RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581180.1

MKS1-210, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 2

Gene MKS1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-210ENST00000581180 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.54■■□□□ 1.36
MKS1-210ENST00000581180 FANCAO15360 1455 aa23.54■■□□□ 1.36
MKS1-210ENST00000581180 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.53■■□□□ 1.36
MKS1-210ENST00000581180 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.51■■□□□ 1.35
MKS1-210ENST00000581180 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.5■■□□□ 1.35
MKS1-210ENST00000581180 AKNAQ7Z591 1439 aa23.5■■□□□ 1.35
MKS1-210ENST00000581180 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
MKS1-210ENST00000581180 KDM6BO15054 1643 aa23.46■■□□□ 1.35
MKS1-210ENST00000581180 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.46■■□□□ 1.35
MKS1-210ENST00000581180 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
MKS1-210ENST00000581180 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.46■■□□□ 1.35
MKS1-210ENST00000581180 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
MKS1-210ENST00000581180 ADGRL1O94910 1474 aa23.43■■□□□ 1.34
MKS1-210ENST00000581180 ABCC1P33527 1531 aa23.42■■□□□ 1.34
MKS1-210ENST00000581180 MIA2Q96PC5 1412 aa23.41■■□□□ 1.34
MKS1-210ENST00000581180 RICTORQ6R327 1708 aa23.4■■□□□ 1.34
MKS1-210ENST00000581180 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.39■■□□□ 1.33
MKS1-210ENST00000581180 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.38■■□□□ 1.33
MKS1-210ENST00000581180 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
MKS1-210ENST00000581180 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
MKS1-210ENST00000581180 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
MKS1-210ENST00000581180 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.37■■□□□ 1.33
MKS1-210ENST00000581180 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.36■■□□□ 1.33
MKS1-210ENST00000581180 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.36■■□□□ 1.33
MKS1-210ENST00000581180 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.36■■□□□ 1.33
MKS1-210ENST00000581180 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.36■■□□□ 1.33
MKS1-210ENST00000581180 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.35■■□□□ 1.33
MKS1-210ENST00000581180 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.35■■□□□ 1.33
MKS1-210ENST00000581180 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.33■■□□□ 1.33
MKS1-210ENST00000581180 RAPGEF3O95398 923 aa23.33■■□□□ 1.33
MKS1-210ENST00000581180 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
MKS1-210ENST00000581180 MBD5Q9P267 1494 aa23.32■■□□□ 1.32
MKS1-210ENST00000581180 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.31■■□□□ 1.32
MKS1-210ENST00000581180 KDM5CP41229 1560 aa23.3■■□□□ 1.32
MKS1-210ENST00000581180 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
MKS1-210ENST00000581180 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.29■■□□□ 1.32
MKS1-210ENST00000581180 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.28■■□□□ 1.32
MKS1-210ENST00000581180 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.28■■□□□ 1.32
MKS1-210ENST00000581180 AFAP1Q8N556 730 aa23.27■■□□□ 1.32
MKS1-210ENST00000581180 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
MKS1-210ENST00000581180 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.23■■□□□ 1.31
MKS1-210ENST00000581180 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.22■■□□□ 1.31
MKS1-210ENST00000581180 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.21■■□□□ 1.31
MKS1-210ENST00000581180 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.21■■□□□ 1.31
MKS1-210ENST00000581180 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
MKS1-210ENST00000581180 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.21■■□□□ 1.31
MKS1-210ENST00000581180 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.2■■□□□ 1.3
