RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584015.5

EPB41L3-231, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1 like 3, human

TSL 3

Gene EPB41L3, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EPB41L3-231	ENST00000584015	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		45.99	■■■■■ 4.95
EPB41L3-231	ENST00000584015	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		45.98	■■■■■ 4.95
EPB41L3-231	ENST00000584015	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		45.98	■■■■■ 4.95
EPB41L3-231	ENST00000584015	PTPRM	P28827	1452 aa		45.98	■■■■■ 4.95
EPB41L3-231	ENST00000584015	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		45.97	■■■■■ 4.95
EPB41L3-231	ENST00000584015	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		45.95	■■■■■ 4.95
EPB41L3-231	ENST00000584015	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		45.92	■■■■■ 4.94
EPB41L3-231	ENST00000584015	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		45.91	■■■■■ 4.94
EPB41L3-231	ENST00000584015	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		45.9	■■■■■ 4.94
EPB41L3-231	ENST00000584015	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		45.89	■■■■■ 4.94
EPB41L3-231	ENST00000584015	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	45.88	■■■■■ 4.94
EPB41L3-231	ENST00000584015	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		45.88	■■■■■ 4.94
EPB41L3-231	ENST00000584015	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		45.86	■■■■■ 4.93
EPB41L3-231	ENST00000584015	PREX2	Q70Z35	1606 aa		45.83	■■■■■ 4.93
EPB41L3-231	ENST00000584015	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		45.78	■■■■■ 4.92
EPB41L3-231	ENST00000584015	KDM5C	P41229	1560 aa		45.73	■■■■■ 4.91
EPB41L3-231	ENST00000584015	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		45.72	■■■■■ 4.91
EPB41L3-231	ENST00000584015	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		45.72	■■■■■ 4.91
EPB41L3-231	ENST00000584015	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		45.68	■■■■■ 4.9
EPB41L3-231	ENST00000584015	ATP10A	O60312	1499 aa		45.68	■■■■■ 4.9
EPB41L3-231	ENST00000584015	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		45.65	■■■■■ 4.9
EPB41L3-231	ENST00000584015	ABCC1	P33527	1531 aa		45.64	■■■■■ 4.9
EPB41L3-231	ENST00000584015	MLEC	Q14165	292 aa		45.56	■■■■■ 4.88
EPB41L3-231	ENST00000584015	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		45.56	■■■■■ 4.88
EPB41L3-231	ENST00000584015	AFAP1	Q8N556	730 aa		45.55	■■■■■ 4.88
EPB41L3-231	ENST00000584015	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		45.53	■■■■■ 4.88
EPB41L3-231	ENST00000584015	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		45.53	■■■■■ 4.88
EPB41L3-231	ENST00000584015	ABCA6	Q8N139	1617 aa		45.52	■■■■■ 4.88
EPB41L3-231	ENST00000584015	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		45.5	■■■■■ 4.87
EPB41L3-231	ENST00000584015	RERE	Q9P2R6	1566 aa		45.48	■■■■■ 4.87
EPB41L3-231	ENST00000584015	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		45.48	■■■■■ 4.87
EPB41L3-231	ENST00000584015	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		45.46	■■■■■ 4.87
EPB41L3-231	ENST00000584015	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		45.45	■■■■■ 4.87
EPB41L3-231	ENST00000584015	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		45.44	■■■■■ 4.86
EPB41L3-231	ENST00000584015	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	45.4	■■■■■ 4.86
EPB41L3-231	ENST00000584015	CEP162	Q5TB80	1403 aa		45.4	■■■■■ 4.86
EPB41L3-231	ENST00000584015	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		45.4	■■■■■ 4.86
EPB41L3-231	ENST00000584015	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	45.39	■■■■■ 4.86
EPB41L3-231	ENST00000584015	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		45.36	■■■■■ 4.85
EPB41L3-231	ENST00000584015	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		45.35	■■■■■ 4.85
EPB41L3-231	ENST00000584015	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	45.32	■■■■■ 4.85
EPB41L3-231	ENST00000584015	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		45.31	■■■■■ 4.84
EPB41L3-231	ENST00000584015	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		45.28	■■■■■ 4.84
EPB41L3-231	ENST00000584015	AGL	P35573	1532 aa		45.28	■■■■■ 4.84
EPB41L3-231	ENST00000584015	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		45.28	■■■■■ 4.84
EPB41L3-231	ENST00000584015	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		45.23	■■■■■ 4.83
EPB41L3-231	ENST00000584015	TIAM1	Q13009	1591 aa		45.22	■■■■■ 4.83
EPB41L3-231	ENST00000584015	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	45.2	■■■■■ 4.83
