ 4.94
GPS1-225	ENST00000585084	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		45.88	■■■■■ 4.94
GPS1-225	ENST00000585084	KDM5C	P41229	1560 aa		45.87	■■■■■ 4.93
GPS1-225	ENST00000585084	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		45.81	■■■■■ 4.92
GPS1-225	ENST00000585084	ABCC1	P33527	1531 aa		45.8	■■■■■ 4.92
GPS1-225	ENST00000585084	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		45.77	■■■■■ 4.92
GPS1-225	ENST00000585084	CEP162	Q5TB80	1403 aa		45.77	■■■■■ 4.92
GPS1-225	ENST00000585084	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		45.75	■■■■■ 4.91
GPS1-225	ENST00000585084	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		45.75	■■■■■ 4.91
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	45.74	■■■■■ 4.91
GPS1-225	ENST00000585084	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		45.73	■■■■■ 4.91
GPS1-225	ENST00000585084	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		45.72	■■■■■ 4.91
GPS1-225	ENST00000585084	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		45.72	■■■■■ 4.91
GPS1-225	ENST00000585084	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		45.72	■■■■■ 4.91
GPS1-225	ENST00000585084	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	45.7	■■■■■ 4.91
GPS1-225	ENST00000585084	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		45.68	■■■■■ 4.9
GPS1-225	ENST00000585084	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		45.64	■■■■■ 4.9
GPS1-225	ENST00000585084	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		45.64	■■■■■ 4.9
GPS1-225	ENST00000585084	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	45.62	■■■■■ 4.89
GPS1-225	ENST00000585084	ABCA6	Q8N139	1617 aa		45.62	■■■■■ 4.89
GPS1-225	ENST00000585084	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		45.6	■■■■■ 4.89
GPS1-225	ENST00000585084	RERE	Q9P2R6	1566 aa		45.6	■■■■■ 4.89
GPS1-225	ENST00000585084	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	45.55	■■■■■ 4.88
GPS1-225	ENST00000585084	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		45.55	■■■■■ 4.88
GPS1-225	ENST00000585084	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	45.54	■■■■■ 4.88
GPS1-225	ENST00000585084	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		45.52	■■■■■ 4.88
GPS1-225	ENST00000585084	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		45.52	■■■■■ 4.88
GPS1-225	ENST00000585084	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		45.52	■■■■■ 4.88
GPS1-225	ENST00000585084	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		45.49	■■■■■ 4.87
GPS1-225	ENST00000585084	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	45.49	■■■■■ 4.87
GPS1-225	ENST00000585084	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		45.48	■■■■■ 4.87
GPS1-225	ENST00000585084	AGL	P35573	1532 aa		45.47	■■■■■ 4.87
GPS1-225	ENST00000585084	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	45.45	■■■■■ 4.87
GPS1-225	ENST00000585084	HSPA2	P54652	639 aa		45.45	■■■■■ 4.87
GPS1-225	ENST00000585084	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	45.42	■■■■■ 4.86
GPS1-225	ENST00000585084	TIAM1	Q13009	1591 aa		45.41	■■■■■ 4.86
GPS1-225	ENST00000585084	ATP7A	Q04656	1500 aa		45.33	■■■■■ 4.85
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	45.31	■■■■■ 4.84
GPS1-225	ENST00000585084	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		45.29	■■■■■ 4.84
GPS1-225	ENST00000585084	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		45.27	■■■■■ 4.84
GPS1-225	ENST00000585084	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	45.27	■■■■■ 4.84
GPS1-225	ENST00000585084	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	45.26	■■■■■ 4.84
GPS1-225	ENST00000585084	NCOA2	Q15596	1464 aa		45.25	■■■■■ 4.83
GPS1-225	ENST00000585084	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		45.23	■■■■■ 4.83
GPS1-225	ENST00000585084	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	45.22	■■■■■ 4.83
GPS1-225	ENST00000585084	C3	P01024	1663 aa		45.21	■■■■■ 4.83
GPS1-225	ENST00000585084	A2M	P01023	1474 aa		45.2	■■■■■ 4.83
GPS1-225	ENST00000585084	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		45.19	■■■■■ 4.83
GPS1-225	ENST00000585084	MBD5	Q9P267	1494 aa		45.19	■■■■■ 4.82
GPS1-225	ENST00000585084	PLXNC1	O60486	1568 aa		45.13	■■■■■ 4.82
GPS1-225	ENST00000585084	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		45.09	■■■■■ 4.81
GPS1-225	ENST00000585084	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		45.09	■■■■■ 4.81
GPS1-225	ENST00000585084	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		45.09	■■■■■ 4.81
GPS1-225	ENST00000585084	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		45.08	■■■■■ 4.81
GPS1-225	ENST00000585084	FBXO41	Q8TF61	875 aa		45.07	■■■■■ 4.81
GPS1-225	ENST00000585084	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		45.06	■■■■■ 4.8
GPS1-225	ENST00000585084	GGT6	Q6P531	493 aa		45.05	■■■■■ 4.8
GPS1-225	ENST00000585084	MROH2A	A6NES4	1674 aa		45.04	■■■■■ 4.8
GPS1-225	ENST00000585084	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		45.04	■■■■■ 4.8
GPS1-225	ENST00000585084	ZMYM3	Q14202	1370 aa		45.03	■■■■■ 4.8
GPS1-225	ENST00000585084	MAP3K1	Q13233	1512 aa		45	■■■■■ 4.79
GPS1-225	ENST00000585084	NPAT	Q14207	1427 aa		44.96	■■■■■ 4.79
GPS1-225	ENST00000585084	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		44.96	■■■■■ 4.79
GPS1-225	ENST00000585084	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		44.96	■■■■■ 4.79
GPS1-225	ENST00000585084	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	44.96	■■■■■ 4.79
GPS1-225	ENST00000585084	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	44.95	■■■■■ 4.79
GPS1-225	ENST00000585084	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	44.95	■■■■■ 4.79
GPS1-225	ENST00000585084	TSPY4	P0CV99	314 aa		44.9	■■■■■ 4.78
GPS1-225	ENST00000585084	TSPY10	P0CW01	314 aa		44.9	■■■■■ 4.78
GPS1-225	ENST00000585084	STRC	Q7RTU9	1775 aa		44.89	■■■■■ 4.78
GPS1-225	ENST00000585084	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		44.89	■■■■■ 4.78
GPS1-225	ENST00000585084	APLP2	Q06481	763 aa		44.86	■■■■■ 4.77
GPS1-225	ENST00000585084	KIF3B	O15066	747 aa		44.83	■■■■■ 4.77
GPS1-225	ENST00000585084	CERK	Q8TCT0	537 aa		44.8	■■■■■ 4.76
GPS1-225	ENST00000585084	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		44.79	■■■■■ 4.76
GPS1-225	ENST00000585084	PTPRK	Q15262	1439 aa		44.77	■■■■■ 4.76
GPS1-225	ENST00000585084	MIA2	Q96PC5	1412 aa		44.77	■■■■■ 4.76
GPS1-225	ENST00000585084	PTPRT	O14522	1441 aa		44.73	■■■■■ 4.75
GPS1-225	ENST00000585084	NCOA1	Q15788	1441 aa		44.71	■■■■■ 4.75
GPS1-225	ENST00000585084	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		44.67	■■■■■ 4.74
GPS1-225	ENST00000585084	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		44.67	■■■■■ 4.74
GPS1-225	ENST00000585084	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		44.65	■■■■■ 4.74

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