MKS1-210ENST00000581180 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.19■■□□□ 1.3
MKS1-210ENST00000581180 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
MKS1-210ENST00000581180 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
MKS1-210ENST00000581180 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
MKS1-210ENST00000581180 ABCC5O15440 1437 aa23.16■■□□□ 1.3
MKS1-210ENST00000581180 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.16■■□□□ 1.3
MKS1-210ENST00000581180 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.16■■□□□ 1.3
MKS1-210ENST00000581180 DAPK1P53355 1430 aa23.16■■□□□ 1.3
MKS1-210ENST00000581180 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.16■■□□□ 1.3
MKS1-210ENST00000581180 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.15■■□□□ 1.3
MKS1-210ENST00000581180 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
MKS1-210ENST00000581180 ATP7AQ04656 1500 aa23.15■■□□□ 1.3
MKS1-210ENST00000581180 ABCA6Q8N139 1617 aa23.14■■□□□ 1.29
MKS1-210ENST00000581180 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.14■■□□□ 1.29
MKS1-210ENST00000581180 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.12■■□□□ 1.29
MKS1-210ENST00000581180 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.12■■□□□ 1.29
MKS1-210ENST00000581180 TSPY4P0CV99 314 aa23.1■■□□□ 1.29
MKS1-210ENST00000581180 TSPY10P0CW01 314 aa23.1■■□□□ 1.29
MKS1-210ENST00000581180 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.09■■□□□ 1.29
MKS1-210ENST00000581180 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.07■■□□□ 1.28
MKS1-210ENST00000581180 ATP10AO60312 1499 aa23.07■■□□□ 1.28
MKS1-210ENST00000581180 PTPRKQ15262 1439 aa23.07■■□□□ 1.28
MKS1-210ENST00000581180 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.06■■□□□ 1.28
MKS1-210ENST00000581180 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.06■■□□□ 1.28
MKS1-210ENST00000581180 PLXNC1O60486 1568 aa23.06■■□□□ 1.28
MKS1-210ENST00000581180 REREQ9P2R6 1566 aa23.06■■□□□ 1.28
MKS1-210ENST00000581180 ADGRL2O95490 1459 aa23.03■■□□□ 1.28
MKS1-210ENST00000581180 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23■■□□□ 1.27
MKS1-210ENST00000581180 A2MP01023 1474 aa22.99■■□□□ 1.27
MKS1-210ENST00000581180 NCOA1Q15788 1441 aa22.99■■□□□ 1.27
MKS1-210ENST00000581180 ITGAEP38570 1179 aa22.97■■□□□ 1.27
MKS1-210ENST00000581180 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.97■■□□□ 1.27
MKS1-210ENST00000581180 AGLP35573 1532 aa22.97■■□□□ 1.27
MKS1-210ENST00000581180 ROCK1Q13464 1354 aa22.96■■□□□ 1.27
MKS1-210ENST00000581180 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
MKS1-210ENST00000581180 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.94■■□□□ 1.26
MKS1-210ENST00000581180 KIF15Q9NS87 1388 aa22.94■■□□□ 1.26
MKS1-210ENST00000581180 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.93■■□□□ 1.26
MKS1-210ENST00000581180 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.92■■□□□ 1.26
MKS1-210ENST00000581180 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
MKS1-210ENST00000581180 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
MKS1-210ENST00000581180 ERBINQ96RT1 1412 aa22.87■■□□□ 1.25
MKS1-210ENST00000581180 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.86■■□□□ 1.25
MKS1-210ENST00000581180 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.86■■□□□ 1.25
MKS1-210ENST00000581180 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.83■■□□□ 1.25
MKS1-210ENST00000581180 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
MKS1-210ENST00000581180 NAIPQ13075 1403 aa22.82■■□□□ 1.24
MKS1-210ENST00000581180 HFM1A2PYH4 1435 aa22.82■■□□□ 1.24
MKS1-210ENST00000581180 KIF3BO15066 747 aa22.81■■□□□ 1.24
MKS1-210ENST00000581180 DEPDC5O75140 1603 aa22.8■■□□□ 1.24
MKS1-210ENST00000581180 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.79■■□□□ 1.24
MKS1-210ENST00000581180 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.79■■□□□ 1.24
MKS1-210ENST00000581180 MLECQ14165 292 aa22.79■■□□□ 1.24
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