EPB41L3-231	ENST00000584015	HSPA2	P54652	639 aa		45.18	■■■■■ 4.82
EPB41L3-231	ENST00000584015	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		45.18	■■■■■ 4.82
EPB41L3-231	ENST00000584015	ATP7A	Q04656	1500 aa		45.16	■■■■■ 4.82
EPB41L3-231	ENST00000584015	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	45.16	■■■■■ 4.82
EPB41L3-231	ENST00000584015	C3	P01024	1663 aa		45.15	■■■■■ 4.82
EPB41L3-231	ENST00000584015	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	45.13	■■■■■ 4.82
EPB41L3-231	ENST00000584015	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	45.12	■■■■■ 4.81
EPB41L3-231	ENST00000584015	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	45.12	■■■■■ 4.81
EPB41L3-231	ENST00000584015	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	45.1	■■■■■ 4.81
EPB41L3-231	ENST00000584015	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	45.08	■■■■■ 4.81
EPB41L3-231	ENST00000584015	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	45.05	■■■■■ 4.8
EPB41L3-231	ENST00000584015	PLXNC1	O60486	1568 aa		45.01	■■■■■ 4.8
EPB41L3-231	ENST00000584015	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		45	■■■■■ 4.79
EPB41L3-231	ENST00000584015	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		45	■■■■■ 4.79
EPB41L3-231	ENST00000584015	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		44.99	■■■■■ 4.79
EPB41L3-231	ENST00000584015	MROH2A	A6NES4	1674 aa		44.99	■■■■■ 4.79
EPB41L3-231	ENST00000584015	A2M	P01023	1474 aa		44.94	■■■■■ 4.78
EPB41L3-231	ENST00000584015	NCOA2	Q15596	1464 aa		44.94	■■■■■ 4.78
EPB41L3-231	ENST00000584015	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		44.92	■■■■■ 4.78
EPB41L3-231	ENST00000584015	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	44.92	■■■■■ 4.78
EPB41L3-231	ENST00000584015	MBD5	Q9P267	1494 aa		44.9	■■■■■ 4.78
EPB41L3-231	ENST00000584015	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		44.89	■■■■■ 4.78
EPB41L3-231	ENST00000584015	FBXO41	Q8TF61	875 aa		44.87	■■■■■ 4.77
EPB41L3-231	ENST00000584015	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	44.86	■■■■■ 4.77
EPB41L3-231	ENST00000584015	STRC	Q7RTU9	1775 aa		44.86	■■■■■ 4.77
EPB41L3-231	ENST00000584015	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		44.84	■■■■■ 4.77
EPB41L3-231	ENST00000584015	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		44.79	■■■■■ 4.76
EPB41L3-231	ENST00000584015	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		44.78	■■■■■ 4.76
EPB41L3-231	ENST00000584015	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		44.77	■■■■■ 4.76
EPB41L3-231	ENST00000584015	NPAT	Q14207	1427 aa		44.74	■■■■■ 4.75
EPB41L3-231	ENST00000584015	ZMYM3	Q14202	1370 aa		44.7	■■■■■ 4.75
EPB41L3-231	ENST00000584015	MAP3K1	Q13233	1512 aa		44.68	■■■■■ 4.74
EPB41L3-231	ENST00000584015	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		44.68	■■■■■ 4.74
EPB41L3-231	ENST00000584015	GGT6	Q6P531	493 aa		44.67	■■■■■ 4.74
EPB41L3-231	ENST00000584015	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		44.65	■■■■■ 4.74
EPB41L3-231	ENST00000584015	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		44.63	■■■■■ 4.73
EPB41L3-231	ENST00000584015	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	44.61	■■■■■ 4.73
EPB41L3-231	ENST00000584015	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	44.61	■■■■■ 4.73
EPB41L3-231	ENST00000584015	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		44.61	■■■■■ 4.73
EPB41L3-231	ENST00000584015	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		44.57	■■■■■ 4.73
EPB41L3-231	ENST00000584015	CERK	Q8TCT0	537 aa		44.55	■■■■■ 4.72
EPB41L3-231	ENST00000584015	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		44.53	■■■■■ 4.72
EPB41L3-231	ENST00000584015	PTPRK	Q15262	1439 aa		44.53	■■■■■ 4.72
EPB41L3-231	ENST00000584015	NCOA1	Q15788	1441 aa		44.53	■■■■■ 4.72
EPB41L3-231	ENST00000584015	PTPRT	O14522	1441 aa		44.52	■■■■■ 4.72
EPB41L3-231	ENST00000584015	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	44.5	■■■■■ 4.71
EPB41L3-231	ENST00000584015	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	44.49	■■■■■ 4.71
EPB41L3-231	ENST00000584015	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		44.49	■■■■■ 4.71
EPB41L3-231	ENST00000584015	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		44.48	■■■■■ 4.71
EPB41L3-231	ENST00000584015	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		44.47	■■■■■ 4.71
EPB41L3-231	ENST00000584015	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		44.47	■■■■■ 4.71
EPB41L3-231	ENST00000584015	KIF3B	O15066	747 aa		44.45	■■■■■ 4.71

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